cluster # 5164

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Anopheles gambiae
cluster # 5164 cluster # 5164 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5164#0 length = 620 sequences # 4

consensusID : consensus_5164#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 620
fasta sequence

                              [AATCCCGAGGTTTTTATNTTTTCAGCAAA--CGCTCAGTATGGCTTTTAAGATTGTTGTTCTGTTCGCTACCCTGGCTTGCGCCAGTGCCGGTTACGTCGAACCGGAGCACCACCATCTGTCCTATGCTGCCGCCCCGGTCGCACACTACTCGTCCGCTCC-GGCCGTAAGCTACAGCTCGATCACCCGCCACG-AAACG-CCGAAGGTGGCTGTCG-CCAAGCAGGTCA-CCTATGCTGAGCCGGCGGTCCACTACG-CTGCTCCGCTCACCAAG-ACCTATGCCGTGCACGAGCCCGCCCTGAAG-ACGGTCGTCGCCCAGCCCGCCTACACCAAGACGGTGTACGCACAGGAGCCAGCCCATGTGTACGCTCATGCCGCCCCGGTCGTTGCC-G-CAAGACGGTGTCCTATG-CCGCGCCGCAGGTCCACTACCAGGCTGNCCCG-AGGTTCACTACCAGGCCG-CCCGGCGCTGGTGAAGAACGTCGAGTACACGAAGACGCTCGCGTACGCCCCGGTCACCAAGACGCTCGTGTCCGAGCCGAACTACACAAGNACAGTCGTTGCCGAGCCGACCTACACGAAGACGCTCCTGGCCCAGCCCGCTTACACCCAAGTACNGTGTCGCAGAC]

[+] EMBL AL694528             [AATCCCGAGGTTTTTATNTTTTCAGCAAA  CGCTCAGTATGGCTTTTAAGATTGTTGTTCTGTTCGCTACCCTGGCTTGCGCCAGTGCCGGTTACGTCGAACCGGAGCACCACCATCTGTCCTATGCTGCCGCCCCGGTCGCACACTACTCGTCCGCTCCTGGCCGTAAGCTACAGCTCGATCACCCGCCACG AAACG CCGAAGGTGGCTGTCG CCAAGCAGGTCA CCTATGCTGAGCCGGCGGTCCACTACG CTG T CG TCACCAAG ACCTATGCCGTGCACGAGCCCGCCCTGAAG ACGGTCGTCGCCCAG CCGCCTACACCAAGACGGTGTACGCACAGGAGCCAG CCATGTGTACGCTCATGCCG CCCGGTCGTTGCC G CAAGACGGTGTCCTATGACCG GCCGCAGGTCCACTACCAGGCTGNCCCG AGGTTCACTACCAGGCCG CCCGGCGCTGGTGAAGAACGTCGAGTACACGAAGACGCTCGCGTACGCCCCGGTCACCAAGACGCTCGTGTCCGAGCCGAACTACACAAGNACAGTCGTTGCCGAGCCGACCTACACGAAGACGCTCCTGGCCCAGCCCGCTTACACCCAAGTACNGTGTCGCAGAC]
[+] EMBL BX620550             [              gacctaccaAGCAAAACCGCTCAAGATGGCTTTTAAGATTGTTGTTCTGTTCGCTACCCTGGCTTGCGCCAGTGCCGGTTACGTCGAACCGGAGCACCACCATCTGTCCTATGCTGCCGCCCCGGTCGCACACTACTCGTCCGCTCC GGCCGTAAGCTACAGCTCGATCACCCGCCACG AAACG CCGAAGGTGGCTGTCG CCAAGCAGGTCA CCTATGCTGAGCCGGCGGTCCACTACG CTGCTCCGCTCACCAAG ACCTATGCCGTGCACGAGCCCGCCCTGAAG ACGGTCGTCGCCCAGCCCGCCTACACCAAGACGGTGTACGCACAGGAGCCAGCCCATGTGTACGCTCATGCCGCCCCGGTCGTTGCC GCCAAGACGGTGTCCTATG CCGCGCCGCAGGTCCACTACCAGGCTGCCCCGCAGGTTCACTACCAGGCCGCCCCGGCGCTGGTGAAGAACGTCGAGTACACGAAGACGCTCGCGTACGCCCCGGTCACCAAGACGCTCGTGTCCGAGCCGAcc                                                                                     ]
[+] EMBL BX624238             [                                                                           GCTTGCGCCAGTGCCGGTTACGTCGAACCGGAGCACCACCATCTGTCCTATGCTGCCGCCCCGGTCGCACACTACTCGTCCGCTCC GGCCGTAAGCTACAGCTCGATCACCCGCCACGNAAACGNCCGAAGGTGGCTGTCGCCCAAGCAGGTCANCCTATGCTGANCCGGCGGTCCACTACGNCTGCTCCGCTCACCAAGAACCTATGCCNNGCACAAGCCCGCCCTGAAGAACGGTCGTCCCCCAGCCCGCCTACACCAAGACGGTGTACCCACAGGACCCAGCCCTTGTGTACGCTCATGCCGCCCCGGTCGTGGCCNN CAAAACGGTGTCCTATG CCGCGCCGCAGG                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX610344             [                                                                                                     ACCGGAGCACCACCATCGGTCCTATGCTGCCGCCCCGGTCGCACACTACTCGTCCGCTCC GGCCGTAAGCTACAGCTCGATCACCCGCCACG AAACG CCGAAGGGGGCTGTCG CCAAGCAGGGCA CCTATGCTGAGCCGGCGGTCCACTACG CTGCTCCGCTCACCAAG ACCTATGCCGGGCACGAGCCCGCCCTGAAG ACGGGCGTCGCCCAGCCCGCCTACACCAAGACGGGGGACGCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_5164#0
AATCCCGAGGTTTTTATNTTTTCAGCAAACGCTCAGTATGGCTTTTAAGATTGTTGTTCT
GTTCGCTACCCTGGCTTGCGCCAGTGCCGGTTACGTCGAACCGGAGCACCACCATCTGTC
CTATGCTGCCGCCCCGGTCGCACACTACTCGTCCGCTCCGGCCGTAAGCTACAGCTCGAT
CACCCGCCACGAAACGCCGAAGGTGGCTGTCGCCAAGCAGGTCACCTATGCTGAGCCGGC
GGTCCACTACGCTGCTCCGCTCACCAAGACCTATGCCGTGCACGAGCCCGCCCTGAAGAC
GGTCGTCGCCCAGCCCGCCTACACCAAGACGGTGTACGCACAGGAGCCAGCCCATGTGTA
CGCTCATGCCGCCCCGGTCGTTGCCGCAAGACGGTGTCCTATGCCGCGCCGCAGGTCCAC
TACCAGGCTGNCCCGAGGTTCACTACCAGGCCGCCCGGCGCTGGTGAAGAACGTCGAGTA
CACGAAGACGCTCGCGTACGCCCCGGTCACCAAGACGCTCGTGTCCGAGCCGAACTACAC
AAGNACAGTCGTTGCCGAGCCGACCTACACGAAGACGCTCCTGGCCCAGCCCGCTTACAC
CCAAGTACNGTGTCGCAGAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case