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Anopheles gambiae
cluster # 2953 cluster # 2953       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2953#0 length = 1206 sequences # 2  

consensusID : consensus_2953#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1206
fasta sequence
                              [CCGATTTCGTGCCACTTGATTCTTGATTACGGAGATGGTTTGTTTGCCAAAAAAAAAATAAGAAGCTTAAAGCACACACGTATTTCCCAGCATATGGGCTACAACCAAAACAGGTTTCAAGGATATGCTACCTTGCTGCAAGCTGTTTCGTTCTTTTAACAAACGATCCTCACGTGAAGGAATTGTCAAAAAAAAGCTCCAGTTTGTTGAAAACTATTTGTAGCCATTTTTGTAACCAAATTCAATCGATGAGCTTTATTTCTCGTCGATCATTTAATCGATTTTCTGTTTTCAACACGTTCGAACCACCATTGGCAAAACTTACGATGCTACGATTTAATATAAGGCATGGGAGAAGCAAATTTCAACAAAATTGTGATTTAAGCACTACGGAGTCAATAAATTTGACACGTAAATGGTTACACGGGAAACACCACGAAGTAGACAAAATTCATTATATATTGGCAATACTCAAACTGACGGAAAACGGGCTAAATTTCAACGTTGTTCAGTGAAGAAGGCCACAAAATTGTGATTAAATTTTACATTGCTTCGAGCATTCAGAATCGATAATCGGAATCAAAATTCAGACTAACTGAACTACAGTGGTCACACACACAACCGAGAGGTGCT-AAATAATTAGGAATTTGTAACGAAACTAACACTGCATACTTTGGGGATTGGATAGATTTTAGCATTTATTCTCCCAATTGAAGCTATTGGGGATGCAACGACTCGTAATTAATGGCAAGCTTGTTTGATAAACCTTAACAAATGGTGCTTGGCGAACATTTTACGAAGGACTCATCAGACGAGTCACCAACGCGTAACAGTAAGGTTAAATTCGCTTCACGTGTTGTTTCCTTTTGGATCATGAGCTTTGATTTTTGTAAATAGTAGACAAAGAACATGAACAACGTGCACACCCACTAACTCGGATGAGAAATTGTTATTTTGTTGTTATCATCTCTCTTCGGCATCAAATGTATGTGTGCACCAGTTGTGCTTCTTTAGTGGACGATGGGTTATACGAAGAGACGAATTGTTTACATCGTTTAGAGAATGTTTATACCTTCTTTCCTCATTTCACATGGAAAAAATGGCAGTAGAAAATTAAGCTTTTATACAACTTTTGGGCGACNACATGGCAAAATATGTTTCGATCGATGTTGCATCGATGGCCAACTGAATNCAATGAATATTTAC]

[+] EMBL BM657798             [CCGATTTCGTGCCACTTGATTCTTGATTACGGAGATGGTTTGTTTGCCAAAAAAAAAATAAGAAGCTTAAAGCACACACGTATTTCCCAGCATATGGGCTACAACCAAAACAGGTTTCAAGGATATGCTACCTTGCTGCAAGCTGTTTCGTTCTTTTAACAAACGATCCTCACGTGAAGGAATTGTCAAAAAAAAGCTCCAGTTTGTTGAAAACTATTTGTAGCCATTTTTGTAACCAAATTCAATCGATGAGCTTTATTTCTCGTCGATCATTTAATCGATTTTCTGTTTTCAACACGTTCGAACCACCATTGGCAAAACTTACGATGCTACGATTTAATATAAGGCATGGGAGAAGCAAATTTCAACAAAATTGTGATTTAAGCACTACGGAGTCAATAAATTTGACACGTAAATGGTTACACGGGAAACACCACGAAGTAGACAAAATTCATTATATATTGGCAATACTCAAACTGACGGAAAACGGGCTAAATTTCAACGTTGTTCAGTGAAGAAGGCCACAAAATTGTGATTAAATTTTACATTGCTTCGAGCATTCAGAATCGATAATCGGAATCAAAATTCAGACTAACTGAACTACAGTGGTCACACACACAACCGAGAGGTGCT AAATAATTAGGAATTTGTAACGAAACTAACACTGCATACTTTGGGGATTGGATAGATTTTAGCATTTATTCTCCCAATTGAAGCTATTGGGGATGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX627831             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCTAAATTTCAACGTTGTTCAGTGAAGAAGGCCACAAAATTGTGATTAAATTTTACATTGCTTCGAGCATTCAGAATCGATAATCGGAATCAAAATTCAGACTAACTGAACTACAGTGTTCACACACACAACCGAGAGGTGCTAAAATAATTAGGAATTTGTAACAAAACTAAAACTGCATACTTT GTGATTGGATAGATTTTAGCATTTATTTTCCAAATTGAAGCTATTGGGGATGCAACGACTCGTAATTAATGGCAAGCTTGTTTGATAAACCTTAACAAATGGTGCTTGGCGAACATTTTACGAAGGACTCATCAGACGAGTCACCAACGCGTAACAGTAAGGTTAAATTCGCTTCACGTGTTGTTTCCTTTTGGATCATGAGCTTTGATTTTTGTAAATAGTAGACAAAGAACATGAACAACGTGCACACCCACTAACTCGGATGAGAAATTGTTATTTTGTTGTTATCATCTCTCTTCGGCATCAAATGTATGTGTGCACCAGTTGTGCTTCTTTAGTGGACGATGGGTTATACGAAGAGACGAATTGTTTACATCGTTTAGAGAATGTTTATACCTTCTTTCCTCATTTCACATGGAAAAAATGGCAGTAGAAAATTAAGCTTTTATACAACTTTTGGGCGACNACATGGCAAAATATGTTTCGATCGATGTTGCATCGATGGCCAACTGAATNCAATGAATATTTAC]


>consensus_2953#0 CCGATTTCGTGCCACTTGATTCTTGATTACGGAGATGGTTTGTTTGCCAAAAAAAAAATA AGAAGCTTAAAGCACACACGTATTTCCCAGCATATGGGCTACAACCAAAACAGGTTTCAA GGATATGCTACCTTGCTGCAAGCTGTTTCGTTCTTTTAACAAACGATCCTCACGTGAAGG AATTGTCAAAAAAAAGCTCCAGTTTGTTGAAAACTATTTGTAGCCATTTTTGTAACCAAA TTCAATCGATGAGCTTTATTTCTCGTCGATCATTTAATCGATTTTCTGTTTTCAACACGT TCGAACCACCATTGGCAAAACTTACGATGCTACGATTTAATATAAGGCATGGGAGAAGCA AATTTCAACAAAATTGTGATTTAAGCACTACGGAGTCAATAAATTTGACACGTAAATGGT TACACGGGAAACACCACGAAGTAGACAAAATTCATTATATATTGGCAATACTCAAACTGA CGGAAAACGGGCTAAATTTCAACGTTGTTCAGTGAAGAAGGCCACAAAATTGTGATTAAA TTTTACATTGCTTCGAGCATTCAGAATCGATAATCGGAATCAAAATTCAGACTAACTGAA CTACAGTGGTCACACACACAACCGAGAGGTGCTAAATAATTAGGAATTTGTAACGAAACT AACACTGCATACTTTGGGGATTGGATAGATTTTAGCATTTATTCTCCCAATTGAAGCTAT TGGGGATGCAACGACTCGTAATTAATGGCAAGCTTGTTTGATAAACCTTAACAAATGGTG CTTGGCGAACATTTTACGAAGGACTCATCAGACGAGTCACCAACGCGTAACAGTAAGGTT AAATTCGCTTCACGTGTTGTTTCCTTTTGGATCATGAGCTTTGATTTTTGTAAATAGTAG ACAAAGAACATGAACAACGTGCACACCCACTAACTCGGATGAGAAATTGTTATTTTGTTG TTATCATCTCTCTTCGGCATCAAATGTATGTGTGCACCAGTTGTGCTTCTTTAGTGGACG ATGGGTTATACGAAGAGACGAATTGTTTACATCGTTTAGAGAATGTTTATACCTTCTTTC CTCATTTCACATGGAAAAAATGGCAGTAGAAAATTAAGCTTTTATACAACTTTTGGGCGA CNACATGGCAAAATATGTTTCGATCGATGTTGCATCGATGGCCAACTGAATNCAATGAAT ATTTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)