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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9953#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 1322 fasta sequence
[AATTGCCAAAATGCACCTTTACCAGGTTCCGATTGAGAACGTGGTACACGGATAAAATAACGATTTAATGATAAATTATGACGTATTGAATTCTGCCAACCTTTTTCATGTGGTTTATAATATGGAAATGTTTTTGAAATATGAGCGTAGATATCAGCTAAAGTTAGACGTTGATTAGGCGCCGATGCGATAGCTTGAATAATTAATTGAGCATAAGAATAAGGCGGTTTACGGAACGTTGAGCCTCGATCAATTGCGGTTGTTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGACTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA-TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG-TTAGAGTACTAC-TTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTTTGAAACA-GTGATTC-ACCAT-CGATATTTAAGGATTTAGGTTGATTATCATTTTGAATAAGATTCTGAAGGACTGTTGTAGTTGCTGTGATGGCTGGAATATTAAAATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCTTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATGATCACGATGTTGGTACTCGGAAACCTTAGTTTACACCCATCAGCTAAAAGAACAAAATCCGGCTTCCCAACGTGAAAGGATCCGTCTATGAAAATTCCATTTTTACTAAGACATCTAAGATA]
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[+] EMBL CD065708 [ ATTGCGGT TTGAAGCTAAATTTGCAGCTAACTTATTAATAGTTGATTCGTTTTCTTGAGTACTACAAGTATTATTATTATTACCATCGTCATTACGATGATCATTACAATATGTTGTGATATCCTGGTGTACTGCGGCTACACTTGAATCGACAGTGTCATCTAAATCGTCCACCGTCAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG TTAGAGTACTAC TTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTTTGAAACA GTGATTC ACCAT CGATATTTACGGATTTAGGTTGATTATCCATTTGAATAAGATT ]
[-] EMBL CD123149 [ CAAGGTGTTTTGTTCAATGATATCGGA TTTTTTAAATTGAGATTCTGGAGAGTTAGATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGTACAATTGTGTTCAGTTGATATGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCAATAAGTTAGATAATG TTAGAGTAATAC TTTTGTGTGCATTCAGGTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCTAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATGTGAATTTTCTCTTTGAAACAGGTTATTCGACCATCCGATATTTAAGGATTTAGGTTGATTATCATTTTGAATAAGATTCTGAAGGACTGTTGTAGTTGCTGTGATGGCTGGAATATTAA ]
[+] EMBL CD186645 [ ATGATAATACGAAGGGGTTCTTCATTAAATCTGATAAGCCATGGTCGAACGTAGAACAATTGTGTTCAGTTGATCTGGAGTCATATAGTTGATGAGAAGGAAAATTCACTAAGTTAGATAATG TTAGAGTACTAC TTTTGTGTGCATTCAACTGGGATAGCTGTGCAAGTGAATTAAAAGCAAACAATCTTGCGATATGATTCATTTTAGTTGTAACATCTGAATTTTCACTTTGAAACA GTGATTC ACCAT CGATATTTAAGGATTTAGGTTGATTATCATTTTGAATAAGATTCTGAAGGACTGTTGTAGCTGCTCTGATGGCTGGAATATTAAAATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAAACCTGA ]
[+] EMBL CD111669 [ TTAAAATGTTGATCTG TTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCCTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATGATCACGATGTTGGTACTCGGAAACCTTAGTTTACACCCATCAGCTAAAAGAACAAAATCCGGCTTCCCAACGTGAAAGGATCCGTCTATGAAAATTCCATTTTTACTAAGACATCTAAGATA]
[+] EMBL CD158495 [ AAATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCTTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGAT ]
[-] EMBL CD158630 [ AATGTTGATCTGTTTGTACAAATAATGGTTCAACTGGTAATAAAGCACAGTTTGAGGTGGCTGAACCCTGAAGACTATTAAGGGATAGATCCGAAATAGTATTCTGATTATCAATTTTTAAGTTGTTACATGAAACATCATGTCTTTCTTCGGGAGTATTTCGACAATTTTCTGACTCAAAGCAAAATGAAGAATGGGAATTTTCTTCAAATCCTTTGGATTTTAGAATTGGTGAAATGACTGGATCTGTCATATTTCTATTGTTTTGATCAGTACTCAATGTAGGCTCGCCACGATTGGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATG ]
[-] EMBL CD158898 [ GGTGTGATCGAGTGAAGATCTCCAAGATGCCCGCTTTTTAGGATGGCAAAATGGTTCCAGCTCGACTACTTCTACGATGATCACGATGTTGGTACTCGGAAACCTTAGTTTACACCCATCAGCTAAAAGAACAAAATCCGGCTTCCCAACGTGAAAGGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||