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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9183#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 736 fasta sequence
[ATGAAGTGGTCCCGTCTGATGTACGTNTATCTCGTNTAGTACAATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT-GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTTTCGTCTTTCCCCCTCTGCCCATTACCAATATGTTTAATTTTATTGTTACAATATTAAAAATACAAATGAAATGCTTGTTGTATATTATTTGGAATTAAAATGCTTACTGCTTATCCCTGGAATACATATCGCTTAGTACACTTAAATAACCTCGGGCTTTTGAATTGGGTCTGC]
[-] EMBL CD148284 [ATGAAGTGGTCCCGTCTGATGTACGTNTATCTCGTNTAGTACAATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGCTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTA ]
[-] EMBL CD202054 [ ATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTACAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTA ]
[+] EMBL CD202075 [ TTAGCC AAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCATGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTAT CACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACANTCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTG ACATATATATNTTCTTCT ]
[-] EMBL CD143095 [ GTGCAGATGAANCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATCTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTcgaccc ]
[+] EMBL CD178531 [ GTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTTTCGTCTTTCCCCCTCTGCCCATTACCAATATGTTTAATTTTATTGTTACAATATTAAAAATACAAATGAAATGCTTGTTGTATATTATTTGGAATTAAAATGCTTACTGCTTATCCCTGGAATACATATCGCTTAGTACACTTAAATAACCTCGGGCTTTTGAATTGGGTCTGC]
[-] EMBL CD095712 [ GAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTT ]
[-] EMBL CD072160 [ GATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATA TTCTTTTAGTGATTAAATGCTNTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATCTTCTTCTA ]
[-] EMBL CD201941 [ AACTGGCTGTGATATA TTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAGACAATATATAACCATCAAATGTTTAGAACAGAGTAAATATTGCCTTTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCGTATTAGCTTTTGTACATAGATATTTTCTTat ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||