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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9244#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1353 fasta sequence
[AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCACCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGGATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTATCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTTGATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTATTCGCACGAAATCGAGCTCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT-GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCTGTTATACTGTTTTGATGATTATGGTAATCAGTCATCTGAACTATGAGTTACTATTCGTAATTCATTGGTTAAGGATATCTTGTCAGTTTTGTTCTTTCACGTTTCTGTTTTGTGAAGATTTGTAAAACAGAGGTTTATTTTACGTTCTTTATGATTTCAAAAGTTATGCCTTTTCTTTTTTGCAATATGTCAATGAAATTCAATATGATTTAAAATAAACCG]
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[+] EMBL CD169953 [ GTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTT AAATCAAGTAGTGT ]
[+] EMBL CD090113 [ CGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGTTTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACAATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAAT ]
[+] EMBL CD167507 [ TGTTCAGATACA TTTGGACCTCTTTGCATTCTCCATGGTTGGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAGCCACCTTATC ]
[-] EMBL CD073330 [ TCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCTGTTATACTGTTTTGATGATTATGGTAATCAGTCATCTGAACTATGAGTTACTATTCGTAATTCATTGGTTAAGGATATCTTGTCAGTTTTGTTCTTTCACGTTTCTGTTTTGTGAAGATTTGTAAAACAGAGGTTTATTTTACGTTCTTTATGATTTCAAAAGTTATGCCTTTTCTTTTTTGCAATATGTCAATGAAATTCAATATGATTTAAAATAAACCG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||