cluster # 9431

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9431 cluster # 9431 Sequences # 9 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9431#0 length = 791 sequences # 9
consensusID : consensus_9431#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 791
fasta sequence
                              [CAAATATTTTGCTACCCCAAGGCCACG-TTTTTGCTTTTGGTAA-TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT-TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAATGAGACGAGTTGGTCATCTGATGCATGGTACAGACAGAGGTGTTGGCCGAGCGAATTAGATAACGAATTGTTTTTATGGGAGAGGTTATCCTTCTGAGTATTGTACTTTATTCTATGAATATTTCCATCCCCTCTCTCGCGTTATTCCTACACGATATTCTTTATTTGTCCTTTTAAGTACATATTGATATCTGTACAGTAATTTATGTTATGTACAGTTTCTGAT]

[+] EMBL CD142245             [CAAATATTTTGCTACCCCAAGGCCACG GTTTTGCTTTTGGTAA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD180764             [   ATATTTTGCTACCCCAAGGCCACG TTTTTGCTTTTGGTAA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD200621             [   ATATTTTGCTA CCCAAGGCCACG TTTTTGCTTTTGGTAA TGTTCAATCAGAGAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAACAACTCATTCACGAATAATATGTACGGACACTAAAGTGCTACCGATATTTATTCGTGACATGTTATGGACTTGATTTCGATATCACTTTAACACTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGACACTACGCTGCTTCTGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATCTATGTTCTACATGGCTTCACCATCTTATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD084179             [            ggcacgagGGCCACGCTTTTTGCTTTTGGTAACTGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAAC                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD097284             [                                    TTTGGTAA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGTCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTCCACCATCTCATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTCAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAAT                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI974967             [                                          AA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGACATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTGCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAga                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD077862             [                                                   taggGAGAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTCTAACATTTTGTCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI975317             [                                                                                                                                                                                                             AACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAATGAGACGAGTTGGTCATCTGATGCATGGTACAGACAGAGGTGTTGGCCGAGCGAATTAGATAACGAATTGTTTTTATGGGAGAGGTTATCCTTCTGAGTATTGTACTTTATTCTATGAATATTTCCATCCCCTCTCTCGCGTTATTCCTACACGATATTCTTTATTTGTCCTTTTAAGTACATATTGATATCTGTACAGTAATTTATGTTATGTACAGTTTCTGAT]
[-] EMBL CD097285             [                                                                                                                                                                                                                                                    GTTTAGCCGCTAATAAATTTATGTCCTACATGGATCCACCATCTCATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAATTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTCAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGT AATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAATGAGACGAGTgcgcc                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_9431#0
CAAATATTTTGCTACCCCAAGGCCACGTTTTTGCTTTTGGTAATGTTCAATCAGAAAAAA
GCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTA
AAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACA
TTTTTCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCT
TGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAA
CGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTT
GGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATT
CACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGG
GTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAG
AAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAATGAGACGAGTTGGTCATCTGATGCATGGTACAGAC
AGAGGTGTTGGCCGAGCGAATTAGATAACGAATTGTTTTTATGGGAGAGGTTATCCTTCT
GAGTATTGTACTTTATTCTATGAATATTTCCATCCCCTCTCTCGCGTTATTCCTACACGA
TATTCTTTATTTGTCCTTTTAAGTACATATTGATATCTGTACAGTAATTTATGTTATGTA
CAGTTTCTGAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case