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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9642#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1354 fasta sequence
[TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC-GGATGT-AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG-ACAGC-TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA-TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTTTAACTG]
[+] EMBL AY158215 [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGCATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTTTAACTG]
[+] EMBL AW017008 [TGTAATCAATATGGAGATTAAAATGAGTTATCCATTTAGTAGTAATGACTGAAACTACTAGAAAAATTGTTGTTGTTGGCGATGGAATGGTTGGGAAAACTGCTTTATTGTCAGCGTTTGTAAATGGTGCATTTCAGGACTGCTATATTCCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAA ]
[+] EMBL AW017183 [ CCAACAGTATTTGAAACATCAGCTAAAGAAGTTGATCTGCCAGATGGTCGTCATTTAACTTTGGGTTTGTGGGATACAGGGGGTCAAGAGGAATTCGATCAAATTCGGCAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGGTTTTTAAGAAAACGGTGAGTTATTTCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTTCGAAGTCTTTCCCTCTTC ]
[+] EMBL AI067299 [ CAACTTGCATATCCTGGTGCAAGTTTAATTCTGCTTTGTTACGCAGTTGATTGTCCAACTAGTTTGGAAAATATTGTGCACACATGGCTAGATGAAGTAAAATGCTACTGTCCACAAATACCACTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATT ]
[-] EMBL CD070825 [ CTGTCCACAAATACCACTCATACT GTCGGGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAG ACAGC TCTGATCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATG ]
[+] EMBL SM58082 [ CTCATACTGGTC GGATGT AAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGAAAGTCTAATAACTTAACTATGAATGCATCGCAGAACAGCTTTTGATCGATCCAAATGATGTAGAAAAGGTTGGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAGAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAACTCCATAGAAAG AATCATTTTC AATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACG ]
[-] EMBL CD070781 [ tGTC GGATGTAAAAGCTGATAAACGTGTGGTCATTGCACCAGGANAGTCTAATAACTTANCTATGAATGCATCGCAG ACAGC TTTGATCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATG ]
[-] EMBL CD070864 [ CAG ACAGC TTTGATCGTTCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATACTATTACATACTTCCAA T CGGAAAAAG AATCAATTTCAAATGGTGC ]
[+] EMBL CD078645 [ TCGATCCGAATGATGTAGAAAAGGTTAGTAAACAAATTGGTGCACAAATTGTTATCGAATGTTCTGCTTTGACAAGATCCAATGTAAATAGTGTGTTTGAATTAGCTGCACGGATTATACTAGATGTAGAAAGAGAAAATATGCGAGCATCGAAATTCTATAACATACTTCCAA TCCATAGAAAGAAATCAATTTCAAATGGTGCAGTAACTGGGACCTCACTTATTACACGTCGAAGCTCTGGACTGAAACGACGTATTTCCAGTTCAAACTATTTTTGTTTTTTAAGAAGACGGTGAGTTATTGCATGCAAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTANATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTC ]
[-] EMBL CD073109 [ AAGGTATGATGAGTAAATAACAAAATCGAGGAATAATATGCTATTGAATGTTCCGAAGTCTTTCCCTCTTCTTATTTCAAAATATGGATACATAATAATGCTTTCATAAAGCTCAAAATAATTCCGTTTTTCTTAAATGAACAGCCAATGTCTTTCATATGTTGATATTATAGGAGATTATATGCATATTACAAATAATGATATCGATAATGATAACATACTTTCATTTGAGTCAATCTATTGATTGTTGGAACTATATTGTGTAAATACAAGAGTTCAATGTACATCAGTATGTCAGAGGAACTGTGATCATGATGATTCAATTCCATATGTGCACTCTATTATGAATACTACATTTGTTGACCAAATATGCACAAAAATAATGTATAAATGGATGGTATTCTTTTAATTGTATGAAATGTTGATAATAATAATATTCAAATTGATGGATTTAGGTATGCTTAAACCTATTCATGCTCCACTAATAACTATGTACCCGTGAAATTAATAATTCTGAACTTATGAAATGAAACTGATTACTCTACCATAAATAAATAAATTTT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||