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Anopheles gambiae
cluster # 5008 cluster # 5008       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5008#0 length = 830 sequences # 4  

consensusID : consensus_5008#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 830
fasta sequence
                              [CCGGAACAGCTCTGTGCGTTTGTATGTACTGTGTGCGAACGTGTGTATGTGTGTGTGTCGAATGTCCTTGCTTCGTACAAACGGAAACTAGCTAAGAGTTAGACATACAGCGACAGAGAAAGAGCGAATTAGTGAGCGATATTTGACCACATCATGCTGCAAAACTGTACGGTAGATCTAGATGGGTAAAGATAATGAACATAAGCGTAAGTTTCATCTCATTTACGCGCCTTAGCAAATAATGTGTATTATCTTGGCAGGGAATAGATCGAGAGAGAAAAAAAATGGCGAACCGGCGTAGTTTCGACGGTGAACGCACTTGCTTTCGAGACAGTGAACGCACTTCGTTTTGGTTTGATTTTGCCCTTCGAATGTACAGTTAGTTTAAGTTTGAAGAGTGTGAAGAGTAGTAGTGGCGAATGCTATGAACGATTGGTGAAAAGTTAGAGCAAAGCTTCCCATCCCCTCCTTAATGTGCGCTCAGATGCTATGCCAGATG-CT-ATTCCTAATTCTAACTCTAGTGATTGCGACTGGGAACGATCAATTAGGTAGCGTGCTTCTGGTTCCAGCTAAACTATCGGTCCGAATGTGCATTATTTATTTGTTTAAATTTGTGACCACTTGCAACGGAAACCATCCCTATCCCCTTCCCATCCGTTTTTTGCTGCATGGAATCCGTGTATCGTAATTGTATACCGTTTAGCCAGTCAGACCGTTTTCAGTAGTTTCATTTGAACGGATTACTATACACCCACTCTCGTCACCAATAGCTGATATTTATAATAAAAAAACGATGTGTGAAGCTCTGTTTTCACCTAATCGTATTCGCG]

[+] EMBL BM577184             [CCGGAACAGCTCTGTGCGTTTGTATGTACTGTGTGCGAACGTGTGTATGTGTGTGTGTCGAATGTCCTTGCTTCGTACAAACGGAAACTAGCTAAGAGTTAGACATACAGCGACAGAGAAAGAGCGAATTAGTGAGCGATATTTGACCACATCATGCTGCAAAACTGTACGGTAGATCTAGATGGGTAAAGATAATGAACATAAGCGTAAGTTTCATCTCATTTACGCGCCTTAGCAAATAATGTGTATTATCTTGGCAGGGAATAGATCGAGAGAGAAAAAAAATGGCGAACCGGCGTAGTTTCGACGGTGAACGCACTTGCTTTCGAGACAGTGAACGCACTTCGTTTTGGTTTGATTTTGCCCTTCGAATGTACAGTTAGTTTAAGTTTGAAGAGTGTGAAGAGTAGTAATGGCGAATGCTATGAACGATTGGTGAAAAGTTAGAGCAAAGCTTCCCATCCCCTCCTTAATGTGCGCTCAGATGCTATGCCAGAAGAGTCCTTCCTAATTCTAACTGTAGTGATTGCGACTGGGAACGATCAATTAGGTAGCGTGCTTCTGGTTCCAGCTAAACTATCGGTCCGAATGTGCATTATTTATTTGTTTAAATTTGTGACCACTTGCAACGGAAACCATCCCTATCCCCTTCCCATCCGTTTTTTGCTGCATGGAATCCGTGTATCGTAATTGTATACC                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BM580232             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccgCTTCGTTTTGGTTTGATTTTGCCCTTCGAATGTACAGTTAGTTTAAGTTTGAAGAGTGTGAAGAGTAGTAGTGGCGAATGCTATGAACGATTGGTGAAAAGTTAGAGCAAAGCTTCCCATCCCCTCCTTAATGTGCGCTCAGATGCTATGCCAGATG CT ATTCCTAATTCTAACTCTAGTGATTGCGACTGGGAACGATCAATTAGGTAGCGTGCTTCTGGTTCCAGCTAAACTATCGGTCCGAATGTGCATTATTTATTTGTTTAAATTTGTGACCACTTGCAACGGAAACCATCCCTATCCCCTTCCCATCCGTTTTTTGCTGCATGGAATCCGTGTATCGTAATTGTATACCGTTTAGCCAGTCAGACCGTTTTCAGTAGTTTCATTTGAACGGATTACTATACACCCACTCTCGTCACCAATAGCTGATATTTATAATAAAAAAACGATGTGTGAAGCTCTGTTTTCACCTAATCGTATTCGCG]
[+] EMBL AGA283529            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttttTTTTAGNTTGAAGAGTGTGAAGAGTAGTAGTGGCGAATGCTATGAACGATTGGTGAAAAGTTAGAGCAAAGCTTCCCATCCCCTCCTTAATGTGCGCTCAGATGCTATGCCAGATG CT ATTCCTAATTCTAACTCTAGTGATTGCGACTGGGAACGATCAATTAGGTAGCGTGCTTCTGGTTCCAGCTAAACTATCGGTCCGAATGTGCATTATTTATTTGTTTAAATTTGTGACCACTTGCAACGGAAACCATCCCTATCCCCTTCCCATCCGTTTTTTGCTGCATGGAATCCGTGTATCGTAATTGTATACCGTTTAGCCAGTCAGACCG                                                                                                                   ]
[-] EMBL AGA284819            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttttttttTTTTAGTTTGAAGAGTGTGAAGAGTAGTAGTGGCGAATGCTATGAACGATTGGTGAAAAGTTAGAGCAAAGCTTCCCATCCCCTCCTTAATGTGCGCTCAGATGCTATGCCAGATG CT ATTCCTAATTCTAACTCTAGTGATTGCGACTGGGAACGATCAATTAGGTAGCGTGCTTCTGGTTCCAGCTAAACTATCGGTCCGAATGTGCATTATTTATTTGTTTAAATTTGTGACCACTTGCAACGGAAACCATCCCTATCCCCTTCCCATCCGTTTTTTGCTGCATGGAATCCGTGTATCGTAATTGTATACCGTTTAGCC                                                                                                                             ]


>consensus_5008#0 CCGGAACAGCTCTGTGCGTTTGTATGTACTGTGTGCGAACGTGTGTATGTGTGTGTGTCG AATGTCCTTGCTTCGTACAAACGGAAACTAGCTAAGAGTTAGACATACAGCGACAGAGAA AGAGCGAATTAGTGAGCGATATTTGACCACATCATGCTGCAAAACTGTACGGTAGATCTA GATGGGTAAAGATAATGAACATAAGCGTAAGTTTCATCTCATTTACGCGCCTTAGCAAAT AATGTGTATTATCTTGGCAGGGAATAGATCGAGAGAGAAAAAAAATGGCGAACCGGCGTA GTTTCGACGGTGAACGCACTTGCTTTCGAGACAGTGAACGCACTTCGTTTTGGTTTGATT TTGCCCTTCGAATGTACAGTTAGTTTAAGTTTGAAGAGTGTGAAGAGTAGTAGTGGCGAA TGCTATGAACGATTGGTGAAAAGTTAGAGCAAAGCTTCCCATCCCCTCCTTAATGTGCGC TCAGATGCTATGCCAGATGCTATTCCTAATTCTAACTCTAGTGATTGCGACTGGGAACGA TCAATTAGGTAGCGTGCTTCTGGTTCCAGCTAAACTATCGGTCCGAATGTGCATTATTTA TTTGTTTAAATTTGTGACCACTTGCAACGGAAACCATCCCTATCCCCTTCCCATCCGTTT TTTGCTGCATGGAATCCGTGTATCGTAATTGTATACCGTTTAGCCAGTCAGACCGTTTTC AGTAGTTTCATTTGAACGGATTACTATACACCCACTCTCGTCACCAATAGCTGATATTTA TAATAAAAAAACGATGTGTGAAGCTCTGTTTTCACCTAATCGTATTCGCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)