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Anopheles gambiae
cluster # 4487 cluster # 4487       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4487#0 length = 747 sequences # 3  

consensusID : consensus_4487#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 747
fasta sequence
                              [TTAATCATTTACTATTCATATATCATATGTTATAGCAACTAACAACGCACACACCACGTGCAGGTTCGATTCCTTTCTTAAAACGTCCATTAGGCATGCTAATTTACTTCTG-TTTTTTTTAGTGATTAAGTGAAACATTTTTAAAAACTCGATTTACACACAACACCTTATATCCCCCCTCGGAAGGCAAACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTATTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTGGATTCCATAAAAAAATGGTTTCATTGTTTGTTGCAATAGTGGTTTGATGTTG-----TTTTTTAAATTAATTTATAAATGATTCAAAAAAGGATGAAAAGTCGATGTAATAGGAATCCGAGTAGGAGAGGTTTGTTCTTTTGGTAATTGGATGAGGACATAGGCGCTTCTTCTCGGTTCATAACATTATTTGATGATTTTTGTTTAGCACTTTCACTTTAATATGCCTAACTTTAAATGTTTCATTTTAGCAATATCAATCTTTTTTTATTTACCACAAAACGAAGCAACAATTATTAGCACACATTTGCTCGGAATATGCTATAAATGCTAATAAAAACACGGGTAATATCGTCGTTCTAAACGGGTCGGTTTTCCGTCATGCACACACATACATACAATCACACCGACACACAAACACACTGAGCTTA]

[+] EMBL BX614565             [TTAATCATTTACTATTCATATATCATATGTTATAGCAACTAACAACGCACACACCACGTGCAGGTTCGATTCCTTTCTTAAAACGTCCATTAGGCATGCTAATTTACTTCTG TTTTTTTTAGTGATTAAGTGAAACATTTTTAAAAACTCGATTTACACACAACACCTTATATCCCCCCTCGGAAGGCAAACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTATTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BM641346             [                                                                         ccgCTTAAAACGTCCATTAGGCATGCTAATTTACTTCTGTTTTTTTTTAGTGATTAAGTGAAACATTTTTAAAAACTCGATTTACACACAACACCTTATATCCCCCCTCGGAAGGCAAACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTGTTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTGGATTCCATAAAAAAATGGTTTCATTGTTTGTTGCAATAGTGGTTTGATGTTG     TTTTTTAAATTAATTTATAAATGATTCAAAAAAGGATGAAAAGTCGATGTAATAGGAATCCGAGTAGGAGAGGTTTGTTCTTTTGGTAATTGGATGAGGACATAGGCGCTTCTTCTCGGTTCATAACATTATTTGATGATTTTTGTTTAGCACTTTCACTTTAATATGCCTAACTTTAAATGTTTCATTTTAGCAATATCAATCTTTTTTTATTTACCACAAAACGAAGCAACAATTATTAGCACACATTTGCTCGGAATATGCTATAAATGCTAATAAAAACACGGGTAATATCGTCGTTCTAAACGGGTCGGTTTTCCGTCATGCACACACATACATACAATCACACCGACACACAAACACACTGAGCTTA]
[+] EMBL BX620038             [                                                                                                                                                                                              AACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATAGTTAAAATATTATTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTGGATTCCATAAAAAAATGGTTTCATTGTTTGTTGCAATAGTGGTTTGATGTTGTTTTTTTTTTTAAATTAATTTATAAATGATTCAAAAAAGGATGAAAAGTCGATGTAATAGGAATCCNAGTAGGAGAGGTTTGTTCTTTTGGTAATTGGACGAGGACATAGGCGCTTCTTCTCGGTTCATAACATTATTTGATGATTTTTGTTTAGCACTTTCACTTTAATATGCCTAACTTTAAATGTTTCATTTTAGCAATATCAATCTTTTTTTATTTACCACAAAACGAAGCAACAATTATTAGCACACATTTGCTCNGAATATGCTATAAATGCTAATAGAAACACGGGTAATATCG                                                                             ]


>consensus_4487#0 TTAATCATTTACTATTCATATATCATATGTTATAGCAACTAACAACGCACACACCACGTG CAGGTTCGATTCCTTTCTTAAAACGTCCATTAGGCATGCTAATTTACTTCTGTTTTTTTT AGTGATTAAGTGAAACATTTTTAAAAACTCGATTTACACACAACACCTTATATCCCCCCT CGGAAGGCAAACTTATCTGTTGTTGTACTTTTAGTGTAACACCTGGCTATAACTATAATA GTTAAAATATTATTTAGTATGGTAGCTTTTATCGGCAATTATTGAATTGAGTGTATGTAT GTGTGTGTGTGTGAGTGTGCTGGATTCCATAAAAAAATGGTTTCATTGTTTGTTGCAATA GTGGTTTGATGTTGTTTTTTAAATTAATTTATAAATGATTCAAAAAAGGATGAAAAGTCG ATGTAATAGGAATCCGAGTAGGAGAGGTTTGTTCTTTTGGTAATTGGATGAGGACATAGG CGCTTCTTCTCGGTTCATAACATTATTTGATGATTTTTGTTTAGCACTTTCACTTTAATA TGCCTAACTTTAAATGTTTCATTTTAGCAATATCAATCTTTTTTTATTTACCACAAAACG AAGCAACAATTATTAGCACACATTTGCTCGGAATATGCTATAAATGCTAATAAAAACACG GGTAATATCGTCGTTCTAAACGGGTCGGTTTTCCGTCATGCACACACATACATACAATCA CACCGACACACAAACACACTGAGCTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)