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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9888#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 472 fasta sequence
[GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG-ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG-T-AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA-AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT]
[+] EMBL CD179844 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAAATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTNCTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCT ]
[+] EMBL CD179712 [GAAGAAGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTGNACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACT ]
[+] EMBL CD184685 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTTACGCACGTCTTCATCGTACA ]
[+] EMBL CD179788 [GAAGACGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATA ]
[+] EMBL CD179754 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTT ]
[+] EMBL CD179752 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCGAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTAG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAGATGAAATATGG ATTG ]
[+] EMBL CD179775 [tAAGAGGATAATGATGATGATGAGGAGGAGGATGAATATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTGCAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCATAGTATATTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTGTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATGCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACC ]
[+] EMBL CD179793 [cAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTTTGGTTG ACTGGACTGAAg ]
[-] EMBL CD184839 [ AAGAACATGGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT]
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[-] EMBL CD179679 [ agAACACATTGAAAATGTCGGTTTG TCTGTACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAANAATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACGTTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT]
[+] EMBL CD179830 [ AGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||