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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9490#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 633 fasta sequence
[GGCTTCTTGGAAGTGGTAAAACTACTCAATTAACTCAATATTTACATGAAGATGGTTTTACAACCTATGGTATGGTTGGTTGTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGCTATGTCTGTTGCTCGGCGAGTTGCTGAAGAAATGAATGTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC-GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTAAAAC-AACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTANGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTATGCCTGGTCAAGAGGATATTGAAGTGACATGTGAACTAATTGCTGAACGTTTGA]
[+] EMBL CD132859 [GGCTTCTTGGAAGTGGTAAAACTACTCAATTAACTCAATATTTACATGAAGATGGTTTTACAACCTATGGTATGGTTGGTTGTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGCTATGTCTGTTGCTCGGCGAGTTGCTGAAGAAATGAATGTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTAAAAC AACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTANGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTAT ]
[+] EMBL CD059218 [ GTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTAGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ]
[+] EMBL CD059186 [ GTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTCAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ]
[+] EMBL CD059216 [ TACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTAT ]
[+] EMBL CD059168 [ TACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ]
[-] EMBL CD059180 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTGGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTCAGGTGATTGTCCTATTTTTCG ]
[-] EMBL CD059265 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCG ]
[+] EMBL CD059226 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTACTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ]
[-] EMBL CD059183 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATT ]
[-] EMBL CD130602 [ CTTTAAATACTGATGTGTTATNTGGATTGTGNCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTANAACNAACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTAGGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTATGCCTGGTCAAGAGGATATTGAAGTGACATGTGAACTAATTGCTGAACGTTTGA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||