cluster # 392

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Anopheles gambiae
cluster # 392 cluster # 392 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_392#0 length = 879 sequences # 2

consensusID : consensus_392#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 879
fasta sequence

                              [CCGCTCGTGGCCGGCTCGCTCGTGTCCGGCTCGAGCAGGAACAGTAGTCCACCGGTGAGTAGCTTGTTCATCTTGGAGCGGTTGCTTTTTATTTATAATTATTAATAAAAATAATTTTATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTTTAATTATAGTGTATTAGTATTTTAAAAGAATATTGAAATAATTTGAAAAATTTTTAATTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTATCAGGGTTTATTAAATAATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAAAGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTTTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAAT-AAATATAAGCTT-AAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGTTATAATTTATTTTTTATAAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTTAAATTTTAATAAT-AAAAATTTA-GTAA-TTAT-GATAAAA--TTAGTATATTAAATTTTATTTTAAAGGAAATTAAATTTTTGAAAAGGGTTTTCAATGGAAGAAAATCCGGCCCAAAATTAAAATAATATTTCCCCCCTGGTTTTAAACAAAAAACCACGGGCCCTTTTTTTGGAAATTTCAATTTTAAAAGCCCTAACCCCTGGCCCCCCGGAGGTTTTAAAGGGGGGCCCCCGGGGAATTTTGGAACCCGGGGCCAAA]

[+] EMBL BM598439             [CCGCTCGTGGCCGGCTCGCTCGTGTCCGGCTCGAGCAGGAACAGTAGTCCACCGGTGAGTAGCTTGTTCATCTTGGAGCGGTTGCTTTTTATTTATAATTATTAATAAAAATAATTTTATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTTTAATTATAGTGTATTAGTATTTTAAAAGAATATTGAAATAATTTGAAAAATTTTTAATTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTATCAGGGTTTATTAAATAATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAAAGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTTTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAAT AAATATAAGCTT AAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGTTATAATTTATTTTTTATAAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTTAAATTTTAATAAT AAAAATTTA GTAA TTAT GATAAAA  TTAGTAT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BM657710             [                                                                                             TATAATTATTAATAAAAATAATTTTATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTTTAATTATAGTGTATTAGTATTTTAAAAGAATATTGAAATAATTTGAAAAATTTTTAATTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTATCAGGGTTTATTAAATAATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAAAGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTTTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAATAAAATATAAGCTTAAAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGGTATAATTTATTTTTTATAAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTTAAATTTTAATAATAAAAAATTTAGGTAATTTATGGATAAAAATTTAGTATATTAAATTTTATTTTAAAGGAAATTAAATTTTTGAAAAGGGTTTTCAATGGAAGAAAATCCGGCCCAAAATTAAAATAATATTTCCCCCCTGGTTTTAAACAAAAAACCACGGGCCCTTTTTTTGGAAATTTCAATTTTAAAAGCCCTAACCCCTGGCCCCCCGGAGGTTTTAAAGGGGGGCCCCCGGGGAATTTTGGAACCCGGGGCCAAA]




>consensus_392#0
CCGCTCGTGGCCGGCTCGCTCGTGTCCGGCTCGAGCAGGAACAGTAGTCCACCGGTGAGT
AGCTTGTTCATCTTGGAGCGGTTGCTTTTTATTTATAATTATTAATAAAAATAATTTTAT
TTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTTTAATTATAGTGTATTAGTATT
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GCCCTTTTTTTGGAAATTTCAATTTTAAAAGCCCTAACCCCTGGCCCCCCGGAGGTTTTA
AAGGGGGGCCCCCGGGGAATTTTGGAACCCGGGGCCAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case