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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9813#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1008 fasta sequence
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[+] EMBL SMSM25 [ATTTATAAGAAATATTCATGATGTTACTGAGCCAAAAAAAAGAAAAAAAAGAGAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAACATGTTTTCCTTTCATGAACGAATGAAAAAAAAACATGTAACCATTAGGGTATATAAACATGAACGGATATTAGTGTTCCTTTTTGTTTTATTCATTTCAACTACTGATTTTTCTACTGAAATCATAATGATTCAAACAATTAATTGGATCGTTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAAT GTATCATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACTTTTTAT TAT TACTACTT AAATATAATAATGAGTAGTA ]
[+] EMBL CD079050 [ TGATTTTTCTACTGAAATCATAATGATTCAAACAATGAATTGGATCGTTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAAT GTATCATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACTTTTTAT TATTATACTACTT ANATATAATAATGAGT ]
[+] EMBL SMAA25585 [ GTTTGGGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATTGGGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCA ]
[+] EMBL SMAA25567 [ GTTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATG AAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACC TTGAATCTA TCATATTTATGTAAAAATCTTAATGATAACAATAAC AAAAC AAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAG TTAAATG TTTAA AAAAATTAT AAAAA GGTTG TA TAAAAT GTA CA AAAC TTTCCTG AATAAAATG ATGAGGTG TTGTAA TTCAA AAA TCAT CCTTTAAA TAT AACCTCCT AAATA AATA ]
[+] EMBL SMAA28927 [ TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGTATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGTATT AGTAGAAGAATAAGGGCCACT CTAATTCAGCAAAT TATTTATG AAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACAGTTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGGTAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAAT AAATTTATCAAAAAGGGTGGTTATTATAAT GTATCTGATACTTTT CTGTGATT AAGTG ATGAGGTGTTTGT ATTTC ATAAATTCATTACTTTTTATATA TAC ACTTAAAATATA ]
[+] EMBL SMAA25572 [ TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAATGGTA CCTA AC TTCC G TAT AATG ATG AGT A TGTA TTC ATAA TCATCA TTTATATacctctaa ]
[+] EMBL SMAA28922 [ TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGC ACTCCAAATTCAGCAAATATATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTACTCATATTTATGTATAAATCTTAATGAT ACAATTAC AAAACAA ]
[+] EMBL SMAA25594 [ TTT GG AACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGC ACTCCAAATTCAGCAAAT AATATATGA ]
[+] EMBL SMAA25628 [ TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTG AGAGAAAAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATG AACATCTATTGAATTCAAAG AGAATTAGGCCA ]
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[-] EMBL CD073503 [ AACATCTATTGGAATTAAAGGAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAAT GTATCATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACTTTTTAT TATTATACTACTT AAATATAATAATGAGTAGTAACAAAATGTTAATTTTTAATCTTTTGAAGCGAGTTTTTGGATACGCATTGCTGAGAAGTCCCACAATAAGACGAAACGGCCATACAGTACTTCCAGGTTTTCCTTGATGGTCTAGCTTGAATTACCTGACGCTTTCAACTATGAGAATTTCCTTTTGTTTTGTGTTTTTCAAGTACTTAATATATGATATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||