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Anopheles gambiae
cluster # 1495 cluster # 1495       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1495#0 length = 1182 sequences # 2  

consensusID : consensus_1495#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1182
fasta sequence
                              [CCGAACGGGGGTAGTGCTAAAAGTGACGAATAATGCGGGTGCTATTTAAAAAAAAAACACACACACTCACAATAAACAAGCAGCAGAGCCAATGCATAACAATTGTTTCTTTCCCTACTCTCTATCCATTTATCTCTAAACCTTCCCGTTTTTTATCACATTTCATTCAACTTTCTACATTCAACCACAAGTGGACGGGACAGAAGAAGTATGTGATGAAATAGTGCATCTCTATAGAAAACGAAAATAAAATAACATAAATCTCCGCTGTCAAAATAGAAACAAAAGATGATGATGATGAAAACAAAAAATACCACAATTAAAACATAAAACATAAATAAAAGGCGCCCAAATCATGCCAACGTTCTCTTTCTCTACCTTTTTCGTACCCATAGAGATGATGAATCTTAAAGTGTGCGTGTGTGTGTATAAGTGTGTGATAGGATAAAAAAGAGAGAGAGAGGAAAACAATAGTAACAAGTAGAAGGACCGTACCATACGAATGGGATGAATTCAACCACAACAAACGTACACTGCTGCAAAC-GGGG--GTAGTGCTAAAAGTGACGAATAATGCGGGTGCTATTTAAAAG-AAAAAAAACACTAGTAAAAGGACTAGCAGAGAAAAGGAAAGGGGAACTAGTAAAGGAAGCTCGGACGATAGTGGATAGGTGGATAGAAGGACAAGTTGTAAAATATTACTTAATACAAATAATAAAAGTATGATACAAATGAATTGTACAGTTTTGTCTTTTGTACTTAAATGATTCAAAAAAACACACACACACACGGTTTGGTTTTTTTTAAAATTAATAGATCCTTCTCTCTTATCTTATGTTAACAATTATCTTTTGCTACCAATTCTCTTACTTTAATGAACTACACATCAGATATTTACTAATTGCATATATCTATGTTTGATAATGTGCTCAGATATTACATATCTTCTTCATTCCTTTTAAATTCGTTGTTACACACACGGACTTTTCCATGAGTTGTTCTATTCTATTGTATTTCTTTTTTATTAATGATTCCTCTTGAAGCTGACTGTAATATTCTATATTTTTCAGTCTTAAAATATTATGGCAGCTTATCTGTTATTATTATTATTGTTGTTCTTATATATAAACATAACACAATATTTAAAATACTTAAAACTTAATTGAACTTATTTTTTCTTTCATA]

[+] EMBL BM648805             [CCGAACGGGGGTAGTGCTAAAAGTGACGAATAATGCGGGTGCTATTTAAAAAAAAAACACACACACTCACAATAAACAAGCAGCAGAGCCAATGCATAACAATTGTTTCTTTCCCTACTCTCTATCCATTTATCTCTAAACCTTCCCGTTTTTTATCACATTTCATTCAACTTTCTACATTCAACCACAAGTGGACGGGACAGAAGAAGTATGTGATGAAATAGTGCATCTCTATAGAAAACGAAAATAAAATAACATAAATCTCCGCTGTCAAAATAGAAACAAAAGATGATGATGATGAAAACAAAAAATACCACAATTAAAACATAAAACATAAATAAAAGGCGCCCAAATCATGCCAACGTTCTCTTTCTCTACCTTTTTCGTACCCATAGAGATGATGAATCTTAAAGTGTGCGTGTGTGTGTATAAGTGTGTGATAGGATAAAAAAGAGAGAGAGAGGAAAACAATAGTAACAAGTAGAAGGACCGTACCATACGAATGGGATGAATTCAACCACAACAAACGTACACTGCTGCAAAC GGGG  GTAGTGCTAAAAGTGACGAATAATGCGGGTGCTATTTAAAAG AAAAAAAACACTAGTAAAAGGACTAGCAGAGAAAAGGAAAGGGGAACTAGTAAAGGAAGCTCGGACGATAGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX621762             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATCTTAAAGT    GTGTGTGTGTATAAGTGTGTGATAGGATAAAAAAGAGAGAGAGAGGAAAACAATAGTAACAAGTAGAAGGACCGTACCATACGAATGGGATGAATTCAACCACAACAAACGTACACTGCTGCAAACAGGGGTAGTAGTGCTAAAAGTGACGAATAATGCGGGTGCTATTTAAAAGAAAAAAAAACACTAGTAAAAGGACTAGCAGAGAAAAGGAAAGGGGAACTAGTAAAGGAAGCTCGGACGATAGTGGATAGGTGGATAGAAGGACAAGTTGTAAAATATTACTTAATACAAATAATAAAAGTATGATACAAATGAATTGTACAGTTTTGTCTTTTGTACTTAAATGATTCAAAAAAACACACACACACACGGTTTGGTTTTTTTTAAAATTAATAGATCCTTCTCTCTTATCTTATGTTAACAATTATCTTTTGCTACCAATTCTCTTACTTTAATGAACTACACATCAGATATTTACTAATTGCATATATCTATGTTTGATAATGTGCTCAGATATTACATATCTTCTTCATTCCTTTTAAATTCGTTGTTACACACACGGACTTTTCCATGAGTTGTTCTATTCTATTGTATTTCTTTTTTATTAATGATTCCTCTTGAAGCTGACTGTAATATTCTATATTTTTCAGTCTTAAAATATTATGGCAGCTTATCTGTTATTATTATTATTGTTGTTCTTATATATAAACATAACACAATATTTAAAATACTTAAAACTTAATTGAACTTATTTTTTCTTTCATA]


>consensus_1495#0 CCGAACGGGGGTAGTGCTAAAAGTGACGAATAATGCGGGTGCTATTTAAAAAAAAAACAC ACACACTCACAATAAACAAGCAGCAGAGCCAATGCATAACAATTGTTTCTTTCCCTACTC TCTATCCATTTATCTCTAAACCTTCCCGTTTTTTATCACATTTCATTCAACTTTCTACAT TCAACCACAAGTGGACGGGACAGAAGAAGTATGTGATGAAATAGTGCATCTCTATAGAAA ACGAAAATAAAATAACATAAATCTCCGCTGTCAAAATAGAAACAAAAGATGATGATGATG AAAACAAAAAATACCACAATTAAAACATAAAACATAAATAAAAGGCGCCCAAATCATGCC AACGTTCTCTTTCTCTACCTTTTTCGTACCCATAGAGATGATGAATCTTAAAGTGTGCGT GTGTGTGTATAAGTGTGTGATAGGATAAAAAAGAGAGAGAGAGGAAAACAATAGTAACAA GTAGAAGGACCGTACCATACGAATGGGATGAATTCAACCACAACAAACGTACACTGCTGC AAACGGGGGTAGTGCTAAAAGTGACGAATAATGCGGGTGCTATTTAAAAGAAAAAAAACA CTAGTAAAAGGACTAGCAGAGAAAAGGAAAGGGGAACTAGTAAAGGAAGCTCGGACGATA GTGGATAGGTGGATAGAAGGACAAGTTGTAAAATATTACTTAATACAAATAATAAAAGTA TGATACAAATGAATTGTACAGTTTTGTCTTTTGTACTTAAATGATTCAAAAAAACACACA CACACACGGTTTGGTTTTTTTTAAAATTAATAGATCCTTCTCTCTTATCTTATGTTAACA ATTATCTTTTGCTACCAATTCTCTTACTTTAATGAACTACACATCAGATATTTACTAATT GCATATATCTATGTTTGATAATGTGCTCAGATATTACATATCTTCTTCATTCCTTTTAAA TTCGTTGTTACACACACGGACTTTTCCATGAGTTGTTCTATTCTATTGTATTTCTTTTTT ATTAATGATTCCTCTTGAAGCTGACTGTAATATTCTATATTTTTCAGTCTTAAAATATTA TGGCAGCTTATCTGTTATTATTATTATTGTTGTTCTTATATATAAACATAACACAATATT TAAAATACTTAAAACTTAATTGAACTTATTTTTTCTTTCATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)