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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9753#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 784 fasta sequence
[ACTTGGATTTTGTGTAGTCAACATGTCCAGAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGATACAAATGATCCTGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCTCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA-TT-ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT-TATCACGTAAA-TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT-CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTGACTGAAGACAATGAAAATCCATCACCTCCTCCGGCACTAGACGATAATCCCTGCTGACTGCGAACAGGTGATGCACGTNCACTGGATAATACGCTAACTTCATCATCATTAATATCAGTA]
[+] EMBL CD196042 [ACTTGGATTTTGTGTAGTCAACATGTCCAGAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGATACAAATGATCCTGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCTCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGTACGTTTACGTAAGCCCCGAAATTCCAACCTAGCTTCA TTNAT AAGCGNTAGACACTCATCATATT TATCACG ]
[+] EMBL CD196046 [ACTTGGATTTTGTGTAGTCAACATGTCCAGAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGATACAAATGATCCTGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCTCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCNACCTAGCTTCATTT AT AAGCGTTAGACACTCATCATATTNTATCACGTAAt ]
[-] EMBL CD114308 [ cAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGACGCAAATGATCATGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCCCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTAC ]
[-] EMBL CD158541 [ AGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCAACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATC ]
[-] EMBL CD190591 [ AGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCTAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTA ]
[-] EMBL CD178945 [ GTTAGTGTAGTATTGCAGTGGTCACTACAGAACTGCTGGATATGAGTGAACTAGGTCGATAATATCCGCGACGAGAACGTTTACGTAAGCCACGAATCTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAAGTTTTTTAATTCACATGTCAGTAATGAATGCGATATGTGCGTTTCTATCAGCCGCCCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTTGCTTAGCCAACTCATCGGATAAACTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAAATGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCA ]
[-] EMBL CD178585 [ GGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACG TTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCCTTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAA ]
[-] EMBL CD178416 [ GGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTG ]
[+] EMBL CD115621 [ CCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGGTGGTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTGACTGAAGACAATGAAAATCCATCACCTCCTCCGGCACTAGACGATAATCCCTGCTGACTGCGAACAGGTGATGCACGTNCACTGGATAATACGCTAACTTCATCATCATTAATATCAGTA]
[-] EMBL CD144258 [ AACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATCGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGAT ]
[-] EMBL CD196230 [ CAATTATCATTTCATTTTCTGCTGTCAGCTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCAATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTGAC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||