cluster # 9723

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9723 cluster # 9723 Sequences # 11 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9723#0 length = 818 sequences # 11
consensusID : consensus_9723#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 818
fasta sequence
                              [AGCTTATTACATCAGACATGATTGAAGAAGTGATGACTAGCATTGCACAACAAGCTGTTGAAAAAATCGATCGGACACGAGGTGTAGCTGGTCAAGTGTTCGCTCATTTACTCCATCATGACCCTCCTATCGAACACATTTCACATTTTGAAGAACTGAAACAAATTTTCCCAAAATCTGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT-TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA--TTGTCAACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACAACTAACGGAAAGTGTATGGAATG-AAACTAAACT--AACTAAAGATGTACAACGTATTAAAGCTGCTATCGATGTATTTGGTGGGATGTTACAATTTACTGGGTCTGTTCGAAAACGATCCCTATCATTAATGATGATCATATTGGGATCTCGTTACCCAATTATTCGTAAAGCAACCGCAACAGAATTGTATGAAGGTTTACTGGTTTATGAGTTATGTCCATCTGAGTTATTAGATCAAGTATCATCTATACTTACTGAAACCATCTGGGAAGGTGATATCGAAGCAGTC]

[-] EMBL CD156503             [AGCTTATTACATCAGACATGATTGAAGAAGTGATGACTAGCATTGCACAACAAGCTGTTGAAAAAATCGATCGGACACGAGGTGTAGCTGGTCAAGTGTTCGCTCATTTACTCCATCATGACCCTCCTATCGAACACATTTCACATTTTGAAGAACTGAAACAAATTTTCCCAAAATCTGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGTCCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD156462             [AGCTTATTACATCAGACATGATTGAAGAAGTGATGACTAGCATTGCACAACAAGCTGTTGAAAAAATCGATCGGACACGAGGTGTAGCTGGTCAAGTGTTCGCTCATTTACTCCATCATGACCCTCCTATCGAACACATTTCACATTTTGAAGAACTGAAACATATTTTCCCAAAATCTGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD156456             [                                                                                                                                                                                  TGATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD139862             [                                                                                                                                                                                                                                        GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA  TTGTCAACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACNACTAACGGNAAGTGTATGGAATGAAAACT AACTAAAACTAA                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD139989             [                                                                                                                                                                                                                                        GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCGTATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA  TTGTCAGCTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACAACTAACGG AAGTGTATGGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD139943             [                                                                                                                                                                                                                                        GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTT AATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA  TTGTCCACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD139916             [                                                                                                                                                                                                                                        GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTT AATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGATTTTGTC ACTC ACAATTGATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD139929             [                                                                                                                                                                                                                                        GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAGTTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA  TTGTCAACTCAACAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD139883             [                                                                                                                                                                                                                                        GAAACTGCTGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTCTGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCT TTAAGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD069166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCAGCTCTTGTGTGCATATTTTCTTGATCATGAATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGTTTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATGATCCGA  TTGTCAACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACGACTAACGGAAAGTGTATGGAATG AAACTAAACT  AACTAAAGATGTACAACGTATTAAAGCTGCTATCGATGTATTTGGTGGGATGTTACAATTTACTGGGTCTGTTCGAAAACGATCCCTATCATTAATGATGATCATATTGGGATCTCGTTACCCAATTATTCGTAAAGCAACCGCAACAGAATTGTATGAAGGTTTACTGGTTTATGAGTTATGTCCATCTGAGTTATTAGATCAAGTATCATCTATACTTACTG                                ]
[-] EMBL CD193939             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGATNCAAACAGTTCAATTCTTTTACAACTAACGGAAAGTGTATGGAATG AAACTAAACT  AACTAAAGATGTACAACGTATTAAAGCTGCTATCGATGTATTTGGTGGGATGTTACAATTTACTGGGTCTGTTCGAAAACGATCTCTATCATTAATGATGATCATATTGGGATCTCGTTACCCAATTATTCGTAAAGCAACCGCAACAGAATTGTATGAAGGTTTGCTGGTTTATGAGTTATGTCCATCTGAGTTATTAGATCAAGTATCATCTATACTTACTGAAACCATCTGGGAAGGTGATATCGAAGCAGTC]




>consensus_9723#0
AGCTTATTACATCAGACATGATTGAAGAAGTGATGACTAGCATTGCACAACAAGCTGTTG
AAAAAATCGATCGGACACGAGGTGTAGCTGGTCAAGTGTTCGCTCATTTACTCCATCATG
ACCCTCCTATCGAACACATTTCACATTTTGAAGAACTGAAACAAATTTTCCCAAAATCTG
ATTGTGATGATATGATATGGAATTCGGCCAACTCAACATTTCATCGTTTTACGAAACTGC
TGGATTTTCCAGAATATCGTTATCGTTTAATTTTAGGCTTAATTGTCAGTGTCGGTGGTC
TGACAGAATTAACAATTCGATGTAGTACTTCAGCTTTAAGTGCATATTTTCTTGATCATG
AATCAGACCAGCTGTTTATCGTAGAAGTATTAAAGATTGTTGGACAGATTTTGCAATCGT
TTCGACAAGAAGAGAGGATTGTTGTTCCTCTTTTTAAATTTCTGGATTTTTTACTGAATG
ATCCGATTGTCAACTCAACAATTGATCCAAACAGTTCAATTCTTTTACAACTAACGGAAA
GTGTATGGAATGAAACTAAACTAACTAAAGATGTACAACGTATTAAAGCTGCTATCGATG
TATTTGGTGGGATGTTACAATTTACTGGGTCTGTTCGAAAACGATCCCTATCATTAATGA
TGATCATATTGGGATCTCGTTACCCAATTATTCGTAAAGCAACCGCAACAGAATTGTATG
AAGGTTTACTGGTTTATGAGTTATGTCCATCTGAGTTATTAGATCAAGTATCATCTATAC
TTACTGAAACCATCTGGGAAGGTGATATCGAAGCAGTC
clustalw multiple alignements is not computed in this case