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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9252#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1472 fasta sequence
[AAGAACGCTATTAGTCATGCAGAACACTCACTTAACCCAGATCGAGAAACACAGCCCAAGGGAAGTACAATGCGAAGTAAGGCTACCATCAAGCGACTTAATATGTACCGTAATTTCAAGGCAAAAAGAAACAAAAATGGAAAAATAGTTCGCCCTGCACCTTAGCAATCAACTGTACCTTCCGGCACAGATGCACGGGTTGAGCATAATAGACGATGGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGATACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTTACGAAATCATTTTACGTCAAACTCGCTTGCCTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGGGGTAAAGCACAGCGCAAAAGACCTTCGTTGGAGTTTGATGATCTATCGTCACTTGTACGAAACGCTGAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCACTTCAAAGCTGGCCGATCGAAGAGACTATGGAATGAGTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTACCACCATTGTCATCTAACGATGTTCAGAATTATTTGCAAAAGCAAATTATGGATAATGAAGCAAATAATGAAAGTAGTAAGGATATTAATTCAACTTTATCAGAATCCTCTACTAAACCTTTATTATGGAATGACTATCCAGAATTGTTTTTAGAAACCTTAGCTCGACAAAGTGGTAAATTACTAAAGGCTGGTGAGCCGGATTTAAACACGACTGCTAAGCGTGTACTGAATGACTTTCAACGTGGTCGACTACCCTACTTTGT]
[-] EMBL CD113565 [AAGAACGCTATTAGTCATGCAGAACACTCACTTAACCCAGATCGAGAAACACAGCCCAAGGGAAGTACAATGCGAAGTAAGGCTACCATCAAGCGACTTAATATGTACCGTAATTTCAAGGCAAAAAGAAACAAAAATGGAAAAATAGTTCGCCCTGCACCTTAGCAATCAACTGTACCTTCCGGCACAGATGCACGGGTTGAGCATAATAGACGATGGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGACACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTAACGAAATCATTATACGTCAAACTCGCTTGCTTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGG ]
[-] EMBL CD147770 [ ATTTCAAGGCAAAAAGAAACAAAAATGGAAAAATAGTTCGCCCTGCACCTTGTCAATCAACTCTACCTTCCGGTACAGTTGCACGGGTTGAGCCTAATAGACGATGGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGATACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTTACGAAATCATTTTACGTCAAACTCGCTTGCCTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGGGGTAAAGCACAGCGCAAAAGACCTTCGTTGGAGTTTGATGATCTATCGTCACTTGTACGAAACGCTGAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCA ]
[-] EMBL CD096854 [ GGTTTGGCAATACACGTGTTATAAGTCAAGATACGTTACAAAGTTTCAAAGAAGCAATGAAGATTCGAAATCCTTACGAAATCATTTTACGTCAAACTCGCTTGCCTATATCACTTTTAGATGAGAAAAAGACGAAAACGAAAAGTGCTCTCTTAACATCACAGAGCTACTCCTATGTATTTGGGGGTAAAGCACAGCGCAAAAGACCTTCGTTGGAGTTTGATGATCTATCGTCACCTGTACGAAACGCTGAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAG ]
[+] EMBL BF936844 [ GAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCACTTCAAAGCTGGCCGATCGAAGAGACTATGGAATGAGTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAAC ]
[+] EMBL AI975898 [ GAATCAAATCAGTATTTGTATAGCTCGACGGACGATAAACATATGATTCGATGCGATGATGGTGTTCGAGAATTAACACAGGATCCTCACTTCAAAGCTGGCCGATCGAAGAGACTATGGAATGAGTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACANAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATT ]
[+] EMBL CD165774 [ GTTATTTAAGGTTTTAGACTCTTCAGATGTTGTGCTGTACATTTTGGATGCGCGCGATCCAATGGGCACACGATCTCCTTATATTGAGAAGTACTTAAAAACTGAAAAACCACATAAACATTTCATTTTTATCATCAACAAAGTGGATTTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAA ]
[+] EMBL CD083443 [ TTTATCATCAACAAAGTGGA TTAGTCCCTGTATGGATAACAAAACGATGGAAAGCCATCTTATCTGAAGAATATCCTACACTTATATTCCACGCTGATATGACTAAACCTTTGGGTAAAGTTGCTCTCATGGGTCTTTTAAGGCAATTGGCATCACTTCATAGTAAAGAACGACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTACACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTAACAACATTG ]
[-] EMBL CD136669 [ ACCACAAATATCGGTTGGTATCATTGGTTATCCAAATGTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTACCACCATTGTCATCTAACGATGTTCAGAATTATTTGCAAAAGCAAATTATGGATAATGAAGCAAATAATGAAAGTAGTAAGGATATTAATTCAACTTTATCAGAATCCTCTACTAAACCTTTATTATGGAATGACTATCCAGAATTGTTTTTAGAAACCTTAGCTCGACAAAGTGGTAAATTACTAAAGGCTGGTGAGCCGGATTTAAACACGACTGCTAAGCGTGTACTGAATGACTTTCAACGTGGTCGACTACCCTACTTTGT]
[-] EMBL CD137216 [ GTTGGAAAAAGTAGCATCATTAATGCTCTTAGAAATAAAAAGGTGTGTAATGTCGCCCCGTTGGCTGGCGAAACAAAAGTATGGCAGTATGTTACTCTAATGAAATCTATATTCTTAATCGATTGTCCTGGAGTTGTCTATCCTGATGGTAATACTGAAGCAGAATTAGTTATGAAAGGAGTTGTGAGAGTAGAATACTTACAGCAGCCTGATCTGTATATTCGTGATGTATTGGAACGTGTTAAACCAGAATTCCTACAAGCCAAGTATAATCTACCACCATTGTCATCTAACGATGTTCAGAATTATTTGCAAAAGCAAATTATGGATAATGAAGCAAATAATGAAAGTAGTAAGGATATTAATTCAACTTTATCAGAATCCTCTACTAAACCTTTATTATGGAATGACTATCCAGAATTGTTTTTAGAAACCTTAGCTCGACAAAGTGGTAAATTACTAAAGGCTGGTGAGCCGGATTTAAACACGACTGCTAAGCGTGTACTGAATGACTTTCAACGTGGTCGACTACCCTACTTTGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||