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Anopheles gambiae
cluster # 3312 cluster # 3312       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3312#0 length = 730 sequences # 3  

consensusID : consensus_3312#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 730
fasta sequence
                              [CCGGTGGATCGTCCATCGGATCAGTGTGCCCAATCTGCGGTTGGTTGTGCGTGCCGTTGATACTTCCTTGCTGCCGTGTGCTGCCACTAGATCAACGCGTGAAGAATGAATCCGGTGCTGTGTGACTTCATTGCCGGTTCCTTCGGTGGTGCCTGCGGTCTGCTGGTGGGTCATCCGATGGACACAATTAAGGCATGGCAGCAGAACTCTAACTACGGCATGGGCAGCGCAATGTACAACATCATCATACGCAACAACGGTCTGCGAGGCTTCTACCGTGGAATGTACTTCCCGCTCCTTTCCAACGGTGCTCTCAACTCGGTCGTCTTTGCCGTCTACGGTTCCCATTTGCGCTATCTGCAGAAGCACACTCGTTCGGATAGGCTGCGGAAGGCGTATTGGAGGAAGCATGTGTTTTTCGCCGGTTCTATGGCCGGTCTAGCGCAAGTGTTTCTGGCCTGCCCGATCGAAGTGGTGAAGGTGCGACTTCAGACACTATCCTTCATTGGACATCCCTGGGCCTGCCTGAAGGACATCTTCCGGCGCGAGGGCTTCTCGGGGATCTACCGCGGCATTACGCCGATGATGTTCCGGGACGTGCTGCCGTACGGTGTGTACATGTATGTGTACGAGTACATGCTGGAGATTGAGGAACGATTGCACCGGCTCAGCAAGGAGCGGCTTACTGGTGTCCCGGTCGGTGGCGCACTGCAGGCATCGTTGATCGCAA]

[+] EMBL BM645981             [CCGGTGGATCGTCCATCGGATCAGTGTGCCCAATCTGCGGTTGGTTGTGCGTGCCGTTGATACTTCCTTGCTGCCGTGTGCTGCCACTAGATCAACGCGTGAAGAATGAATCCGGTGCTGTGTGACTTCATTGCCGGTTCCTTCGGTGGTGCCTGCGGTCTGCTGGTGGGTCATCCGATGGACACAATTAAGGCATGGCAGCAGAACTCTAACTACGGCATGGGCAGCGCAATGTACAACATCATCATACGCAACAACGGTCTGCGAGGCTTCTACCGTGGAATGTACTTCCCGCTCCTTTCCAACGGTGCTCTCAACTCGGTCGTCTTTGCCGTCTACGGTTCCCATTTGCGCTATCTGCAGAAGCACACTCGTTCGGATAGGCTGCGGAAGGCGTATTGGAGGAAGCATGTGTTTTTCGCCGGTTCTATGGCCGGTCTAGCGCAAGTGTTTCTGGCCTGCCCGATCGAAGTGGTGAAGGTGCGACTTCAGACACTATCCTTCATTGGACATCCCTGGGCCTGCCTGAAGGACATCTTCCGGCGCGAGGGCTTCTCGGGGATCTACCGCGGCATTACGCCGATGATGTTCCGGGACGTGCTGCCGTACGGTGTGTACATGTATGTGTACGAGTACATGCTGGAGATTGAGGAACGATTGCACCGGCTCAGCAAGGA                                                     ]
[+] EMBL BM624400             [CCGGTGGATCGTCCATCGGATCAGTGTGCCCAATCTGCGGTTGGTTGTGCGTGCCGTTGATACTTCCTTGCTGCCGTGTGCTGCCACTAGATCAACGCGTGAAGAATGAATCCGGTGCTGTGTGACTTCATTGCCGGTTCCTTCGGTGGTGCCTGCGGTCTGCTGGTGGGTCATCCGATGGACACAATTAAGGCATGGCAGCAGAACTCTAACTACGGCATGGGCAGCGCAATGTACAACATCATCATACGCAACAACGGTCTGCGAGGCTTCTACCGTGGAATGTACTTCCCGCTCCTTTCCAACGGTGCTCTCAACTCGGTCGTCTTTGCCGTCTACGGTTCCCATTTGCGCTATCTGCAGAAGCACACTCGTTCGGATAGGCTGCGGAAGGCGTATTGGAGGAAGCATGTGTTTTTCGCCGGTTCTATGGCCGGTCTAGCGCAAGTGTTTCTGGCCTGCCCGATCGAAGTGGTGAAGGTGCGACTTCAGACACTATCCTTCATTGGACATCCCTGGGCCTGCCTGAAGGACATCTTCCGGCGCGAGGGCTTCTCGGGGATCTACCGCGGCATTACGCCGATGATGTTCCGGGACGTGCTGCCG                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX620982             [                                               TGCGTGCCGTTNATCCTTCCTTGCTGCCGTGTGCTGCCACTAGATCAACGCGTGAAGAATGAATCCGGTGCTGTGTGACTTCATTGCCGGTTCCTTCGGTGGTGCCTGCGGTCTGCTGGTGGGTCATCCGATGGACACAATTAAGGCATGGCAGCAGAACTCAAACTACGGCATGGGCAGCGCAATGTACAACATCATCATACGCAACAACGGTCTGCGAGGCTTCTACCGTGGAATGTACTTCCCGCTCCTTTCCAACGGTGCTCTCAACTCGGTCGTCTTTGCCGTCTACGGTTCCCATTTGCGCTATCTGCAGAAGCACACTCGTTCGGATAGGCTGCGGAAGGCGTATTGGAGGAAGCATGTGTTTTTCGCCGGTTCTATGGCCGGTCTAGCGCAAGTGTTTCTGGCCTGCCCGATCGAAGTGGTGAAGGTGCGACTTCAGACACTATCCTTCATTGGACATCCCTGGGCCTGCCTGAAGGACATCTTCCGGCGCGAGGGCTTCTCGGGGATCTACCGCGGCATTACGCCGATGATGTTCCGGGACGTGCTGCCGTACGGTGTGTACATGTATGTGTACGAGTACATGCTAGAGATTGAGGAACGATTGCACCGGCTCAGCAAGGAGCGGCTTACTGGTGTCCCGGTCGGTGGCGCACTGCAGGCATCGTTGATCGCAA]


>consensus_3312#0 CCGGTGGATCGTCCATCGGATCAGTGTGCCCAATCTGCGGTTGGTTGTGCGTGCCGTTGA TACTTCCTTGCTGCCGTGTGCTGCCACTAGATCAACGCGTGAAGAATGAATCCGGTGCTG TGTGACTTCATTGCCGGTTCCTTCGGTGGTGCCTGCGGTCTGCTGGTGGGTCATCCGATG GACACAATTAAGGCATGGCAGCAGAACTCTAACTACGGCATGGGCAGCGCAATGTACAAC ATCATCATACGCAACAACGGTCTGCGAGGCTTCTACCGTGGAATGTACTTCCCGCTCCTT TCCAACGGTGCTCTCAACTCGGTCGTCTTTGCCGTCTACGGTTCCCATTTGCGCTATCTG CAGAAGCACACTCGTTCGGATAGGCTGCGGAAGGCGTATTGGAGGAAGCATGTGTTTTTC GCCGGTTCTATGGCCGGTCTAGCGCAAGTGTTTCTGGCCTGCCCGATCGAAGTGGTGAAG GTGCGACTTCAGACACTATCCTTCATTGGACATCCCTGGGCCTGCCTGAAGGACATCTTC CGGCGCGAGGGCTTCTCGGGGATCTACCGCGGCATTACGCCGATGATGTTCCGGGACGTG CTGCCGTACGGTGTGTACATGTATGTGTACGAGTACATGCTGGAGATTGAGGAACGATTG CACCGGCTCAGCAAGGAGCGGCTTACTGGTGTCCCGGTCGGTGGCGCACTGCAGGCATCG TTGATCGCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)