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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9218#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1257 fasta sequence
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[+] EMBL CD161908 [AGACAATAAATTTATATAGAAGGTTGAATAGAACATTTCAAACTAAATTGTAAATATTTAAAGAAAGTGTCATTTATTGTCATGTAAAGTTCATACATTATAGAATTTATGGAAAAAGAAACAACGACAAATGATCATTTATATTATATCACAATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAGTTGAAATACACATCCACATAAAGAA TTCAAGTTATAAAATAAATTGAATGTAGTAAAAAAAGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAAAAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGNATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACC CATTTCAGTCATGACAACTTGNTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCATTGTT ]
[-] EMBL CD161864 [ TATAAGAGGTTGAATAGACCA TTCAAACTAAA TGTAAATATTT AAGAAAGTGTCATTTA TGTCATG AAAG TCAT CCTTATAG ATTTAT GAAAAAGAAAC ACGGCCAATGATCATTTATA TATATCA AATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAGTTGAAATACACATCCACAT AAGAATTTCAAGTTATAAAATANATTGAATGTAGTAAAAAAAGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAANAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCAT ]
[+] EMBL CD075707 [ TCATTTATATTATATCACAATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAGTTGAAATACACATCCACATAAAGAA TTCAAGTTATAAAATAAATTGAATGTAGTAAAAAAAGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAAAAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACT ]
[-] EMBL CD161823 [ GCGCATCATGAAGAATAAAAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCAT ]
[-] EMBL CD161792 [ TTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGTTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCAGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGGTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCAT ]
[-] EMBL CD082092 [ ACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCATTGTTCCATCAAATTTGTTGGGCTTGGTTGTAAGCATCGGATTAGCATGATTCAATTTCTGTACTAACATTCCACCTGAGCTAACAGTAATAACACGAGCATCAGGTGATTTTTTTAATGCAGGTATTAGACTTTCAGTAAGTATATAAGTACCAAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTCTAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAATATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGGTTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGATTATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGCACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTACTGAAACACGGCGATTGTCAAAGCGTACATTTTTCAACTCATTAGGATCAAAGTCCTC]
[+] EMBL CD152882 [ GTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCATTGTTCCATCAAATTTGTTGGGCTTGGTTGTAACCATCAGATTAGCATGATTCAATTTCTGTACT ]
[+] EMBL CD194283 [ CAAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTCTAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAATATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGGTTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGATTATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGCACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTACTAAAACACGGCGATTGTCTAAGCG ]
[-] EMBL CD194559 [ AAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTCTAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAATATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGGTTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGATTATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGCACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTACTAAAACACGGCGATTGTCTAAGCGT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||