cluster # 5407

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Anopheles gambiae
cluster # 5407 cluster # 5407 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5407#0 length = 770 sequences # 4

consensusID : consensus_5407#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 770
fasta sequence

                              [TCGCCCGAGGTTAATAGATTTTACTGTTTTGTAAGTATTTGTGGCTGCCCAAAGTAACAAGATTCGTTATGAGATGAGGTTTTTAGATTTCAAATCAGCAAGCTCTTATGCAAAGGCTTATGCGCTTTGCGTCAATTGAGTGGATGCACATCGCTGTTTATTTTAAACTGCGATATACACGAAAAGACTAGACTTGGGTAGAATGCAATAATATAGATCGATGCTTCAAGCTGATACAACACAGGCAAAGGAAGAGGAACGTTTGTATCGTTTT-TTTTTTAAATTGCGATCGAATCGAACTGTCTGAGCTGTACTGATTTATTCAAACAATTATTTTAAACCCTTGATTACGCTGGTTCGCTGCAAATTTCACAATACGCGTACGGCCGAACACGATGTGCGAAGGCAGTTAAACTATCTGTTCTGCAAAACAACGTCACAACGCAACCGGACCGAGCTACGCATACGATAAGCATT-TAGTTCTTGCAAATTCTGCATTGCGTT-T-TGAGTGTGCACACGCTGTAGGTTGTTATTTATTCGTAACAGTAACCGCTTACGTT-TAGCATTT-TAATGAAAACATAATTCGATT-TTATCTATTGTTTTAAACACCCCCCCCCCTCTCCCCCCTTTTTAATCTGTTTATCTTAGTCTGTTCTGTTCAGCAGCAATCAATCGGATGGAAGATGCGAAAGGTCCTAATTTATCGTGATTGTGTATGATAAAAACGCTGCTAATATATATTAACGCATGCATTGGTAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AL933114             [TCGCCCGAGGTTAATAGATTTTACTGTTTTGTAAGTATTTGTGGCTGCCCAAAGTAACAAGATTCGTTATGAGATGAGGTTTTTAGATTTCAAATCAGCAAGCTCTTATGCAAAGGCTTATGCGCTTTGCGTCAATTGAGTGGATGCACATCGCTGTTTATTTTAAACTGCGATATACACGAAAAGACTAGACTTGGGTAGAATGCAATAATATAGATCGATGCTTCAAGCTGATACAACACAGGCAAAGGAAGAGGAACGTTTGTATCGTTTTCTTTTTTAAATTGCGATCGAATCGAACTGTCTGAGCTGTACTGATTTATTCAAACAATTATTTTAAACCCTTGATTACGCTGGTTCGCTGCAAATTTCACAATACGCGTACGGCCGAACACGATGTGCGAAGGCAGTTAAACTATCTGTTCTGCAAAACAACGTCACAACGCAACCGGACCGAGCTACGCATACGATAAGCATTNTAGTTCTTGCAAATTCTGCATTGCGTTATCTGAGTGTGCACACGCTGTAGGTTGTNATTTATTCGTAACAGTAACCGCTTACGTTCTAGCATTTNTANTGAAAACATAATTCGATTNNTATCTATTG TTTAAACACCCCCCCCCCTCTCCCCCC  TTTAATCTG CCATCTTANTCTGTct                                                                                                                   ]
[-] EMBL BX626588             [                                                                                                            TGCAAAGGCTTATGCGCTTTGCGTCAATTGAGTGGATGCACATCGCTGTTTATTTTAAACTGCGATATACNCGAAAAGACTAGACTTGGGTAGAATGCAATAATATAGATCGATGCTTCAAGCTGATACAACACAGGCAAAGGAAGAGGAACGTTTGTATCGTTTT TTTTTTAAATTGCGATCGAATCGAACTGTCTGAGCTGTACTGATTTATTCAAACAATTATTTTAAACCCTTGATTACGCTGGTTCGCTGCAAATTTCACAATACGCGTACGGCCGAACACGATGTGCGAAGGCAGTTAAACTATCTGTTCTGCAAAACAACGTCACAACGCAACCGGACCGAGCTACGCATACGATAAGCATT TAGTTCTTGCAAATTCTGCATTGCGTT T TGAGTGTGCACACGCTGTAGGTTGTTATTTATTCGTAACAGTAACCGCTTACGTT TAGCATTT TAATGAAAACATAATTCGATT TTATCTATTGTTTTAAACACCCCCCCCCCTCTCCCCCCTTTTTAATCTGTTTATCTTAGTCTGTTCTGTTCAGCAGCAATCAATCGGATGGAAGATGCGAAAGGTCCTAATTTATCGTGATTGTGTATGATAAAAACGCTGCTAATATATATTAACGCATGCA                  ]
[-] EMBL BX626817             [                                                                                                                                                                             TATACACGAAAAGACTAGACTTGGGTAGAATGCAATAATATAGATCGATGCTTCAAGCTGATACAACACAGGCAAAGGAAGAGGAACGTTTGTATCGTTTT TTTTTTAAATTGCGATCGAATCGAACTGTCTGAGCTGTACTGATTTATTCAAACAATTATTTTAAACCCTTGATTACGCTGGTTCGCTGCAAATTTCACAATACGCGTACGGCCGAACACGATGTGCGAAGGCAGTTAAACTATCTGTTCTGCAAAACAACGTCACAACGCAACCGGACCGAGCTACGCATACGATAAGCATT TAGTTCTTGCAAATTCTGCATTGCGTT T TGAGTGTGCACACGCTGTAGGTTGTTATTTATTCGTAACAGTAACCGCTTACGTT TAGCATTT TAATGAAAACATAATTCGATT TTATCTATTGTTTTAAACACCCCCCCCCCTCTCCCCCCTTTTTAATCTGTTTATCTTAGTCTGTTCTGTTCAGCAGCAATCAATCGGATGGAAGATGCGAAAGGTCCTAATTTATCGTGATTGTGTATGATAAAAACGCTGCTAATATATATTAACGCATGCATTGGTAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL BX625023             [                                                                                                                                                                                       AAGACTAGACTTGGGTAGAATGCAATAATATAGATCGATGCTTCAAGCTGATACAACACAGGCAAAGGAAGAGGAACGTTTGTATCGTTTT TTTTTTAAATTGCGATCGAATCGAACTGTCTGAGCTGTACTGATTTATTCAAACAATTATTTTAAACCCTTGATTACGCTGGTTCGCTGCAAATTTCACAATACGCGTACGGCCGAACACGATGTGCGAAGGCAGTTAAACTATCTGTTCTGCAAAACAACGTCACAACGCAACCGGACCGAGCTACGCATACGATAAGCATT TAGTTCTTGCAAATTCTGCATTGCGTT T TGAGTGTGCACACGCTGTAGGTTGTTATTTATTCGTAACAGTAACCGCTTACGTT TAGCATTT TAATGAAAACATAATTCGATT TTATCTATTGTTTTAAACACCCCCCCCCCTCTCCCCCCTTTTTAATCTGTTTATCTTAGTCTGTTCTGTTCAGCAGCAATCAATCGGATGGAAGATGCGAAAGGTCCTAATTTATCGTGATTGTGTATGATAAAAACGCTGCTAATATATATTAACGCA                      ]




>consensus_5407#0
TCGCCCGAGGTTAATAGATTTTACTGTTTTGTAAGTATTTGTGGCTGCCCAAAGTAACAA
GATTCGTTATGAGATGAGGTTTTTAGATTTCAAATCAGCAAGCTCTTATGCAAAGGCTTA
TGCGCTTTGCGTCAATTGAGTGGATGCACATCGCTGTTTATTTTAAACTGCGATATACAC
GAAAAGACTAGACTTGGGTAGAATGCAATAATATAGATCGATGCTTCAAGCTGATACAAC
ACAGGCAAAGGAAGAGGAACGTTTGTATCGTTTTTTTTTTAAATTGCGATCGAATCGAAC
TGTCTGAGCTGTACTGATTTATTCAAACAATTATTTTAAACCCTTGATTACGCTGGTTCG
CTGCAAATTTCACAATACGCGTACGGCCGAACACGATGTGCGAAGGCAGTTAAACTATCT
GTTCTGCAAAACAACGTCACAACGCAACCGGACCGAGCTACGCATACGATAAGCATTTAG
TTCTTGCAAATTCTGCATTGCGTTTTGAGTGTGCACACGCTGTAGGTTGTTATTTATTCG
TAACAGTAACCGCTTACGTTTAGCATTTTAATGAAAACATAATTCGATTTTATCTATTGT
TTTAAACACCCCCCCCCCTCTCCCCCCTTTTTAATCTGTTTATCTTAGTCTGTTCTGTTC
AGCAGCAATCAATCGGATGGAAGATGCGAAAGGTCCTAATTTATCGTGATTGTGTATGAT
AAAAACGCTGCTAATATATATTAACGCATGCATTGGTAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case