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Anopheles gambiae
cluster # 4294 cluster # 4294       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4294#0 length = 1162 sequences # 3  

consensusID : consensus_4294#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1162
fasta sequence
                              [CAGAATCCGCACGAGTGTTTGTTTTATCCCAAATTAGACAACGGACGAGCGAAAAACACATACAGACAGGCACACACACACATACACACATACATATATACACATTTACAACACTAACTGCTAACAACGGTGTGGACAAACGGTAAAAGTAGAGAAGGTTTTACGCTACGTTGATAAATAGTATCGAAAAGTCGAAACAAACTATTACAGCTAATCAAATACGAGCAGAAGCCACAGACGAACAGTTAGACAATGTTGTGAGTGTGCGTGTGTGTATTTGTGTGCGTGTATGTTTGTATGTGCGGATAACGCTTGTGGCACGTAAATTGATAAGAGAGATGCGCACGTTAAATCCTACCCTATATAC-GCCTTGAGAGGCGCACTAA-AAGCGTTTTGTATCGAACG-AATGACGCGGAAAGGATGATAGACGAGTAATTCTAGTAACGATACATTTAGCAATTTCATACTCACAAACACAAAAACACAGACAGAC-AGCAGACGCAGTCCCGATCCCGACATGCAAGTATGAATTTGTTTGGGCGGGGTTTGCGAGTATTACGTGAATTTT----TTGTTTTCGGGAAATCAGTCATGGAATGACATGCGTG-GGGCGATGCATAATTAGTAAAAGTTGAACTTGCTTCATCCGCTTGGTGTGAGATTATTTCCTATTTTCTCATAACTTTTATGATTTTCGACCTTGGAATGTGTAAATAACACAATAGTGTTTCGTGTATTTTTTTTGTAACTTTGCATTTCAAAAACCCCTTAAACAAACAAAAAATGTGGGCAAATGCTGGCAAATGTAACTCGTGTAAAGGCGCCTTTTATTTTACCCTTGCCTGGACTGTGTCCAGCTAATCACTGTTGCAAATGGACTAATTTGGCCTGCAAAACACAACCGTGTGTGTAAATGGTTTATTTTTTAAAAATCATTTCAAAATGATCACTTATCACCGCACCCCAAATCATCAGTACTATGATTATTAAGCTGCTCATCGTGACGATGGTTAATTATCTCAATGTCCCCCCTTTTTTGACGTTTGGTTTAATGAAACGAAGCTGCAAACGGTTCAGAACAATGTGCGCAACCCATTCTTATTTTAGTTGATTGTGCTGCTTTTCCTACTTCCGATCAGACCGATGTAGTTGCAATAATTCAAAC]

[+] EMBL BX468840             [CAGAATCCGCACGAGTGTTTGTTTTATCCCAAATTAGACAACGGACGAGCGAAAAACACATACAGACAGGCACACACACACATACACACATACATATATACACATTTACAACACTAACTGCTAACAACGGTGTGGACAAACGGTAAAAGTAGAGAAGGTTTTACGCTACGTTGATAAATAGTATCGAAAAGTCGAAACAAACTATTACAGCTAATCAAATACGAGCAGAAGCCACAGACGAACAGTTAGACAATGTTGTGAGTGTGCGTGTGTGTATTTGTGTGCGTGTATGTTTGTATGTGCGGATAACGCTTGTGGCACGTAAATTGATAAGAGAGATGCGCACGTTAAATCCTACCCTATATACGGCCTTGAGAGGCGCACTAANAAGCGTTTTGTATCGAACGAAATGACGCGGAAAGGATGATAGACGAGTAATTCTAGTAACGATACATTTAGCAATTTCATACTCACAAACACAAAAACACAGACAGACAAGCAGACGCAGTCCCGATCCCGACATGCAAGTATGAATTTGTTTGGGCGGGGTTTGCGAGTATTACGTGAATTTTGCANGTGTAATCGGGAAATCAGTCATGGAATGACATGCGTG GGGCGATGCATAATTCGT AAAGTTGAACTTGCgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX626709             [                                          GGACGAGCGAAAAACACATACAGACAGGCACACACACACATACACACATACATATATACACATTTACAACACTAACTGCTAACAACGGTGTGGACAAACGGTAAAAGTAGAGAAGGTTTTACGCTACGTTGATAAATAGTATCGAAAAGTCGAAACAAACTATTACAGCTAATCAAATACGAGCAGAAGCCACAGACGAACAGTTAGACAATGTTGTGAGTGTGCGTGTGTGTATTTGTGTGCGTGTATGTTTGTATGTGCGGATAACGCTTGTGGCACGTAAATTGATAAGAGAGATGCGCACGTTAAATCCTACCCTATATAC GCCTTGAGAGGCGCACTAA AAGCGTTTTGTATCGAACG AATGACGCGGAAAGGATGATAGACGAGTAATTCTAGTAACGATACATTTAGCAATTTCATACTCACAAACACAAAAACACAGACAGAC AGCAGACGCAGTCCCGATCCCGACATGCAAGTATGAATTTGTTTGGGCGGGGTTTGCGAGTATTACGTGAATTTT    TTGTTTTCGGGAAATCAGTCATGGAATGACATGCGTG GGGCGATGCATAATTAGTAAAAGTTGAACTTGCTTCATCCGCTTGGTGTGAGATTATTTCCTATTTTCTCATAACTTTTATGATTTTCGACCTTGGAATGTGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX622313             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGAG A CAGACGCAGTCCCGATCCTGACATGCAAGTATGAATTGGTTTGGGCGGGGTTTGCGAGTATTACGTGAATTTT    TTGTTTTCGGGAAATCAGTCATGGAATGACATGCGTGAGGGGGATGCATAATTAGCAAAAGTTGAACTTGCTTCATCCGCTTGGTGTGAGATTATTTCCTATTTTCTCATAACTTTTATGATTTTCGACCTTGGAATTTGTAAATAACACAATAGTGTTTCGTGTATTTTTTTTGTAACTTTGCATTTCAAAAACCCCTTAAACAAACAAAAAATGTGGGCAAATGCTGGCAAATGTAACTCGTGTAAAGGCGCCTTTTATTTTACCCTTGCCTGGACTGTGTCCAGCTAATCACTGTTGCAAATGGACTAATTTGGCCTGCAAAACACAACCGTGTGTGTAAATGGTTTATTTTTTAAAAATCATTTCAAAATGATCACTTATCACCGCACCCCAAATCATCAGTACTATGATTATTAAGCTGCTCATCGTGACGATGGTTAATTATCTCAATGTCCCCCCTTTTTTGACGTTTGGTTTAATGAAACGAAGCTGCAAACGGTTCAGAACAATGTGCGCAACCCATTCTTATTTTAGTTGATTGTGCTGCTTTTCCTACTTCCGATCAGACCGATGTAGTTGCAATAATTCAAAC]


>consensus_4294#0 CAGAATCCGCACGAGTGTTTGTTTTATCCCAAATTAGACAACGGACGAGCGAAAAACACA TACAGACAGGCACACACACACATACACACATACATATATACACATTTACAACACTAACTG CTAACAACGGTGTGGACAAACGGTAAAAGTAGAGAAGGTTTTACGCTACGTTGATAAATA GTATCGAAAAGTCGAAACAAACTATTACAGCTAATCAAATACGAGCAGAAGCCACAGACG AACAGTTAGACAATGTTGTGAGTGTGCGTGTGTGTATTTGTGTGCGTGTATGTTTGTATG TGCGGATAACGCTTGTGGCACGTAAATTGATAAGAGAGATGCGCACGTTAAATCCTACCC TATATACGCCTTGAGAGGCGCACTAAAAGCGTTTTGTATCGAACGAATGACGCGGAAAGG ATGATAGACGAGTAATTCTAGTAACGATACATTTAGCAATTTCATACTCACAAACACAAA AACACAGACAGACAGCAGACGCAGTCCCGATCCCGACATGCAAGTATGAATTTGTTTGGG CGGGGTTTGCGAGTATTACGTGAATTTTTTGTTTTCGGGAAATCAGTCATGGAATGACAT GCGTGGGGCGATGCATAATTAGTAAAAGTTGAACTTGCTTCATCCGCTTGGTGTGAGATT ATTTCCTATTTTCTCATAACTTTTATGATTTTCGACCTTGGAATGTGTAAATAACACAAT AGTGTTTCGTGTATTTTTTTTGTAACTTTGCATTTCAAAAACCCCTTAAACAAACAAAAA ATGTGGGCAAATGCTGGCAAATGTAACTCGTGTAAAGGCGCCTTTTATTTTACCCTTGCC TGGACTGTGTCCAGCTAATCACTGTTGCAAATGGACTAATTTGGCCTGCAAAACACAACC GTGTGTGTAAATGGTTTATTTTTTAAAAATCATTTCAAAATGATCACTTATCACCGCACC CCAAATCATCAGTACTATGATTATTAAGCTGCTCATCGTGACGATGGTTAATTATCTCAA TGTCCCCCCTTTTTTGACGTTTGGTTTAATGAAACGAAGCTGCAAACGGTTCAGAACAAT GTGCGCAACCCATTCTTATTTTAGTTGATTGTGCTGCTTTTCCTACTTCCGATCAGACCG ATGTAGTTGCAATAATTCAAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)