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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9255#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1176 fasta sequence
[CTCGCAGGCCGNAATTCGGCACGAGGAATTTTTCAGTTGACGTCCTAATCTATGGAAAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGACTATGTTCCTCATTTCCTTGCTTTTTTGTGTTATTGTGTATAGCTAAAATTGTATCATCAAGCGCTTTTAGATGTCTTCCCAGATCATTGGTTTAAAGAGGTACTGATATTTAACCTGAAAATCTATTTAGTTCTGTAATCTTATAATTTCACTGAAGATTCGATGTGTCAATAAAATTTCCATTCATTTGGTTTATTGAGATCATTTAGGTTGACAATTCAATGCCGGTCGTTAAAAATATTTTTTCAACGTACAATCGCAAGATATTTTGTAAATAAACTGTCATTTATTAGATTTCCTCCCCACTTATATATCAAGATTAATCATTTTTACTATTATTCGATAAGTCAACATCTTGCATATT]
[+] EMBL CD077985 [CTCGCAGGCCGNAATTCGGCACGAGGAATTTTTCAGTTGACGTCCTAATCTATGGAAAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACANAGTACt ]
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[-] EMBL CD178784 [ AAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGTTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCA ]
[+] EMBL CD081840 [ gaggATCTT ACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGTTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTNTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCANATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTT ]
[+] EMBL CD114714 [ GTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTG ]
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[-] EMBL CD066384 [ CAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATAAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATGTTTACAGTGAATCAGTCTGACGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTCCCAATGCAAATGACATATACTAC ]
[-] EMBL CD075559 [ CTGTNNTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGACTATGTTCCTCATTTCCTTGCTTTTTTGTGTTATTGTGTATAGCTAAAATTGTATCATCAAGCGCTTTTAGATGTCTTCCCAGATCATTGGTTTAAAGAGGTACTGATATTTAACCTGAAAATCTATTTAGTTCTGTAATCTTATAATTTCACTGAAGATTCGATGTGTCAATAAAATTTCCATTCATTTGGTTTATTGAGATCATTTAGGTTGACAATTCAATGCCGGTCGTTAAAAATATTTTTTCAACGTACAATCGCAAGATATTTTGTAAATAAACTGTCATTTATTAGATTTCCTCCCCACTTATATATCAAGATTAATCATTTTTACTATTATTCGATAAGTCAACATCTTGCATATT]
[-] EMBL CD066520 [ cAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGACGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||