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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9450#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 706 fasta sequence
[ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA-TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTAAATGTCATGGGAAGCTTGGATAAG-ATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATAAACAAAACTGATTTAGAATAGATTGCTTATGGNTATATATCAGCCTATCTCGGACCTATCNACAGGATGCACATGCATGTCAGTGTTGATGCTCNACATTGAGACTTG-ACCTAGTA]
[+] EMBL CD088799 [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTA TAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATAATAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAACGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAGGTCTGCGTANATGTCATGGGAAGCTCGGATAAG ATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATANACAAAACTGATTTAGAATAGATTGCTTATGGNTATATATCAGCCTATCTCGGACCTATCNACAGGATGCACATGCATGTCAGTGTTGATGCTCNACATTGAGACTTG ACCTAGT ]
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[+] EMBL CD088809 [ATAGCGAAGCGAAACGAAATGACGCGCGATAGAGAAAGCAAGTGAATCAACTTAATTCATTCAGACATGAATCGACATTTACTAGACAAACAAAAAGGTCAGGAATACTAAGCGAATAAGTGATAAGGTAAAAATGTGGCTTAAGAAGAATGAATAGATTGGTCTGTCCAGATGCTAGAATAACCCATATAGACTTGACATAATACCAGCCCCTACACTTTGTTCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGCTTAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTACAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTC ]
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[-] EMBL CD088849 [ cTGACATAATGCCAGCCCCTACACTTTGTGCAATGCTTCAGATTACGTGAATCTCGATTACTGGATAAAAAAGTGGGAAATGATTTTAACATTTATGATTTTGCCGCTAACATTATTTCCCATGTAACAATAAATATAACAGTTTACCTATTCAAAAAATTCTGGGACGTGTTACAACATAGAAACTAAAACCATTATACTTTTATATAGGTTCGTGTTTATTTATTTATACAAATAAAAGATTTTATACATAATGTGTTAATTTAAAGATAAAAATAAACAGGAAAACATCTTCAGTTTCTGTTAAATGTTAGGATCCATCACCTTTACCGATATAAGTCTGCGTAAATGTCATGGGAAGCTTGGATAAGAATACTCATGTAAGTTCGGCTGACATAAACAAAACTGATTTAGAATAGATTGCTTATGGTTATATATCAGCCTATCTCGGACCTATCAACAGGATGCACATGCATGTCAGTGTTGATGCTCAACATTGAGACTTGAACCTAGTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||