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Anopheles gambiae
cluster # 5404 cluster # 5404       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5404#0 length = 1137 sequences # 4  

consensusID : consensus_5404#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1137
fasta sequence
                              [TGCTGCGCTACCAATTCCCGGAGTCGGTCGTTCCGGCGGGCAACAACTAGCTCAACAAGATCGTTGTCGATGACGCATTCGGTGGGTTTGCGTACATCACCGACAACAGTGGTGCTGATCCGGGCATTGTGGTGTTTTCGCGCCGCCTCACCCGATCGTGGAAGGTGCGGGAAAACAACTCAATGCGCGCCGCCCGCAACGCGGTCCGATTTGCCGTCAACGGTACGGAGCTGAACTTTTCGATCCACATCGACAGTATCGCGCTGGGCCCGTACTACAATCCAAACCTATCGCCCGACCAGCCGGTGCCGGATACGCTTGTCAACAGTCAGAACTACGAGCGCAACGTGTACTACAGCCCACTGTCCAGCTATCACATCTACTCGCTGCCCGCGTCGCTACTGCGCGACCCAGAGTTCAATGCTCGGGCGACCCCTCGCGACATTCTCGAGGCGGTCGTCGACTACGGTCGCAAGCAGTCGCAAACGGATGGCATGTTTATGGACAACCAGGGCGTGCTGTACTACGGTCTGCTCGGCGAGCATGCCGTCGCTAAGTGGGACAGCTACAAGCCGTTCACGGAGAAGAACCAGCAGATCATTGCGAAGGATGCGACCTACATCCAGTGGGTGGACAGCATGGGCATCGACCATGAGGGCTACCTGTACGTGGTGGTGAACCGCCTGCACAACTTTGTCGCCGGCCGTCTCAACCCGCTCGAGGTGAACTTCCGCATACTGCGCGCGAAAACGGGCGCACTCAGCTACGTCTACACCCCGGACAACCTGTTCAACAGTGACGGTAAGTTCCTGTACTCGGGTGCTTCCGGTGAACCGTTCGCCGACAATGGGTTGGTTTATCAGTACGAGGGAACTACACCGGCGTCGAGCAGACTGGCCGCGGCCGGCATACTTGGTGCGAGCGGGGCGGCGACAAGCGCGGCCTCCTTCGCTGGATTTATCGGTGCCCTTGTCCTGGGCGCCGTGACTAGCATGATCGGTCGGCGTACCGTTGTTTGAGGATGGTTTGAGGAATATCGTATCGTTGTTGACATCATCACCGTTGTCCGCCAAGGACGAAACCGAGACGGCCAGATATGGAATAGATATTCCCCTCCCCCTCCCTTGCCACCTTCCT]

[+] EMBL BX616656             [TGCTGCGCTACCAATTCCCGGAGTCGGTCGTTCCGGCGGGCAACAACTAGCTCAACAAGATCGTTGTCGATGACGCATTCGGTGGGTTTGCGTACATCACCGACAACAGTGGTGCTGATCCGGGCATTGTGGTGTTTTCGCGCCGCCTCACCCGATCGTGGAAGGTGCGGGAAAACAACTCAATGCGCGCCGCCCGCAACGCGGTCCGATTTGCCGTCAACGGTACGGAGCTGAACTTTTCGATCCACATCGACAGTATCGCGCTGGGCCCGTACTACAATCCAAACCTATCGCCCGACCAGCCGGTGCCGGATACGCTTGTCAACAGTCAGAACTACGAGCGCAACGTGTACTACAGCCCACTGTCCAGCTATCACATCTACTCGCTGCCCGCGTCGCTACTGCGCGACCCAGAGTTCAATGCTCGGGCGACCCCTCGCGACATTCTCGAGGCGGTCGTCGACTACGGTCGCAAGCAGTCGCAAACGGATGGCATGTTTATGGACAACCAGGGCGTGCTGTACTACGGTCTGCTCGGCGAGCATGCCGTCGCTAAGTGGGACAGCTACAAGCCGTTCACGGAGAAGAACCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX613714             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTGTCAACAGTCAGAACTACGAGCGTAACGTCTACTACAGCCCACTGTCCAGCTATCACATCTACTCGCTGCCCGCGTCGCTACTGCGCGACCCAGAGTTCAATGCTCGGGCGACCCCTCGCGACATTCTCGAGGCGGTCGTCGACTACGGTCGCAAGCAGTCGCAAACGGATGGCATGTTTATGGACAACCAGGGCGTGCTGTACTACGGTCTGCTCGGCGAGCATGCCGTCGCTAAGTGGGACAGCTACAAGCCGTTCACGGAGAAGAACCAGCAGATCATTGCGAAGGATGCGACCTACATCCAGTGGGTGGACAGCATGGGCATCGACCATGAGGGCTACCTGTACGTGGTGGTGAACCGCCTGCACAACTTTGTCGCCGGCCGTCTCAACCCGCTCGAGGTGAACTTCCGCATACTGCGCGCGAAAACGGGCGCACTCAGCTACGTCTACACCCCGGACAACCTGTTCAACAGTGACGGTAAGTTCCTGTACTCGGGTGCTTCCGGTGAACCGTTCGCCGACAATGGGTTGGTTTATCAGTACGAGGGAACTACACCG                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BX609598             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGCTGCCCGCGTCGCTACTGCGCGACCCAGAGTTCAATGCTCGGGCGACCCCTCGCGACATTCTCGAGGCGGTCGTCGACTACGGTCGCAAGCAGTCGCAAACGGATGGCATGTTTATGGACAACCAGGGCGTGCTGTACTACGGTCTGCTCGGCTAGCATGCCGTCGCTAAGTGGGACAGCTACAAGCCGTTCATGGAGAAGAACCAGCAGATCATTGCGAAGGATGCGACCTACATCCAGTGGGTGGACAGCATGGGCATCGACCATGAGGGCTACCTGTACGTGGTGGTGAACCGCCTGCACAACTTTGTCGCCGGCCGTCTCAACCCGCTCGAGGTGAACTTCCGCATACTGCGCGCGAAAACGGGCGCACTCAGCTACGTCTACACCCCGGACAACCTGTTCAACAGTGACGGTAAGTTCCTGTACTCGGGTGCTTCCGGTGAACCGTTCGCCGACAATGGGTTGGTTTATCAGTACGAGGG                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX616678             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TACTGCGCGATCCAGAGTTCAATGCTCGGGCGACCCCTCGCGACATTCTCGAGGCGGTCGTCGACTACGGTCGCAAGCAGTCGCAAACGGATGGCATGTTTATGGACAACCAGGGCGTGCTGTACTACGGTCTGCTCGGCGAGCATGCCGTCGCTAAGTGGGACAGCTACAAGCCGTTCACGGAGAAGAACCAGCAGATCATTGCGAAGGATGCGACCTACATCCAGTGGGTGGACAGCATGGGCATCGACCATGAGGGCTACCTGTACTTGGTGGTGAACCGCCTGCACAACTTTGTCGCCGGCCGTCTCAACCCGCTCGAGGTGAACTTCCGCATACTGCGCGCGAAAACGGGCGCACTCAGCTACGTCTACACCTCGGACAACCTGTTCAACAGTGACGGTAAGTTCCTGTACTCGGGTGCTTCCGGTGAACCGTTCGCCGAAAATGGGTTGGTTTATCAGTACGAGGGAACTACACCGGCGTCGAGCAGACTGGCCGCGGCCGGCATACTTGGTGCGAGCGGGGCGGCGACAAGCGCGGCCTCCTTCGCTGGATTTATCGGTGCCCTTGTCCTGGGCGCCGTGACTAGCATGATCGGTCGGCGTACCGTTGTTTGAGGATGGTTTGAGGAATATCGTATCGTTGTTGACATCATCACCGTTGTCCGCCAAGGACGAAACCGAGACGGCCAGATATGGAATAGATATTCCCCTCCCCCTCCCTTGCCACCTTCCT]


>consensus_5404#0 TGCTGCGCTACCAATTCCCGGAGTCGGTCGTTCCGGCGGGCAACAACTAGCTCAACAAGA TCGTTGTCGATGACGCATTCGGTGGGTTTGCGTACATCACCGACAACAGTGGTGCTGATC CGGGCATTGTGGTGTTTTCGCGCCGCCTCACCCGATCGTGGAAGGTGCGGGAAAACAACT CAATGCGCGCCGCCCGCAACGCGGTCCGATTTGCCGTCAACGGTACGGAGCTGAACTTTT CGATCCACATCGACAGTATCGCGCTGGGCCCGTACTACAATCCAAACCTATCGCCCGACC AGCCGGTGCCGGATACGCTTGTCAACAGTCAGAACTACGAGCGCAACGTGTACTACAGCC CACTGTCCAGCTATCACATCTACTCGCTGCCCGCGTCGCTACTGCGCGACCCAGAGTTCA ATGCTCGGGCGACCCCTCGCGACATTCTCGAGGCGGTCGTCGACTACGGTCGCAAGCAGT CGCAAACGGATGGCATGTTTATGGACAACCAGGGCGTGCTGTACTACGGTCTGCTCGGCG AGCATGCCGTCGCTAAGTGGGACAGCTACAAGCCGTTCACGGAGAAGAACCAGCAGATCA TTGCGAAGGATGCGACCTACATCCAGTGGGTGGACAGCATGGGCATCGACCATGAGGGCT ACCTGTACGTGGTGGTGAACCGCCTGCACAACTTTGTCGCCGGCCGTCTCAACCCGCTCG AGGTGAACTTCCGCATACTGCGCGCGAAAACGGGCGCACTCAGCTACGTCTACACCCCGG ACAACCTGTTCAACAGTGACGGTAAGTTCCTGTACTCGGGTGCTTCCGGTGAACCGTTCG CCGACAATGGGTTGGTTTATCAGTACGAGGGAACTACACCGGCGTCGAGCAGACTGGCCG CGGCCGGCATACTTGGTGCGAGCGGGGCGGCGACAAGCGCGGCCTCCTTCGCTGGATTTA TCGGTGCCCTTGTCCTGGGCGCCGTGACTAGCATGATCGGTCGGCGTACCGTTGTTTGAG GATGGTTTGAGGAATATCGTATCGTTGTTGACATCATCACCGTTGTCCGCCAAGGACGAA ACCGAGACGGCCAGATATGGAATAGATATTCCCCTCCCCCTCCCTTGCCACCTTCCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)