cluster # 9254

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9254 cluster # 9254 Sequences # 9 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9254#0 length = 1634 sequences # 9
consensusID : consensus_9254#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1634
fasta sequence
                              [TTCCAGCACGTTGGTGTATCTGTTATTGACAATTTGATTAGAGGAGAATATATTTATGAAAATAGCTGTCTGAAATGCGGTTTCACATCCCGGTTACCTTCAAAGTTTTTAGAACTATCCTTGAAAGTTTCTTCAAAGTCACTTCCAGATTGTATACGGGATTATTTAAAGGAAGAACAATTAGTTGGTGATAATCGATATGCTTGTTCACAGTGTGGTTGCAAACGAGATGGTATTAGAAGAGCCTATATAACACGTGCTCCGCCATTGTTATGCATCCAGTTGCTTAGATTCACTTACGATTCAAACACTGGTCAACGTAAAAAGTATAAAGCTTCTATTCGTCTACCTGATCTTCTTGAGTTAACAAGAGTTGTTGAAAATCCAAAAAGTGATAAACATCTGAATTGTGAGCATTCTGTGGAATGTTTGAGTGTAGATTCAGATCCATGTTATCGTGCATATCGTCTCTGCGGTGTACTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAG-CTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGTAATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAATTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT-ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTCAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTA-TTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTTGATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATTACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTGGATTATTTCATANAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATTATAAACGTCTTCAAAGTGAAAAGACAGACTCAAT]

[+] EMBL CD153358             [TTCCAGCACGTTGGTGTATCTGTTATTGACAATTTGATTAGAGGAGAATATATTTATGAAAATAGCTGTCTGAAATGCGGTTTCACATCCCGGTTACCTTCAAAGTTTTTAGAACTATCCTTGAAAGTTTCTTCAAAGTCACTTCCAGATTGTATACGGGATTATTTAAAGGAAGAACAATTAGTTGGTGATAATCGATATGCTTGTTCACAGTGTGGTTGCAAACGAGATGGTATTAGAAGAGCCTATATAACACGTGCTCCGCCATTGTTATGCATCCAGTTGCTTAGATTCACTTACGATTCAAACACTGGTCAACGTAAAAAGTATAAAGCTTCTATTCGTCTACCTGATCTTCTTGAGTTAACAAGAGTTGTTGAAAATCCAAAAAGTGATAAACATCTGAATTGTGAGCATTCTGTGGAATGTTTGAGTGTAGATTCAGATCCATGTTATCGTGCATATCGTCTCTGCGGTGTACTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD094585             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCTCTGCGGTGTACTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAGTGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAG CTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGTAATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAATTTAACTGAACAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD065076             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAGCCTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGAATATGGTATTTTATGAATCGGCGGATAATTGTCATTTGCATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD167005             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAG CTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD129412             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatccGGACGATTTATGGCATAGTT AACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGGGGATAATTGTAATTTGGATGAACATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAACTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATGACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGCATCAACATATTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGCTCAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGCTATTACCAAAGGTCTTA                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD129409             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGTAATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAACTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTCAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTA TTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTTGATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATTACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTGGATTATTTCATANAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATT                                  ]
[+] EMBL CD126867             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACTATTGAAGAAGTAAATTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTTAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTATTTGACATTCT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD126885             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACAAAAGCTTATAATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTATTTAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCCCTTATGCCTTACGTACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD066669             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCCACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTA TTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTTGATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATTACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTGGATTATTTCATAAAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATTATAAACGTCTTCAAAGTGAAAAGACAGACTCAAT]




>consensus_9254#0
TTCCAGCACGTTGGTGTATCTGTTATTGACAATTTGATTAGAGGAGAATATATTTATGAA
AATAGCTGTCTGAAATGCGGTTTCACATCCCGGTTACCTTCAAAGTTTTTAGAACTATCC
TTGAAAGTTTCTTCAAAGTCACTTCCAGATTGTATACGGGATTATTTAAAGGAAGAACAA
TTAGTTGGTGATAATCGATATGCTTGTTCACAGTGTGGTTGCAAACGAGATGGTATTAGA
AGAGCCTATATAACACGTGCTCCGCCATTGTTATGCATCCAGTTGCTTAGATTCACTTAC
GATTCAAACACTGGTCAACGTAAAAAGTATAAAGCTTCTATTCGTCTACCTGATCTTCTT
GAGTTAACAAGAGTTGTTGAAAATCCAAAAAGTGATAAACATCTGAATTGTGAGCATTCT
GTGGAATGTTTGAGTGTAGATTCAGATCCATGTTATCGTGCATATCGTCTCTGCGGTGTA
CTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCT
TACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCT
CTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCG
TCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTA
ACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAA
AAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTT
AGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAGCTCCTAAGTGTATATCACAGGAC
GATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGT
AATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAAT
TTAACTGAACAACAAAAGCTTATATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAG
TTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAAT
CATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTA
CGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTCAACTGATGCTCAAATA
AAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCT
TATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATAC
AGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTATTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTT
GATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATT
ACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTG
GATTATTTCATANAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATTATAAACGTCTTCAAAGTGAA
AAGACAGACTCAAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case