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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9854#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 605 fasta sequence
[AGATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA-CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGGTCTTCATTGCTAGCCACATATCAAATTTACTGCAGATTATTTGC]
[+] EMBL CD084668 [AGATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGTATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGCGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGAT ]
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[+] EMBL CD084676 [ GAACAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGCATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGNTCTTCATTGCTAGCCACATATCAAATTTACTGCAGATTATT ]
[+] EMBL CD084673 [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGTATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGGT ]
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[+] EMBL CD084655 [ GATCAAGTGTAATATTTAGCGTTTGATCTAATCGGAAATATTTAGTGTTAATTAATGGAGTACCATTAATATAGGATAGATTGTTTTCATTAGTAATGAGTTGTGGTTCCTCAAGGTCAATATTCACGACCGTAGTGGATTAGTTTCTGTTGCTATATGTGCATCCTCAGTGGATTACCTCAATGTAACATTTGGTCGATAGTTATGATATAGTCGATATGAAGCTAGTAATAAAATCCAGAATAAGTATTTCTTCCTGTTTAAGATTTGTCATTAGGATGTACCTGTGTTCCAGAATCGATGTTCATTGGGAGCACATATATTAACATATACTAATAAGCTGTAATCCTGGACATGATGGACGAGAATTTACAAACATTTACTAATA CGTTCATGATAATTGAATGGTTTAGTGGATATCTGAACTCTGTAGTTCACAGGATAACACAGTAGCGTTTGAACCGAATGGTACAGGATTAAATTCTCAGTGTGATTATCAACTCTAGAAAATAGGTATGCCCACTTGATTGATCCGAGATGGAGTAAAATGTGCATCTTGGTCTTCATTGCTAGCCACATATCAAATTTACTGCAGATTATTTGC]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||