Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 4770 cluster # 4770       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4770#0 length = 1297 sequences # 3  

consensusID : consensus_4770#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1297
fasta sequence
                              [CCGGAGAACAGGAAGGAAAGCGCAAGTTGCAAACACAAATTGATTGACACAACGACTTGCCACGATTGCCCGATGTGTGAGCGCGCAAGTGTAACAGAATAGAATCGGATGGATAGAATTGTGATTTTTAGTTGTTTGGAACATGCAAGGTAAATTGTTAATAAGGCATTTTGCTTCAACAAAGTAATATTCTAAGCACTAACGTATGAGTACAGTCTGAGGGGGCAAATTTGTAAACGATTTCGTACTCACCGTTGTGTACCGTAGGAAGAAGTACTATCATCAAGCAATTGCAAATGATACAACGCCCGATACGTGCCCCCGACACGGGGCCGATTACACACAACAACAACAACAACAACAACAAAAGCACATAAAGTTTCGTAACTTTCGGTGTTCAAGAATACAGTGTACGTGCACTCTTCGTAAGTGTGCACTTTTGTAACGCGCTTGAATATAAGCTATTCCACCAACGATCAAACGTTCATTTGATGCAGTAAATCCCCATGAAATAGACTCATGCTGAGACGATTTAATTTATCCACAACATTCTATTACCACGGTCAAGCAATTGTTACTAAACTACTCGTCTTCAGTTAGAATGGTCTCCTTTGCAGGGTAACAGACCAATTATTGTTTTATTGTTAAGTAAAGCCACAGTTAGGTTCTATTCGCTGCCTATTGTTCTACGACACTTGCATGGACACTTATAAGGATGGGAAATCAAGCAACTTTTACCTACGATTTCATTCAGTTGATCGTACACGTGATAAAACGTTTAGCATTGGTTTGACGCACGCAATGAAATCCGTGAAGCAGCAATACTTTTATTTAAACATTTCATAGCTGATTTTATGAACACAGAATAGAGAACAAGGTAATTATAATAAGCCGGCAAAGTTCTTCGTAAACCAACCGAGTGGGGGGGGGGGAGAGGTACAACCCTTTTTTTTACACATCTGCTAGTTAAACAATTTTCAAACTATCTATAGCAATAGAAGCATAGCTAATCGTTGCTGTAGCGCATATATTATCACGTCAGTAAGGAAATGCCAAGCCCGCAAATAAACGTTCAAGAATACGATACGATTTAATTTCGTCTTAACATCACCAGAATTCCGATTCCCATGCATCCAGCTAGTGGCGAAAAAAATTTAATATTTTTCATTAACCTGGATCAAATACGGGAGCAGCGAACGTGCAATTCAAATTACTTGTAAAACAGTTCGAAACATTCTTCACTATCGTGTTTAAGATTAATGGTATACTTTCTCTATTTGTTTTGCGTTGTGTTTTT]

[+] EMBL BM645515             [CCGGAGAACAGGAAGGAAAGCGCAAGTTGCAAACACAAATTGATTGACACAACGACTTGCCACGATTGCCCGATGTGTGAGCGCGCAAGTGTAACAGAATAGAATCGGATGGATAGAATTGTGATTTTTAGTTGTTTGGAACATGCAAGGTAAATTGTTAATAAGGCATTTTGCTTCAACAAAGTAATATTCTAAGCACTAACGTATGAGTACAGTCTGAGGGGGCAAATTTGTAAACGATTTCGTACTCACCGTTGTGTACCGTAGGAAGAAGTACTATCATCAAGCAATTGCAAATGATACAACGCCCGATACGTGCCCCCGACACGGGGCCGATTACACACAACAACAACAACAACAACAACAAAAGCACATAAAGTTTCGTAACTTTCGGTGTTCAAGAATACAGTGTACGTGCACTCTTCGTAAGTGTGCACTTTTGTAACGCGCTTGAATATAAGCTATTCCACCAACGATCAAACGTTCATTTGATGCAGTAAATCCCCATGAAATAGACTCATGCTGAGACGATTTAATTTATCCACAACATTCTATTACCACGGTCAAGCAATTGTTACTAAACTACTCGTCTTCAGTTAGAATGGTCTCCTTTGCAGGGTAACAGACCAATTATTGTTTTATTGTTAAGTAAAGCCACAGTTAGGTTCTATTCGCTGCCTATTGTTCTACGACACTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX608376             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTATTGTTAAGTAAAGCGACAGTTAGGTTCTATTCGCTGCCTATTGTTCTACGACACTTGCATGGACACTTATAAGGATGGGAAATCAAGCAACTTTTACCTACGATTTCATTCAGTTGATCGTACACGTGATAAAACGTTTAGCATTGGTTTGACGCACGCAATGAAATCCGTGAAGCAGCAATACTTTTATTTAAACATTTCATAGCTGATTTTATGAACACAGAATAGAGAACAAGGTAATTATAATAAGCCGGCAAAGTTCTTCGTAAACCAACCGAGTGGGGGGGGGGGAGAGGTACAACCCTTTTTTTTACACATCTGCTAGTTAAACAATTTTCAAACTATCTATAGCAATAGAAGCATAGCTAATCGTTGCTGTAGCGCATATATTATCACGTCAGTAAGGAAATGCCAAGCCCGCAAATAAACGTTCAAGAATACGATACGATTTAATTTCGTCTTAACATCACCAGAATTCCGATTCCCATGCATCCAGCTAGTGGCGAAAAAAATTTAATATTTTTCATTAACCTGGATCAAATACGGGAGCAGCGAACGTGCAATTCAAATTACTTGTAAAACAGTTCGAAACATTCTTCACTATCGTGTTTAAGATTAATGGTATACTTTCTCTATTTGTTTTGCGTTGTGTTTTT]
[+] EMBL BX617403             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCGTACACGTGATAAAACGTTTAGCATTGGTTTGACGCACGCAATGAAATCCGTGAAGCAGCAATACTTTTATTTAAACATTTCATAGCTGATTTTATGAACACAGAATAGAGAACAAGGTAATTATAATAAGCCGGCAAAGTTCTTCGTAAACCAACCGAGTGGGGGGGGGGGAGAGGTACAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_4770#0 CCGGAGAACAGGAAGGAAAGCGCAAGTTGCAAACACAAATTGATTGACACAACGACTTGC CACGATTGCCCGATGTGTGAGCGCGCAAGTGTAACAGAATAGAATCGGATGGATAGAATT GTGATTTTTAGTTGTTTGGAACATGCAAGGTAAATTGTTAATAAGGCATTTTGCTTCAAC AAAGTAATATTCTAAGCACTAACGTATGAGTACAGTCTGAGGGGGCAAATTTGTAAACGA TTTCGTACTCACCGTTGTGTACCGTAGGAAGAAGTACTATCATCAAGCAATTGCAAATGA TACAACGCCCGATACGTGCCCCCGACACGGGGCCGATTACACACAACAACAACAACAACA ACAACAAAAGCACATAAAGTTTCGTAACTTTCGGTGTTCAAGAATACAGTGTACGTGCAC TCTTCGTAAGTGTGCACTTTTGTAACGCGCTTGAATATAAGCTATTCCACCAACGATCAA ACGTTCATTTGATGCAGTAAATCCCCATGAAATAGACTCATGCTGAGACGATTTAATTTA TCCACAACATTCTATTACCACGGTCAAGCAATTGTTACTAAACTACTCGTCTTCAGTTAG AATGGTCTCCTTTGCAGGGTAACAGACCAATTATTGTTTTATTGTTAAGTAAAGCCACAG TTAGGTTCTATTCGCTGCCTATTGTTCTACGACACTTGCATGGACACTTATAAGGATGGG AAATCAAGCAACTTTTACCTACGATTTCATTCAGTTGATCGTACACGTGATAAAACGTTT AGCATTGGTTTGACGCACGCAATGAAATCCGTGAAGCAGCAATACTTTTATTTAAACATT TCATAGCTGATTTTATGAACACAGAATAGAGAACAAGGTAATTATAATAAGCCGGCAAAG TTCTTCGTAAACCAACCGAGTGGGGGGGGGGGAGAGGTACAACCCTTTTTTTTACACATC TGCTAGTTAAACAATTTTCAAACTATCTATAGCAATAGAAGCATAGCTAATCGTTGCTGT AGCGCATATATTATCACGTCAGTAAGGAAATGCCAAGCCCGCAAATAAACGTTCAAGAAT ACGATACGATTTAATTTCGTCTTAACATCACCAGAATTCCGATTCCCATGCATCCAGCTA GTGGCGAAAAAAATTTAATATTTTTCATTAACCTGGATCAAATACGGGAGCAGCGAACGT GCAATTCAAATTACTTGTAAAACAGTTCGAAACATTCTTCACTATCGTGTTTAAGATTAA TGGTATACTTTCTCTATTTGTTTTGCGTTGTGTTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)