These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5061#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 465 fasta sequence [TCATCCCTTGATATGGGGGTACATAGTTCATTCTTTTATTCATCATGTAAGAACGCTAACAGCTATAGGTGAGAATTCTATATACATGTTACAATTATTCATACTTTGTAACTGGTAATAATTAAATAAAACTAGCATGTTTCTTATCTGCTAAGTCACGATGCCATCACACTGCTGGCAAACGACTGTGAAAGTCTTGAGGGTTGAATTTCATACGGATGTATTATTCTGCTT--ACACACACACACACGTGCGTTTTCTAAGGTGTGATACACCTGTGTGGGTTATTAGGGGATAGGATTCGTGTCCTCTCTGTGTTAGTTCATTAGATGCTTTGCCTTCTTAAAACGTCTTGCTGGGTGTAGTGGTGGTTAAAATATGGCCGTTCGAGGGAAAACTGCTTCAGATGCCGTTCATGTACTGGTCCATTTCCTTGTCCAGCGACGACTTTGTGTTGGCCATGTACT] [+] EMBL BM647261 [TCATCCCTTGATATGGGGGTACATAGTTCATTCTTTTATTCATCATGTAAAAACGCTAACAGCTATAGGTGAAAATTCTATATACATGTTACAATTATTCATACTTTGTAACTGGTAATAATTAAATAAAACTAGCATGTTTCTTATCTGCTAAGTCACGATGCCATCACACTGCTGGCAAACGACTGTGAAAGTCTTGAGGGTTGAATTTCATACGGATGTATTATTCTGCTT ACACACACACACACGTGCGTTTTCTAAGGTGTGATACACCTGTGTGGGTTATTAGGGGATAGGATTCGTGTCCTCTCTGTGTTAGTTCATTAAATGCTTTGCCTTCTTAAAACGTCTTGCTGGGTGTAGTGGTGGTTAAAATATGGCCGTTCGAGGGAAAACTGCTTCAAATGCCGTTCATGTACTGGTCCATTTCCTTGTCCAGCGACGACTTTGTGTTGGCCATGTAC ] [+] EMBL CNS08OZP [ ccccGGGT CATAGTTCATTCTTTTATTCATCATGTAAGAACGCTAACAGCTATAGGTGAGAATTCTATATACATGTTACAATTATTCATACTTTGTAACTGGTAATAATTAAATAAAACTAGCATGTTTCTTATCTGCTAAGTCACGATGCCATCACACTGCTGGCAAACGACTGTGAAAGTCTTGAGGGTTGAATTTCATACGGATGTATTATTCTGCTT ACACACACACACACGTGCGTTTTCTAAGGTGTGATACACCTGTGTGGGTTATTAGGGGATAGGATTCGTGTCCTCTCTGTGTTAGTTCATTAGATGCTTTGCCTTCTTAAAACGTCTTGCTGGGTGTAGTGGTGGTTAAAATATGGCCGTTCGAGGGAAAACTGCTTCAGATGCCGTTCATGTACTGGTCCATTTCCTTGTCCAGCGACGACTTTGTGTTGGCCATGTAC ] [+] EMBL CNS09R9J [ GTACATAGTTCATTCTTTTATTCATCATGTAAGAACGCTAACAGCTATAGGTGAGAATTCTATATACATGTTACAATTATTCATACTTTGTAACTGGTAATAATTAAATAAAACTAGCATGTTTCTTATCTGCTAAGTCACGATGCCATCACACTGCTGGCAAACGACTGTGAAAGTCTTGAGGGTTGAATTTCATACGGATGTATTATTCTGCTT ACACACACACACACGTGCGTTTTCTAAGGTGTGATACACCTGTGTGGGTTATTAGGGGATAGGATTCGTGTCCTCTCTGTGTTAGTTCATTAGATGCTTTGCCTTCTTAAAACGTCTTGCTGGGTGTAGTGGTGGTTAAAATATGGCCGTTCGAGGGAAAACTGCTTCAGATGCCGTTCATGTACTGGTCCATTTCCTTGTCCAGCGACGACTTTGTGTTGGCCATGTAC ] [-] EMBL BX609886 [ ACGATGCCATCACACTGCTGGCAAACGACTGTGAAAGTCTTGAGGGTTGAATTTCATACGGATGTATTATTCTGCTTACACACACACACACACGTGCGTTTTCTAAGGTGTGATACACCTGTGTGGGTTATCAGGGGATAGGATTCGTGTCCTCTCTGTGTTAGTTCATTAGATGCTTTGCCTTCTTAAAACGTCTTGCTGGGTGTAGTGGTGGTTAAAATATGGCCGTTCGAGGGAAAACTGCTTCAGATGCCGTTCATGTACTGGTCCATTTCCTTGTCCAGCGACGACTTTGTGTTGGCCATGTACT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||