cluster # 3769

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Anopheles gambiae
cluster # 3769 cluster # 3769 Sequences # 3 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3769#0 length = 755 sequences # 2

consensus_3769#1 length = 671 sequences # 1

consensusID : consensus_3769#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 755
fasta sequence

                              [CCGGGCCCTGCGCGTGGTGATCGGATTTGCCTCGATGTCGGTCGCGGTGGTCAGCTTCGTGCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATA]

[+] EMBL BM606295             [CCGGGCCCTGCGCGTGGTGATCGGATTTGCCTCGATGTCGGTCGCGGTGGTCAGCTTCGTGCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGG                                                                      ]
[+] EMBL BM652421             [                                                ccgCAGCTTCGTGCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCA TTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATA]




>consensus_3769#0
CCGGGCCCTGCGCGTGGTGATCGGATTTGCCTCGATGTCGGTCGCGGTGGTCAGCTTCGT
GCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACT
TCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCG
CACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTG
CCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCT
GGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCA
GGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGT
ATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCAT
ACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAA
CACGGTCATTTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGC
TGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCA
TCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCG
TCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATA

consensusID : consensus_3769#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 671
fasta sequence

                              [CCGCGGACGCGTGGGTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATACCGACGTTTACCGCCTACCAG]

[+] EMBL BM650723             [CCGCGGACGCGTGGGTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAACACGGTCATTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATACCGACGTTTACCGCCTACCAG]




>consensus_3769#1
CCGCGGACGCGTGGGTTCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACG
TGGCGCGCGACTGGCGCACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCA
CCAGCTGGTACTGGTGCCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACG
AGCTGTGCCGGCTGCTGGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACT
ATCGGAAGGCACTGCAGGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCA
TCTCGGTCGGTGACGTATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCG
TCTGGTTCGGGATCATACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTG
GGGACATCTATCTGAACACGGTCATTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCA
GCATCGTGGTCGTGCTGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGG
CCGGATTGTCCTGCATCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTA
CGCTGGCGATGGTCGTCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATACCGACGTTTA
CCGCCTACCAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_3769#0      CCGGGCCCTGCGCGTGGTGATCGGATTTGCCTCGATGTCGGTCGCGGTGGTCAGCTTCGT 60
consensus_3769#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_3769#0      GCTGGTGGTCGAGCTGGTAAGCGGCCGGTACCGTACGATCATCGGCATCCTCAACATACT 120
consensus_3769#1      ------------------------------------------CCGCGGACGCGTGGG--T 16
                                                                * **   * *       *

consensus_3769#0      TCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCG 180
consensus_3769#1      TCCGGTGGCCTTGGCCTACATACTGGCCGCGGGTATCGCTTACGTGGCGCGCGACTGGCG 76
                      ************************************************************

consensus_3769#0      CACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTG 240
consensus_3769#1      CACCATGCAGTTCGCGATCACACTGCCCGGGCTGCTGCTCGTCACCAGCTGGTACTGGTG 136
                      ************************************************************

consensus_3769#0      CCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCT 300
consensus_3769#1      CCCGGAATCGCCCCGCTGGCTGCTGGCCAAGGGCCGGCTCGACGAGCTGTGCCGGCTGCT 196
                      ************************************************************

consensus_3769#0      GGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCA 360
consensus_3769#1      GGAGCGGGCCGCCAGCACCAACCATCTGCAGCTGCCCGCCAACTATCGGAAGGCACTGCA 256
                      ************************************************************

consensus_3769#0      GGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGT 420
consensus_3769#1      GGCCGAGGGTGAGGATGCTAACGGCGGCCAGCCGGAAGCCGCCATCTCGGTCGGTGACGT 316
                      ************************************************************

consensus_3769#0      ATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCAT 480
consensus_3769#1      ATTCCGGCGCAAGTTTATCCGCACCACGCTCGTCATGATCGTCGTCTGGTTCGGGATCAT 376
                      ************************************************************

consensus_3769#0      ACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAA 540
consensus_3769#1      ACTGATCTACTTCGGCATTACGCTGCACCTGAGCAATCTCGGTGGGGACATCTATCTGAA 436
                      ************************************************************

consensus_3769#0      CACGGTCATTTGCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGC 600
consensus_3769#1      CACGGTCATT-GCCGGTTCGGTCGAAGCGATTGCCATCTGTCTCAGCATCGTGGTCGTGC 495
                      ********** *************************************************

consensus_3769#0      TGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCA 660
consensus_3769#1      TGAAGCTCGGCTTGCGGATTAATTTATTCCTCTACATGGTCGTGGCCGGATTGTCCTGCA 555
                      ************************************************************

consensus_3769#0      TCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCG 720
consensus_3769#1      TCGTGATGAACTTCGTGCCGGATGGCAACCTCTGGCTGATAATTACGCTGGCGATGGTCG 615
                      ************************************************************

consensus_3769#0      TCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATA--------------------- 755
consensus_3769#1      TCAAGTGCTGTGTTGGAGCGTGTAACGCCATCATACCGACGTTTACCGCCTACCAG 671
                      ***********************************