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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9299#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 596 fasta sequence
[TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC-CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]
[+] EMBL CD086234 [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD085985 [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD086028 [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTGCAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCATACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD086085 [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[+] EMBL CD086170 [TAAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[-] EMBL CD086260 [ AAACTCTGAAGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]
[-] EMBL CD085996 [ AAACTCTGAGGATTCCCCCCGAAATAGGAAGATTAGGGTAATACAGAGTAAAGATGTCTAGCTCAC CAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]
[+] EMBL CD086109 [ acATACGAAGATCACGGTAATACAGAGTAAATATGTCTAGCTCACACAAGCCGTTCTTTGTGTGGTGAACACTGGAGTCCTGGAATTACAAGGGTATCTACTTTTTCAAGATATACTAGTCACCTTCCAATTTTGGGTGTCATTAAGTTTATGTATACTGTAGTGAACATATAAGTATCTTATTTGGTAAATGTCCGTCTTAAAGCCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGTGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGAT ]
[-] EMBL CD086293 [ CCTATATTGTTGTAAAACCTTTAGCTGCTGCCACACTGTAGCGGGCTGTAGTCTTAAAATTATGATTCATTGTCGCCCCAGGATCATTGTGAGGCCGGACTGCAGGGACAGACTCTTCACCTATGCTGTACCTACTAACCTTTGTATCCCCAATGTGCAAGCAGACACACTTGGCTTTGCTGATAGACATTAGTCAGCGTCTGTAATTTAGTTTTGAGACTTCGTATTAACCTACAGAACTCTGGTTAAGTTCATAAAACAAGATATGCACTCAAAGTAACTAGTATCCATTTTATTTGTCTGTTTATTTTAACACAAACATTAGTACAAAAAGACAAAATATATATGCACCACACTTCATCGTTCGATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||