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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9591#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1425 fasta sequence
[AGGGCCAGAATTCGGCACGAGGTTTTCCCTCAAGAACGCGATGAAGATGCTTCAATAATTGACAAGGAAGCAGTTTATGAAGTTTGTCAAGCGTGCAATGCAACAGAACGTGAAGTTTTCGCTGCCTTACTAAACAACGATCCTAGTGATCAATTATCAGTTGCTTATCATCTTATCATAGACAATAAACGTTTTGGATCAGTTTTAAATCCAGAAGAAGTGAATAATTTTTATGTTGCTACTGGGATTGATTCATCAACCTCATCAGCAGCAGGAACAACAACAAATACATCAAATAGTCCACCTATTAGTGGTGGTACACTGACTCATTCTCAGCCTGGTGGTGGTCGAAGTCAATCATTAAGTCCAAATTATGGTAATAATACTGGCATGATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGATCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAGATGGCATTTAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAGTGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGATCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAACAGCGATGGGTAGATTACGTTCAAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGTGGTGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACA-TATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA-ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC-TTA-TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCCGCAAGATTCAAAAACTAATCTCTGTACACAAGGACGATAAATACTACTGTCGCCA-CTGTACACAGTGATTAGTTCAAAAAAATCTCTATTTGTAGTATTTATCGTTCCTTTTTATTTCGATTCCTGATTTAATTACTAATTAGCATTACTTTCAACCAGAAAAGTTTTGACCTTATTCCCGTCGCCCTTATCTCTTACAGACGATGTAATGTTTTAATTCGATTTCCATTTACACATATACATATATTTATTCA]
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[-] EMBL CD131223 [ ACGCGATGAAGATGCTTCAATAATCGACAAGGAAGCAGTTTATGAAGTTTGTCAAGCGTGCAATGCAACAGAACGTGAAGTTTTCGCTGCCTTACTAAACAACGATCCTAGTGATCAATTATCAGTTGCTTATCATCTTATCATAGACAATAAACGTTTTGGATCAGTTTTAAATCCAGAAGAAGTGAATAATTTTTATGTTGCTACTGGGATTGATTCATCAACCTCATCAGCAGCAGGAACAACAACAAATACATCAAATAGTCCACCTATTAGTGGTGGTACAC ]
[-] EMBL CD156156 [ ATACTGGCATGATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGGTCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAGATGGCATTCAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAGTGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGATCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAA ]
[-] EMBL CD156384 [ ATACTGGCATGATTGGATTAAAAGGAAGAGGTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGGTCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAGATGGCATTCAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAGTGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGATCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAA ]
[+] EMBL CD077921 [ tcggtacGAGGGGTTCTCTCCCCAACACGACCTCATCCAGAAAGAATGCCTGATGGACCACCGTTATCAAGAACATTAGATCCAATGGGGGATTCATTGGCATCTGGGTCAATTGTTACAGGTGATTTGAACTGTCCAAGTCAAATTTCTTCTCAAGCACAATCAGCTATTACATCGGGAGCTGCAGCAGCTAGTGGAATGAAACGTTTTAAATGGCATTTAGGTATACGTTCTCAATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTTGTTATGAATGGAAAAGTGTTAATCC TTTAAT ]
[+] EMBL CD167714 [ AACG TTAAATGGCATTTAGGTATACGTTCTC ATCTAGACCATGGGATATTATGCATGAAGTATTTAAAGCAATGAATTCACTTGGTTATGAATGGAAAGTTGTTAATCCTTTTAATGTACGTGTAAGAAAATGGAATCCAATACTACAGCATTATTCTCGACTTGTATTACAACTTTATCAGGTCGATGCAAGATCATATCTCCTCGATTTTAAGTGTATCGATGAAAGTCAATTAGAATCGGAAACAGCGATGGGTAGATTACGTTCAAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGT ]
[-] EMBL CD075591 [ GTGTATCGATGANAGTCAATTAGAATCGGAAACAGCGATGGGTAGATTACGTTCAAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGTGGTGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACANTATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC TTA TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCCGCAAGATTCAAAAACTAATCTCTGTACACAAGGACGATAAATACTACTGTCGCCA CTGTACACAGTGATTAGTTCAAAAAAATCTCTATTTGTAGTATTTATCGTTCCTTTTTATTTCGATTCCTGATTTAATTACTAATTAGCATTACTTTCAACCAGAAAAGTTTTGACCTTATTCCCGTCGCCCTTATCTCTTACAGACGATGTAATGTTTTAATTCGATTTCCATTTACACATATACATATATTTATTCA]
[+] EMBL CD095125 [ AAACAATATGTCAGTATGCCTTGATTCTTGTGGTGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACA TATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC TTA TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAAT ]
[-] EMBL CD128368 [ TGGAACTCCTCCAGCTGCTATGGGTACTTCAACA TATAGTAGAGATGGTAGTTTTTCTGGTAGCACTGGATCTGCTAGTCCAACCAATTGCTCCGATGGTCCAAATACAACTGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGA ACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTGAAATGTGTACTGAGC TTA TTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCCGCAAGATTCAAAAACTAATCTCTGTACACAAGGACGATAAATACTACTGTCGCCACCTGTACACAGTGATTAGTTCAAAAAAATCTCTATTTGTAGTATTTATCGTTCCTTTTTATTTCGATTCCTGATTTAATTACTAATTAGCA TACTTTCAACCAGAAAAGTTccgtgagcc ]
[+] EMBL AI390070 [ TGAATTTCCTCGATCGTTTTCAGCTAATTGTCAAGAAGTACCGATTAACCGAAGATACTAAACGACATCAAACAATGGAATTTTTTG AATGTGTACTGAGCTTTATTTACCACATTGGCTCGATGATCTACTGTAATAGTGTTTAAGCGCAGATTCC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||