cluster # 9884

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Schistosoma mansoni
cluster # 9884 cluster # 9884 Sequences # 12 consensus # 3

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consensus_9884#0 length = 655 sequences # 9

consensus_9884#1 length = 611 sequences # 2
consensus_9884#2 length = 528 sequences # 1

consensusID : consensus_9884#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 655
fasta sequence

                              [CCCGGTACCCTGGCATGTGTGG-AAATCACGATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAAAATTCCGATCTCGAGG]

[+] EMBL CD168300             [CCCGGTACCCTGGCATGTGTGG AAATCACGATGCACGTATAGTTTTGGCT GTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGAAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAAAATTCCGATCTC    ]
[+] EMBL CD167941             [tcgGGTACCC   CAAGGGTGGNAAATCAGGATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAAATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCTTT                                          ]
[+] EMBL CD167998             [                                         AGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGCACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGCGTTGTAGATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCCTTTACACAAAAATTCCGATCTC    ]
[+] EMBL CD168186             [                                         AGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACA                    ]
[-] EMBL CD167842             [                                          GTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD147072             [                                                                     GCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCAATAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGTCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCT                                            ]
[-] EMBL CD147032             [                                                                                                                              ACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTACCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGCATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCT                                            ]
[-] EMBL CD067200             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTTTTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAAAATTCCGATCTCGAGG]
[-] EMBL CD066723             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTGATAAGCATTGGGCATTATTAGGTGAACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTCGCAGATGGATCAAATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACGCAAAAATTCCGATCGCG   ]




>consensus_9884#0
CCCGGTACCCTGGCATGTGTGGAAATCACGATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAAT
GTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCAC
GTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGA
CTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTGGAATATACATTTAGTAAAG
ATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCAT
TAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTC
GACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTT
TTGTGCCTTATTCAGTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCAAGT
ACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTGAAC
GGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGATCAA
ATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAAAATTCCGATCTCGAGG

consensusID : consensus_9884#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 611
fasta sequence

                              [GAATAAATTGGGTCATCGTGGAGAACAGAGCTTAAAACCTGGAGACCGTGTCGCATTGGTGTACGCTAATAATGAACCAATCAGTTTTCTGTGCGCATTTTATGGTTGTATTTTGGCCAGTGTTATTCCAATAGCAATCGAAGTTCCATCTCCTCGTCGAGATGCTTCATGTCAAAGTATGGGATTTTTATTAGGTAGTCAGCATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGCACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTCTTGTGCCTTATTCAGTAAT]

[-] EMBL CD067203             [GAATAAATTGGGTCATCGTGGAGAACAGAGCTTAAAACCTGGAGACCGTGTCGCATTGGTGTACGCTAATAATGAACCAATCAGTTTTCTGTGCGCATTTTATGGTTGTATTTTGGCCAGTGTTATTCCAATAGCAATCGAAGTTCCATCTCCTCGTCGAGATGCTTCATGTCAAAGTATGGGATTTTTATTAGGTAGTCAGCATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD096573             [                                                                GCTAATAATGAACCAATCAGTTTTCTGTGCGCATTTTATGGTTGTATTTTGGCCAGTGTTATTCCAATAGCAATCGAAGTTCCATCTCCTCGTCGAGATGCTTCATGTCAAAGTATGGGATTTTTATTAGGTAGTCAGGATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAAAGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGCACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTCTTGTGCCTTATTCAGTAAT]




>consensus_9884#1
GAATAAATTGGGTCATCGTGGAGAACAGAGCTTAAAACCTGGAGACCGTGTCGCATTGGT
GTACGCTAATAATGAACCAATCAGTTTTCTGTGCGCATTTTATGGTTGTATTTTGGCCAG
TGTTATTCCAATAGCAATCGAAGTTCCATCTCCTCGTCGAGATGCTTCATGTCAAAGTAT
GGGATTTTTATTAGGTAGTCAGCATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAA
AGCTTTACAACGTGGTCCTAATGGTGAGGTATTATCATTTTCTGGTTGGCCACGTGTTAC
ATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGACTCCTCC
TGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGCACTTGGAATATACATTTAGTAAAGATGGCAG
TGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTTTCTCACTGTCGAGCATTAACTGT
AGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCGTCGACAATA
GGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAATTCTTGTGCCT
TATTCAGTAAT

consensusID : consensus_9884#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 528
fasta sequence

                              [CAGTAAGTGGCAAAATATGCACGAATTCTCGTTCTGATCTCACTGATATGCCTCTCCACACTAGTTCAGTAAGAGGAGATATTTCTATCCATATGCTTACATATGGGGTCGTGCGTGTCGATACTGAAGATTGACTAACCTCACTTACTGTACAGGATTGTGGACAGGTTCTCCCATGAGCTTAGGCACTTGTCCTACGTTGGGGATGCAAACCGATACTTTGCCAAACTGATGAACATGGAGAAAGACGGTTATGTTCATTACGTATGCTACTATGTGCATATGGATCAAATCCGTGGTATTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAGAAATTCCGATCTCGAGGATTTTCTCCTGATGCCATCTGTCCATGCACTGGAAGTTCAGAAACACTAACACTTTGTTTACGTCGTCCACCTCATCAAATAAATTCAGTAAATGGCAAAATATGCACAAATTCTCGTTCTGATTCACTTATAGCCTCTCCACCTAGTTCAGTAAGAGGAGTTATTTCGATCTATAGTCTT]

[+] EMBL CD123325             [CAGTAAGTGGCAAAATATGCACGAATTCTCGTTCTGATCTCACTGATATGCCTCTCCACACTAGTTCAGTAAGAGGAGATATTTCTATCCATATGCTTACATATGGGGTCGTGCGTGTCGATACTGAAGATTGACTAACCTCACTTACTGTACAGGATTGTGGACAGGTTCTCCCATGAGCTTAGGCACTTGTCCTACGTTGGGGATGCAAACCGATACTTTGCCAAACTGATGAACATGGAGAAAGACGGTTATGTTCATTACGTATGCTACTATGTGCATATGGATCAAATCCGTGGTATTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAGAAATTCCGATCTCGAGGATTTTCTCCTGATGCCATCTGTCCATGCACTGGAAGTTCAGAAACACTAACACTTTGTTTACGTCGTCCACCTCATCAAATAAATTCAGTAAATGGCAAAATATGCACAAATTCTCGTTCTGATTCACTTATAGCCTCTCCACCTAGTTCAGTAAGAGGAGTTATTTCGATCTATAGTCTT]




>consensus_9884#2
CAGTAAGTGGCAAAATATGCACGAATTCTCGTTCTGATCTCACTGATATGCCTCTCCACA
CTAGTTCAGTAAGAGGAGATATTTCTATCCATATGCTTACATATGGGGTCGTGCGTGTCG
ATACTGAAGATTGACTAACCTCACTTACTGTACAGGATTGTGGACAGGTTCTCCCATGAG
CTTAGGCACTTGTCCTACGTTGGGGATGCAAACCGATACTTTGCCAAACTGATGAACATG
GAGAAAGACGGTTATGTTCATTACGTATGCTACTATGTGCATATGGATCAAATCCGTGGT
ATTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAGAAATTCCGATCTCGAGGATTTTCTCCTGAT
GCCATCTGTCCATGCACTGGAAGTTCAGAAACACTAACACTTTGTTTACGTCGTCCACCT
CATCAAATAAATTCAGTAAATGGCAAAATATGCACAAATTCTCGTTCTGATTCACTTATA
GCCTCTCCACCTAGTTCAGTAAGAGGAGTTATTTCGATCTATAGTCTT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9884#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9884#1      GAATAAATTGGGTCATCGTGGAGAACAGAGCTTAAAACCTGGAGACCGTGTCGCATTGGT 60
consensus_9884#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9884#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9884#1      GTACGCTAATAATGAACCAATCAGTTTTCTGTGCGCATTTTATGGTTGTATTTTGGCCAG 120
consensus_9884#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9884#0      -------------------------------------------------CCCGGTACCCT 11
consensus_9884#1      TGTTATTCCAATAGCAATCGAAGTTCCATCTCCTCGTCGAGATGCTTCATGTCAAAGTAT 180
consensus_9884#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9884#0      GGCATGTGT----GGAAATCACGATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAA 67
consensus_9884#1      GGGATTTTTATTAGGTAGTCAGCATGCACGTATAGTTTTGGCTAGTGAGCAATGTTATAA 240
consensus_9884#2      -----------CAGTAAGTGGCAAAATATGCACGAATTCTCGTTCTGATCTCACTGATAT 49
                                   *  * *    *   * * *    **    *  *** *    * *** 

consensus_9884#0      AGCTTTACAACGTGGTCCTA-ATGGTGAGGTATTATCATTT-TCTGGTTGGCCACGTG-T 124
consensus_9884#1      AGCTTTACAACGTGGTCCTA-ATGGTGAGGTATTATCATTT-TCTGGTTGGCCACGTG-T 297
consensus_9884#2      GCCTCTCCACACTAGTTCAGTAAGAGGAGATATTTCTATCCATATGCTTACATATGGGGT 109
                        ** * **   * ** *   * *  *** ****   **   * ** **    * * * *

consensus_9884#0      TACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGAC--- 181
consensus_9884#1      TACATGGATTAATACAGACCATCATGCTAGTGGAACTAAACCACCGAAAGATTGGAC--- 354
consensus_9884#2      CGTGCGTGTCGATACTGAAGATTG-ACTAACCTCACTTACTGTACAGGATTGTGGACAGG 168
                           *  *  **** **  **    ***     *** *     *   *   *****   

consensus_9884#0      TCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGTACTTG-GAATATACATTTAGTAAAG 240
consensus_9884#1      TCCTCCTGATCGATTATCAAATGATGCAACCATGCACTTG-GAATATACATTTAGTAAAG 413
consensus_9884#2      TTCTCCCATGAGCTTAGGCACTTGTCCTACGTTGGGGATGCAAACCGATACTTTGCCAAA 228
                      * ****     * ***   * *  * * **  **    **  **   * * ** *  ** 

consensus_9884#0      ATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTT-TCTCACTGTCGAGCA 299
consensus_9884#1      ATGGCAGTGTACATGGTGTAATGATAAGTCGACGTGCAGCACTT-TCTCACTGTCGAGCA 472
consensus_9884#2      CTGA---TGAACATGGAG-AAAGACGGTT--ATGTTCATTACGTATGCTACTAT-GTGCA 281
                       **    ** ****** * ** **    *  * ** **  ** * *   *** * * ***

consensus_9884#0      T-TAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCG 358
consensus_9884#1      T-TAACTGTAGCTTGTAATTATTCTGAAGAGGATGTTGTTGTCTGTGTTGTAGATTGCCG 531
consensus_9884#2      TATGGATCAAATCCGTGGTATTT---AAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAGAAATTCCG 338
                      * *   *  *    **  *  **   **     **   ** * *         * * ***

consensus_9884#0      TCGACAAATAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAAT 418
consensus_9884#1      TCGACAA-TAGGATTATGGCATGCTGTTTTGACGAGCGTCTTCAATGGGTTACATGTAAT 590
consensus_9884#2      ATCTCGA---GGATTTTCTCCTGATGCC---ATCTGTCCATGCACTGGAAGTTCAGAAAC 392
                          * *   ***** *  * ** **     *   *    * ** ***       * ** 

consensus_9884#0      TTTTGTGCCTTATTCA-GTAATGCAAGTTGATCCTGGCTCTTGGTTACGTATGGTTACCA 477
consensus_9884#1      TCTTGTGCCTTATTCA-GTAAT-------------------------------------- 611
consensus_9884#2      ACTAACACTTTGTTTACGTCGTCCA------CCTCATCAAATAAATTCAGTAAATGGCAA 446
                        *    * ** ** * **  *                                      

consensus_9884#0      AGTACCGAGCAACTGTTGCTATTGTAAAAAGTCGTGATATGCATTGGGCATTATTAGCTG 537
consensus_9884#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9884#2      AATATGCACAAATTCTCGTTCTGATTCAC-----TTATAGCCTCTCCACCTAGTTCAGTA 501
                                                                                  

consensus_9884#0      AACGGGATCATCCTAATGTAAACTTATCTTCATTACGTATGCTTCTAGTTGCAGATGGAT 597
consensus_9884#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9884#2      AGAGGAGTTATTTCGATCTATAGTCTT--------------------------------- 528
                                                                                  

consensus_9884#0      CAAATCCTTGGTCTTTAAACTCTTGCGATTCTTTTACACAAAAATTCCGATCTCGAGG 655
consensus_9884#1      ----------------------------------------------------------
consensus_9884#2      ----------------------------------------------------------