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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9628#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1227 fasta sequence
[AGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGAATTTTTTGAGGCTGCTGGTGTTCCATCCAAACTAAGGGAAACATATGCTGGAATTTTTGTAGAACATCGAATTAACAATTCAGTCCTTGCTGATTTAGATAAGGACCACTTAAAAGATATGGGGATCACAGTTATTGGAGATATTATTTCCATACTAAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT-AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGATCCATCTGCTGCNNATGCAACGTTNTATTCGTTGGAATTTAAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTAAAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTAAACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATACAATC-AATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACACCGAAGGTGTACTTGGACAGAGTCGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]
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[+] EMBL CD082978 [ GGACC CTTAAAAGAT TGGGGATC CAGTTATTGGAGATATTATTTCCATACTAAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGAT CTTCTGCTG NCATGCAACGTTNTATTCGTTGGAATTTAAATGANCACAGTCTGGNATCAC ]
[-] EMBL BG931169 [ ccagacgcGGGATCACAGTTATTGGAGATATTATTTCCATACTGAAGCAATGCAAAAAAATAAGACACGAGCTATCAGTTGCACCAACTCCTGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGAg ]
[+] EMBL CD180111 [ TGTCGTTACTTCAACTACGTCGAAAGACTGCTCATCTGAAAATAAAAAAGCTGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAGATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTG ]
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[+] EMBL CD078287 [ TGTGTCCAAAAATGTAGCCGTTTTAGTCCCAGTGCGTCGTCGAATGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGT AATGCTGTAAATAGAGAGGATTCACCTACAAGTGTGCTTATAAAAAAAACGATAGATCCATCTGCTGC AATGCAACGTTTTATTCGTTGGAATTTAAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTANAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTANACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATAnncat c ]
[+] EMBL CD077996 [ gaggTGAATCCTGAAGTTGAAGGAAAATACATTGTTAAAATGCCCAAGGGGACGACTTTGAAGACCCAGAAGATTCTTGCATCAATGAAGCAAAAGAACAGTGCAAAGTCTAGTCAACCTGAAGTTGCCAAAGCCGCCAAAACTAATGAACCTCCTGTATCGTCTACCTTTGAAGACAGCGATGCCGATGATTGTGATAATTATCGTGTTATCATCTCTAAATCGAATACACATGGTTCCACATCTAGTGATTCAGTATTCAGTCGTTTAGGTAAATGCTGT AATAGAGAGGA TCACCTANCAGTGTGCTTA ]
[-] EMBL CD074670 [ AACGTTTTATTCGTTGGAATTTAAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTAAAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTAAACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATACAATCAAATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACACCGAAGGTGTACTTGGACAGAGTCGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]
[-] EMBL CD076561 [ AAATGACAACAGTCTTGGATCACCTTTTCGTCCTCCACCATCTGTTACAGAAACCATGATGACCTCATCGGAGGATTCTTTGAATTTTAAAGTTGTTAAACAAGTTAGCAGTCTTACAAAAAACGTTGATCAGCCTATTAAATTAAGAACACCCCTTAAACGTCATGCTTCTGATACGGTATTTAGTCGTTTAAGTACTCCATCAACTACTATACAATCAAATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACACCGAAGGTGTACTTGGACAGAGTCGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]
[-] EMBL CD072933 [ ACTCCATCAACTGCTATGCAATCAAATGATCAACTTTCTTACCAAGGAATTTTGAAGAAGTCACGTACGCAACCTCCTAAATTTAACGATGAATCGATGTCTCCATGTTCTCTAAATAGCTTTCTTTCTCCATACGCCAAAGGTGTACTTGGGCAGAGTGGTATGCAAAAAGTTTCTGTTAAAAACCGCTTAGGCAACAGACAAGGAAAGTCTAACGCCCCAGTTCATTCTAGACTTGGTAGAGCATCTAATCCATTATAAATAATTTGATTGTCATGACTTTCAATGAACTTAGTGTATATATACATAAATATATTCTGCATACCATAAAATATAATTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||