These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4487#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 747 fasta sequence [TTAATCATTTACTATTCATATATCATATGTTATAGCAACTAACAACGCACACACCACGTGCAGGTTCGATTCCTTTCTTAAAACGTCCATTAGGCATGCTAATTTACTTCTG-TTTTTTTTAGTGATTAAGTGAAACATTTTTAAAAACTCGATTTACACACAACACCTTATATCCCCCCTCGGAAGGCAAACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTATTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTGGATTCCATAAAAAAATGGTTTCATTGTTTGTTGCAATAGTGGTTTGATGTTG-----TTTTTTAAATTAATTTATAAATGATTCAAAAAAGGATGAAAAGTCGATGTAATAGGAATCCGAGTAGGAGAGGTTTGTTCTTTTGGTAATTGGATGAGGACATAGGCGCTTCTTCTCGGTTCATAACATTATTTGATGATTTTTGTTTAGCACTTTCACTTTAATATGCCTAACTTTAAATGTTTCATTTTAGCAATATCAATCTTTTTTTATTTACCACAAAACGAAGCAACAATTATTAGCACACATTTGCTCGGAATATGCTATAAATGCTAATAAAAACACGGGTAATATCGTCGTTCTAAACGGGTCGGTTTTCCGTCATGCACACACATACATACAATCACACCGACACACAAACACACTGAGCTTA] [+] EMBL BX614565 [TTAATCATTTACTATTCATATATCATATGTTATAGCAACTAACAACGCACACACCACGTGCAGGTTCGATTCCTTTCTTAAAACGTCCATTAGGCATGCTAATTTACTTCTG TTTTTTTTAGTGATTAAGTGAAACATTTTTAAAAACTCGATTTACACACAACACCTTATATCCCCCCTCGGAAGGCAAACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTATTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTG ] [+] EMBL BM641346 [ ccgCTTAAAACGTCCATTAGGCATGCTAATTTACTTCTGTTTTTTTTTAGTGATTAAGTGAAACATTTTTAAAAACTCGATTTACACACAACACCTTATATCCCCCCTCGGAAGGCAAACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTGTTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTGGATTCCATAAAAAAATGGTTTCATTGTTTGTTGCAATAGTGGTTTGATGTTG TTTTTTAAATTAATTTATAAATGATTCAAAAAAGGATGAAAAGTCGATGTAATAGGAATCCGAGTAGGAGAGGTTTGTTCTTTTGGTAATTGGATGAGGACATAGGCGCTTCTTCTCGGTTCATAACATTATTTGATGATTTTTGTTTAGCACTTTCACTTTAATATGCCTAACTTTAAATGTTTCATTTTAGCAATATCAATCTTTTTTTATTTACCACAAAACGAAGCAACAATTATTAGCACACATTTGCTCGGAATATGCTATAAATGCTAATAAAAACACGGGTAATATCGTCGTTCTAAACGGGTCGGTTTTCCGTCATGCACACACATACATACAATCACACCGACACACAAACACACTGAGCTTA] [+] EMBL BX620038 [ AACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTATTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTGGATTCCATAAAAAAATGGTTTCATTGTTTGTTGCAATAGTGGTTTGATGTTGTTTTTTTTTTTAAATTAATTTATAAATGATTCAAAAAAGGATGAAAAGTCGATGTAATAGGAATCCNAGTAGGAGAGGTTTGTTCTTTTGGTAATTGGACGAGGACATAGGCGCTTCTTCTCGGTTCATAACATTATTTGATGATTTTTGTTTAGCACTTTCACTTTAATATGCCTAACTTTAAATGTTTCATTTTAGCAATATCAATCTTTTTTTATTTACCACAAAACGAAGCAACAATTATTAGCACACATTTGCTCNGAATATGCTATAAATGCTAATAGAAACACGGGTAATATCG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||