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Anopheles gambiae
cluster # 3459 cluster # 3459       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3459#0 length = 821 sequences # 3  

consensusID : consensus_3459#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 821
fasta sequence
                              [ACTATGACTGTTTTGGTCGTAAATTGTGTTTCCATTAATGTCATCATGTATGCAAATATGCATTCGCATTTTGCGCAACGAAAAAAGGGTTGGTTACACTCATCTAATTGGTT--TGTGTGTGTGTGGCCGGACATTGAATAAAAGTACCGATTCAACCTCAATAATAAACTACCCTTAAATATTTGCGCTTGCCTGCCTTTTCGTTGAAAATCTAATGAAGATGAATAGAGAGGTGTGCCCGCGTGCGCAAGTGTAATTGGAGAAACCGCGATGCGCGAGGACCTCCTCCTGTGTTCGTTGCTCGAACGAAATCTAAATTTATTGATCATTATAGAGAGAAAATCGCTAGCGTTTGTTAGCCGATGATGCGTACGATATGATATGATCGTGCTATAGACGAGCAAAGCTGTAC---GGGGATCATTTGCGTAATAGTGCAGTGGTTTTATGCATGTACGCCAACTGTGTGCTACATTATTTGCAAACGATTATTATTTCAAGCGCTTCTAGCATAGCAATAGCTACACACTAAGGCTTACAAAATGCAAAGATTTAAGGCGTCGTTACTAAACGCACAGCTTGGACAGTTTTAAGCTTAGTTAGGAGTCTCGTTTAGGGGAAAAATATTATCACAGTAGCACTTAGTGTGGTGCACGTGAGCATCAGTAGATGGAATCATAATAATTGCAAGATTTCATCGTTTGTTTGCTGTTTGAATATTTGATTGCTAAATGTGTCTTCAGAATAGCGGGGTTAGTATGGGAAGGGGGGAAAACAAATGCTTCAATAAATCGTTCCCTTTATAAAGTTACAAGCAAACCAGT]

[+] EMBL BX621402             [ACTATGACTGTTTTGGTCGTAAATTGTGTTTCCATTAATGTCATCATGTATGCAAATATGCATTCGCATTTTGCGCAACGAAAAAAGGGTTGGTTACACTCATCTAATTGGTT  TGTGTGTGTGTGGCCGGACATTGAATAAAAGTACCGATTCAACCTCAATAATAAACTACCCTTAAATATTTGCGCTTGCCTGCCTTTTCGTTGAAAATCTAATGAAGATGAATAGAGAGGTGTGCCCGCGTGCGCAAGTGTAATTGGAGAAACCGCGATGCGCGAGGACCTCCTCCTGTGTTCGTTGCTCGAACGAAATCTAAATTTATTGATCATTATAGAGAGAAAATCGCTAGCGTTTGTTAGCCGATGATGCGTACGATATGATATGATCGTGCTATAGACGAGCAAAGCTGTACGGGGGGGATCATTTGCGTAATAGTGCAGTGGTTTTATGCATGTACGCCAACTGTGTGCTACATTATTTGCAAACGATTATTATTTCAAGCGCTTCTAGCATAGCAATAGCTACACACTAAGGCTTACAAAATGCAAAGATTTAAGGCGTCGTTACTAAACGCACAGCTTGGACAGTTTTAAGCTTAGTTAGGAGTCTCGTTTAGGGGAAAAATATTATCACAGTAGCACTTAGTGTGGTGCACGTGAGCATCAGTAGATGGAATCATA                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BM616687             [                                                                                     ccGGTTGGTTACACTCATCTAATTGGTTTGTGTGTGTGTGTGGCCGGACATTGAATAAAAGTACCGATTTAACCTCAATAATAAACTACCCTTAAATATTTGCGCTTGCCTGCCTTTTCGTTGAAAATCTAATGAAGATGAATAGAGAGGTGTGCCCGCGTGCGCAAGTGTAATTGGAGAAACCGCGATGCGCGAGGACCTCCTCCTGTGTTCGTTGCTCGAACGAAATCTAAATTTATTGATCATTATAGAGAGAAAATCGCTAGCGTTTGTTAGCCGATGATGCGTACGATATGATATGATCGTGCTATAGACGAGCAAAGCTGTAC   GGGGATCATTTGCGTAATAGTGCAGTGGTTTTATGCATGTACGCCAACTGTGTGCTACATTATTTGCAAACGATTATTATTTCAAGCGCTTCTAGCATAGCAATAGCTACACACTAAGGCTTACAAAATGCAAAGATTTAAGGCGTCGTTACTAAACGCACAGCTTGGACAGTTTTAAGCTTAGTTAGGAGTCTCGTTTAGGGGAAAAATATTATCACAGTAGCACTTAGTGTGGTGCACGTGAGCATCAGTAGATGGAATCATAATAATTGCAAGATTTCATCGTTTGTT                                                                                                                      ]
[+] EMBL BM640945             [                                                                                                                                                                       ccgCTACCCTTAAATATTTGCGCTTGCCTGCCTTTTCGTTGAAAATCTAATGAAGATGAATAGAGAGGTGTGCCCGCGTGCGCAAGTGTAATTGGAGAAACCGCGATGCGCGAGGACCTCCTCCTGTGTTCGTTGCTCGAACGAAATCTAAATTTATTGATCATTACGGAGAGAAAATCGCTAGCGTTTGTTGGGCGATGATGCGTACGATATGATATGATCGTGCTATAGACAAGCAAAGCTGTAC   GGGGATCATTTGCGTAATAGTGCAGTGGTTTTATGCATGTACGCCAACTGTGTGCTACATTATTTGCAAACGATTATTATTTCAAGCGCTTCTAGCATAGCAATAGCTACACACTAAGGCTTACAAAATGCAAAGATTTAAGGCGTCGTTACTAAACGCACAGCTTGGACAGTTTTAAGCTTAGTTAGGAGTCTCGTTTAGGGGAAAAATATTATCACAGTAGCACTTAGTGTGGTGCACGTGAGCATCAGTAGATGGAATCATAATAATTGCAAGATTTCATCGTTTGTTTGCTGTTTGAATATTTGATTGCTAAATGTGTCTTCAGAATAGCGGGGTTAGTATGGGAAGGGGGGAAAACAAATGCTTCAATAAATCGTTCCCTTTATAAAGTTACAAGCAAACCAGT]


>consensus_3459#0 ACTATGACTGTTTTGGTCGTAAATTGTGTTTCCATTAATGTCATCATGTATGCAAATATG CATTCGCATTTTGCGCAACGAAAAAAGGGTTGGTTACACTCATCTAATTGGTTTGTGTGT GTGTGGCCGGACATTGAATAAAAGTACCGATTCAACCTCAATAATAAACTACCCTTAAAT ATTTGCGCTTGCCTGCCTTTTCGTTGAAAATCTAATGAAGATGAATAGAGAGGTGTGCCC GCGTGCGCAAGTGTAATTGGAGAAACCGCGATGCGCGAGGACCTCCTCCTGTGTTCGTTG CTCGAACGAAATCTAAATTTATTGATCATTATAGAGAGAAAATCGCTAGCGTTTGTTAGC CGATGATGCGTACGATATGATATGATCGTGCTATAGACGAGCAAAGCTGTACGGGGATCA TTTGCGTAATAGTGCAGTGGTTTTATGCATGTACGCCAACTGTGTGCTACATTATTTGCA AACGATTATTATTTCAAGCGCTTCTAGCATAGCAATAGCTACACACTAAGGCTTACAAAA TGCAAAGATTTAAGGCGTCGTTACTAAACGCACAGCTTGGACAGTTTTAAGCTTAGTTAG GAGTCTCGTTTAGGGGAAAAATATTATCACAGTAGCACTTAGTGTGGTGCACGTGAGCAT CAGTAGATGGAATCATAATAATTGCAAGATTTCATCGTTTGTTTGCTGTTTGAATATTTG ATTGCTAAATGTGTCTTCAGAATAGCGGGGTTAGTATGGGAAGGGGGGAAAACAAATGCT TCAATAAATCGTTCCCTTTATAAAGTTACAAGCAAACCAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)