cluster # 3385

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Anopheles gambiae
cluster # 3385 cluster # 3385 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3385#0 length = 767 sequences # 3

consensusID : consensus_3385#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 767
fasta sequence

                              [CCGTTAACAACCAATAGTGATCGCTACCCTACTCCACCATCGCCTTTTTCTTCCTTCCCCACCTTCTGGGTTCGATAGTCCCCGAGCTGTCTGCTTCCCGGTATAAATGAGGAAGTCCTCCACCCCCCCGTGGCAGAAAATTCGTACTGTCGATATATAGTTAAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATCAAGCTTTAACGAGTAGAGAACACTAAATAACCCAGCTCTCCTCTCGACACTCTCGAACTGTAAATCTCTCTTGTACGTTAGTGTATGTGTGTATATCCTCCCTAGCCGGTCAGTCGTGCCAGTCCCTATCTCCCCGCCGGAGTGTCCTCGAACACTTCAGTACTCCCGATTCTTCCTCCAAAATTTGTTCACTTTCTTGTCGTGTCTTATGTTAGAATTAAAAAAAAGAGAGAAAAATGTTAATAAGATGTTTTCCTTCCACTAGCTTTTGGGATGCGGTACAGAGGACATGTGTGTGTGTATGTGTGCTCCCATTTAGCTACTGGTCACTAAAAGCCTTCGAAACTAAAACAATCCCTTGGTGCTGGTGCACAACAAAAAAGAGTGGAAAACAGTAATAAGAACAGGGCGGTACACAGGCTGGCAATACAGAAGTTGTTTCAAACCGCAGAAATAACATCGCAAAGTAAGA-GGCACACATGTGTTAAACCGCACGTGGCGAGAACAAACACATGCAAGAATTTCACATGTTTTCTCTGGTTTAAGTTTGTATCATAGGAATAGAAGAGTAATTA]

[+] EMBL BM620654             [CCGTTAACAACCAATAGTGATCGCTACCCTACTCCACCATCGCCTTTTTCTTCCTTCCCCACCTTCTGGGTTCGATAGTCCCCGAGCTGTCTGCTTCCCGGTATAAATGAGGAAGTCCTCCACCCCCCCGTGGCAGAAAATTCGTACTGTCGATATATAGTTAAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATCAAGCTTTAACGAGTAGAGAACACTAAATAACCCAGCTCTCCTCTCGACACTCTCGAACTGTAAATCTCTCTTGTACGTTAGTGTATGTGTGTATATCCTCCCTAGCCGGTCAGTCGTGCCAGTCCCTATCTCCCCGCCGGAGTGTCCTCGAACACTTCAGTACTCCCGATTCTTCCTCCAAAATTTGTTCACTTTCTTGTCGTGTCTTATGTTAGAATTAAAAAAAAGAGAGAAAAATGTTAATAAGATGTTTTCCTTCCACTAGCTTTTGGGATGCGGTACAGAGGACATGTGTGTGTGTATGTGTGCTCCCATTTAGCTACTGGTCACTAAAAGCCTTCGAAACTAAAACAATCCCTTGGTGCTGGTGCACAACAAAAAAGAGTGGAAAACAGTAATAAGAACAGGGCGGTACACAGGCTGGCAATACAGAAGTTGTTTCAAACCGCAGAAATAACATCGCAAAGTAAGAGGGCACACATGTGTTA                                                                                        ]
[-] EMBL BM638923             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGCCGGTCAGTCGTGCCAGTCCCTATCTCCCCGCCGGAGTGTCCTCGAACACTTCAGTACTCCCGATTCTTCCTCCAAAATTTGTTCACTTTCTTGTCGTGTCTTATGTTAGAATTAAAAAAAAGAGAGAAAAATGTTAATAAGATGTTTTCCTTCCACTAGCTTTTGGGATGCGGTACAGAGGACATGTGTGTGTGTATGTGTGCTCCCATTTAGCTACTGGTCACTAAAAGCCTTCGAAACTAAAACAATCCCTTGGTGCTGGTGCACAACAAAAAAGAGTGGAAAACAGTAATAAGAACAGGGCGGTACACAGGCTGGCAATACAGAAGTTGTTTCAAACCGCAGAAATAACATCGCAAAGTAAGA GGCACACATGTGTTAAACCGCACGTGGCGAGAACAAACACATGCAAGAATTTCACATGTTTTCTCTGGTTTAAGTTTGTATCATAGGAATAGAAGAGTAATTA]
[+] EMBL BX612375             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAAAAAGAGGGGAAAACAGTAATAAGAACAGGGCGGTACACAGGCTGGCAATACAGAAGTGGTTTCAAACCGCAGAAATAACATCGCAAAGTAAGA GGCACACATGTGTTAAACCGCACGGGGCGAGAACAAACACATGC                                                           ]




>consensus_3385#0
CCGTTAACAACCAATAGTGATCGCTACCCTACTCCACCATCGCCTTTTTCTTCCTTCCCC
ACCTTCTGGGTTCGATAGTCCCCGAGCTGTCTGCTTCCCGGTATAAATGAGGAAGTCCTC
CACCCCCCCGTGGCAGAAAATTCGTACTGTCGATATATAGTTAAAAGTTAAAAAAAAAAA
AAAAACAAAATCAAGCTTTAACGAGTAGAGAACACTAAATAACCCAGCTCTCCTCTCGAC
ACTCTCGAACTGTAAATCTCTCTTGTACGTTAGTGTATGTGTGTATATCCTCCCTAGCCG
GTCAGTCGTGCCAGTCCCTATCTCCCCGCCGGAGTGTCCTCGAACACTTCAGTACTCCCG
ATTCTTCCTCCAAAATTTGTTCACTTTCTTGTCGTGTCTTATGTTAGAATTAAAAAAAAG
AGAGAAAAATGTTAATAAGATGTTTTCCTTCCACTAGCTTTTGGGATGCGGTACAGAGGA
CATGTGTGTGTGTATGTGTGCTCCCATTTAGCTACTGGTCACTAAAAGCCTTCGAAACTA
AAACAATCCCTTGGTGCTGGTGCACAACAAAAAAGAGTGGAAAACAGTAATAAGAACAGG
GCGGTACACAGGCTGGCAATACAGAAGTTGTTTCAAACCGCAGAAATAACATCGCAAAGT
AAGAGGCACACATGTGTTAAACCGCACGTGGCGAGAACAAACACATGCAAGAATTTCACA
TGTTTTCTCTGGTTTAAGTTTGTATCATAGGAATAGAAGAGTAATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case