cluster # 5631

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Anopheles gambiae
cluster # 5631 cluster # 5631 Sequences # 4 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5631#0 length = 789 sequences # 2

consensus_5631#1 length = 704 sequences # 1
consensus_5631#2 length = 651 sequences # 1

consensusID : consensus_5631#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 789
fasta sequence

                              [CAACGTGTGAAAAATAGTTGAGACAACCAATGAATGCACATCGGCAACTCTCCCTAAACTCAATGCACACATTGCACCGAGTTCACTACTGATTTAAACAACGAGAACCAAAAGCAAGCATAGCAACTAAGCTTTACTGAACGAT---ATGATGATGATGATGATGTCCCAGAAATGTAAATTTTAAACATATTAACACACAAAACATTGCATGGATGCCGCTTTCCCCACTGGATACGTCTCGAGTGATACTCATATATTTATACATTTTGTTGTACATATTGTTCGTTACAATGATAAAGTTATCGCTCCCCCCATACTACCAGCTCGTTGAACACGTTTTGTATGACTTAGAACAAGTTTTGTATGACATATGTTAAACACTTAACATGGATTTGCATTTAAACGAATAAAACATAAAGCATGCGCCTGTTTGGCATTAATGGCAAAGTTTTATGAAAATAAAAGAAGGATCGAAGTAAATAATTTTTAATGATGTAGTAGCAAAACACTAGATGCTAGCAAATTAATGGCCGTCATCGTACAAACAAAACATATTTAAAGAATTTTTTATGTATAACAAGTTTAGCTAATTTATCGATCGCAATCGTATTTATTGAGTACTATTCTATTCTATTCCTTTTCAAAATAAATTAAAATTGGAGTTTGGATTATTTTAATACACGTTGTGTCTGTTCTCAATTGAAGATACTCTATTGACAGGAAAACCCCACCTATTCCACCCATATACAGAACAATCTCTCTTTTGTCTAACTTTTTTAAAGGGTAATT]

[+] EMBL BX614204             [CAACGTGTGAAAAATAGTTGAGACAACCAATGAATGCACATCGGCAACTCTCCCTAAACTCAATGCACACATTGCACCGAGTTCACTACTGATTTAAACAACGAGAACCAAAAGCAAGCATAGCAACTAAGCTTTACTGAACGAT   ATGATGATGATGATGATGTCCCAGAAATGTAAATTTTAAACATATTAACACACAAAACATTGCATGGATGCCGCTTTCCCCACTGGATACGTCTCGAGTGATACTCATATATTTATACATTTTGTTGTACATATTGTTCGTTACAATGATAAAGTTATCGCTCCCCCCATACTACCAGCTCGTTGAACACGTTTTGTATGACTTAGAACAAGTTTTGTATGACATATGTTAAACACTTAACATGGATTTGCATTTAAACGAATAAAACATAAAGCATGCGCCTGTTTGGCATTAATGGCAAAGTTTTATGAAAATAAAAGAAGGATCGAAGTAAATAATTTTTAATGATGTAGTAGCAAAACACTAGATGCTAGCAAATTAATGGCCGTCATCGTACAAACAAA                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BM587869             [                                                                                                         ccgCAAAAGCAAGCATAGCAACTAAGCTTTACTGAACGATATGATGATGATGATGATGATGTCCCAGAAATGTAAATTTTAAACATATTAACACACAAAACATTGCATGGATGCCGCTTTCCCCACTGGATACGTCTCGAGTGATACTCATATATTTATACATTTTGTTGTACATATTGTTCGTTACAATGATAAAGTTATCGCTCCCCCCATACTACCAGCTCGTTGAACACGTTTTGTATGACTT   ACAAGTTTTGTATGACATATTTTAAACATTTAACATGGATTTGCATTTAAACGAATAAAACATAAAGCATGCGCCTGTTCGGCATTAATGGCAAAGTTTTATGAAAATAAAAGAAGGATCGAAGTAAATAATTTTTAATGATGTAGTAGCAAAACACTAGAGGCTAGCAAATTAATGGCCGTCATCGTACAAACAAAACATATTTAAAGAATTTTTTATGTATAACAAGTTTAGCTAATTTATCGATCGCAATCGTATTTATTGAGTACTATTCTATTCTATTCCTTTTCAAAATAAATTAAAATTGGAGTTTGGATTATTTTAATACACGTTGTGTCTGTTCTCAATTGAAGATACTCTATTGACAGGAAAACCCCACCTATTCCACCCATATACAGAACAATCTCTCTTTTGTCTAACTTTTTTAAAGGGTAATT]




>consensus_5631#0
CAACGTGTGAAAAATAGTTGAGACAACCAATGAATGCACATCGGCAACTCTCCCTAAACT
CAATGCACACATTGCACCGAGTTCACTACTGATTTAAACAACGAGAACCAAAAGCAAGCA
TAGCAACTAAGCTTTACTGAACGATATGATGATGATGATGATGTCCCAGAAATGTAAATT
TTAAACATATTAACACACAAAACATTGCATGGATGCCGCTTTCCCCACTGGATACGTCTC
GAGTGATACTCATATATTTATACATTTTGTTGTACATATTGTTCGTTACAATGATAAAGT
TATCGCTCCCCCCATACTACCAGCTCGTTGAACACGTTTTGTATGACTTAGAACAAGTTT
TGTATGACATATGTTAAACACTTAACATGGATTTGCATTTAAACGAATAAAACATAAAGC
ATGCGCCTGTTTGGCATTAATGGCAAAGTTTTATGAAAATAAAAGAAGGATCGAAGTAAA
TAATTTTTAATGATGTAGTAGCAAAACACTAGATGCTAGCAAATTAATGGCCGTCATCGT
ACAAACAAAACATATTTAAAGAATTTTTTATGTATAACAAGTTTAGCTAATTTATCGATC
GCAATCGTATTTATTGAGTACTATTCTATTCTATTCCTTTTCAAAATAAATTAAAATTGG
AGTTTGGATTATTTTAATACACGTTGTGTCTGTTCTCAATTGAAGATACTCTATTGACAG
GAAAACCCCACCTATTCCACCCATATACAGAACAATCTCTCTTTTGTCTAACTTTTTTAA
AGGGTAATT

consensusID : consensus_5631#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 704
fasta sequence

                              [CCGCGGACGCGTGGGCAACTTTTCTTTTTCCGGTTTAACTACCTATCTGATAAAACAAAATTAATCAGATAAAACACATATTAATGTGAGTGTTTTAAATAGAAATGAAATATTAGGTTATTAACCTTTAATAACGTGCTCCACGTATCATCTTAAAATGTGTTTGAAAAATAGATTTGTTTTAAATCATTATTCCACAATTGAAATAGAGTTTCAAGCAAAAATACTAATTTCATTCACTAGTTAAAGAGATTTTATTTATCATTCTTACAGTACACACTCCCGTACACTGTCGGTTTATCGATAAGGTCAAGTTAGTATTTACAAGAACAACAACAAAAAACACGAATACCAAGACCTGTAACAAAAACAATAGATCACGAAACTCGCTTTGCCAAAAAAAAAAAAATAACAACAAAAAACAAAACATCTTAACATCGTGTGCCATTGATTAACACAAACACTCTAAACAACAAAACAAAAAATGAATCACTAGAAAGCTTGCATAATTGACACCCGTTTGAACGACACCTTATAAAGAACACTAAGATAAAAATGAAAATAACTTTAACTGAAATGTCCCTCTAAAACATATGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTTATCGATGGAACTGTCGTAGTAGTAAACTAACTAAAAAACGCAACCAAATTACATGCATGGCTGTCGTTTAAAATCTGTCTCGAATA]

[+] EMBL BM641954             [CCGCGGACGCGTGGGCAACTTTTCTTTTTCCGGTTTAACTACCTATCTGATAAAACAAAATTAATCAGATAAAACACATATTAATGTGAGTGTTTTAAATAGAAATGAAATATTAGGTTATTAACCTTTAATAACGTGCTCCACGTATCATCTTAAAATGTGTTTGAAAAATAGATTTGTTTTAAATCATTATTCCACAATTGAAATAGAGTTTCAAGCAAAAATACTAATTTCATTCACTAGTTAAAGAGATTTTATTTATCATTCTTACAGTACACACTCCCGTACACTGTCGGTTTATCGATAAGGTCAAGTTAGTATTTACAAGAACAACAACAAAAAACACGAATACCAAGACCTGTAACAAAAACAATAGATCACGAAACTCGCTTTGCCAAAAAAAAAAAAATAACAACAAAAAACAAAACATCTTAACATCGTGTGCCATTGATTAACACAAACACTCTAAACAACAAAACAAAAAATGAATCACTAGAAAGCTTGCATAATTGACACCCGTTTGAACGACACCTTATAAAGAACACTAAGATAAAAATGAAAATAACTTTAACTGAAATGTCCCTCTAAAACATATGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTTATCGATGGAACTGTCGTAGTAGTAAACTAACTAAAAAACGCAACCAAATTACATGCATGGCTGTCGTTTAAAATCTGTCTCGAATA]




>consensus_5631#1
CCGCGGACGCGTGGGCAACTTTTCTTTTTCCGGTTTAACTACCTATCTGATAAAACAAAA
TTAATCAGATAAAACACATATTAATGTGAGTGTTTTAAATAGAAATGAAATATTAGGTTA
TTAACCTTTAATAACGTGCTCCACGTATCATCTTAAAATGTGTTTGAAAAATAGATTTGT
TTTAAATCATTATTCCACAATTGAAATAGAGTTTCAAGCAAAAATACTAATTTCATTCAC
TAGTTAAAGAGATTTTATTTATCATTCTTACAGTACACACTCCCGTACACTGTCGGTTTA
TCGATAAGGTCAAGTTAGTATTTACAAGAACAACAACAAAAAACACGAATACCAAGACCT
GTAACAAAAACAATAGATCACGAAACTCGCTTTGCCAAAAAAAAAAAAATAACAACAAAA
AACAAAACATCTTAACATCGTGTGCCATTGATTAACACAAACACTCTAAACAACAAAACA
AAAAATGAATCACTAGAAAGCTTGCATAATTGACACCCGTTTGAACGACACCTTATAAAG
AACACTAAGATAAAAATGAAAATAACTTTAACTGAAATGTCCCTCTAAAACATATGTGTA
TATGTGTGTGTGTGTGTTATCGATGGAACTGTCGTAGTAGTAAACTAACTAAAAAACGCA
ACCAAATTACATGCATGGCTGTCGTTTAAAATCTGTCTCGAATA

consensusID : consensus_5631#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 651
fasta sequence

                              [CCGATTGAGTACTATTCTATTCTATTCCTTTTAAAAATAAATTAAAATTGGAGTTTGGATTAGATTAATAAACGTTGTGTCTGTTCTTAATTAAAGTTACGCTCTTGACACGAAAACCCCACCTATTCCACCCATATACAGAACAATGGCTCTTTTATCTAATTTTGTTAAAGATTAATTAATAGCTATTTTTTAAATAGAACATACAATCCAAATAAATTACCGATTTACTACTTATAGTATCTCAGATATAGGTTATCGGATTGATTACCAAAACTTCAAATCAACCTATTCAATTACCTATTTGGTCAAACAAAACAACTCTGATGAAAAGATTAATAATATGAGTGTTTTTAAATATTAGTTAAATATTAGGTTTGTAACATTTAATAAGGTGCTCCACGTATCATCTTAAAATGTGTGTGAAAAATATATTTGTTTTAAATCATAATTTTACAGTTAGTATAGAGTTTCCAACAACAATATTAGTTTCATTACTAGTTTCACCAGTTAAAGAGATTTTATTTATCATTCTTACAGTACACACCCCCGTTACACTGTCGGTTTATCGATAAGGTCAAGTTAGTATTTACAATAACAACAACAAAAAACATGAATACCAAGACCTGTAACAAAAAATAATTGATCACG]

[+] EMBL BM587876             [CCGATTGAGTACTATTCTATTCTATTCCTTTTAAAAATAAATTAAAATTGGAGTTTGGATTAGATTAATAAACGTTGTGTCTGTTCTTAATTAAAGTTACGCTCTTGACACGAAAACCCCACCTATTCCACCCATATACAGAACAATGGCTCTTTTATCTAATTTTGTTAAAGATTAATTAATAGCTATTTTTTAAATAGAACATACAATCCAAATAAATTACCGATTTACTACTTATAGTATCTCAGATATAGGTTATCGGATTGATTACCAAAACTTCAAATCAACCTATTCAATTACCTATTTGGTCAAACAAAACAACTCTGATGAAAAGATTAATAATATGAGTGTTTTTAAATATTAGTTAAATATTAGGTTTGTAACATTTAATAAGGTGCTCCACGTATCATCTTAAAATGTGTGTGAAAAATATATTTGTTTTAAATCATAATTTTACAGTTAGTATAGAGTTTCCAACAACAATATTAGTTTCATTACTAGTTTCACCAGTTAAAGAGATTTTATTTATCATTCTTACAGTACACACCCCCGTTACACTGTCGGTTTATCGATAAGGTCAAGTTAGTATTTACAATAACAACAACAAAAAACATGAATACCAAGACCTGTAACAAAAAATAATTGATCACG]




>consensus_5631#2
CCGATTGAGTACTATTCTATTCTATTCCTTTTAAAAATAAATTAAAATTGGAGTTTGGAT
TAGATTAATAAACGTTGTGTCTGTTCTTAATTAAAGTTACGCTCTTGACACGAAAACCCC
ACCTATTCCACCCATATACAGAACAATGGCTCTTTTATCTAATTTTGTTAAAGATTAATT
AATAGCTATTTTTTAAATAGAACATACAATCCAAATAAATTACCGATTTACTACTTATAG
TATCTCAGATATAGGTTATCGGATTGATTACCAAAACTTCAAATCAACCTATTCAATTAC
CTATTTGGTCAAACAAAACAACTCTGATGAAAAGATTAATAATATGAGTGTTTTTAAATA
TTAGTTAAATATTAGGTTTGTAACATTTAATAAGGTGCTCCACGTATCATCTTAAAATGT
GTGTGAAAAATATATTTGTTTTAAATCATAATTTTACAGTTAGTATAGAGTTTCCAACAA
CAATATTAGTTTCATTACTAGTTTCACCAGTTAAAGAGATTTTATTTATCATTCTTACAG
TACACACCCCCGTTACACTGTCGGTTTATCGATAAGGTCAAGTTAGTATTTACAATAACA
ACAACAAAAAACATGAATACCAAGACCTGTAACAAAAAATAATTGATCACG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_5631#1      --------------------------------------------------CCGCGGACGC 10
consensus_5631#2      -----------------------------------------------------CCGAT-T 6
consensus_5631#0      CAACGTGTGAAAAATAGTTGAGACAACCAATGAATGCACATCGGCAACTCTCCCTAAACT 60
                                                                           *  *   

consensus_5631#1      GTGGGC---AACTTTTCTTTTTCCGGTTTAACTACCTATCTGATAAAACAAAATTAATCA 67
consensus_5631#2      GAGTAC---TATTCTATTCTATTCCTTTTAAAAATAAAT-TAAAATTGGAGTTTGGATTA 62
consensus_5631#0      CAATGCACACATTGCACCGAGTTCACTACTGATTTAAACAACGAGAACCAAAAGCAAGCA 120
                           *    * *        * *  *          *           *      *  *

consensus_5631#1      GATAAAACACATATTAATGTGAGTGTTTTAAATAGAAATGAAATATTAGGTTATTAACCT 127
consensus_5631#2      GATTAA-TAAACGTT---GTGTCTGTTCTTAATTAAAGTTACGCTCTTGACACGAAAACC 118
consensus_5631#0      TAGCAACTAAGCTTTACTGAACGATATGATGATGATGATGATGTCCCAGAAATGTAAATT 180
                       *  **  *    **   *       *    **     * *       *      **   

consensus_5631#1      TTAATAACGTGCTC-CACGTAT-----CATCTTAAAATGTGTTTGAAAAATAGATTTGTT 181
consensus_5631#2      CCA----CCTATTC-CACCCATA----TACAGAACAATGGCTCTTTTATCTAATTTTGTT 169
consensus_5631#0      TTA--AACATATTAACACACAAAACATTGCATGGATGCCGCTTTCCCCACTGGATACGTC 238
                        *    * *  *  ***  *                    * *      *   *  ** 

consensus_5631#1      TTAAAT----------CA-TTATT--CCACAATTGAAATAGAGTTTCAAGCAAAAATACT 228
consensus_5631#2      AAAGAT----------TAATTAATAGCTATTTTTTAAATAGAACATACAATCCAAATAAA 219
consensus_5631#0      TCGAGTGATACTCATATATTTATACATTTTGTTGTACATATTGTTCGTTACAATGATAAA 298
                           *           * ***          *  * ***               ***  

consensus_5631#1      AATTTCATTCACTAGTTAAAGAGATTTTA---TTTATCATTCTTAC----AGTACACACT 281
consensus_5631#2      TTACCGATTTACTACTTATAGT-ATCTCA---GATATAGGT--TAT----CGGATTGATT 269
consensus_5631#0      GTTATCGCTCCCCCCATACTACCAGCTCGTTGAACACGTTTTGTATGACTTAGAACAAGT 358
                              *  *    **     *  *        *    *  **        *   * *

consensus_5631#1      CCCGTACACTGTCGGTTTATCGATAAGGTCAAGTTAGTATTTACA-AGAACAACAACAAA 340
consensus_5631#2      ACCAAA-ACTTCAAATCAACCTATTCAATTACCTATTTGGTCAAACAAAACAACTCTGAT 328
consensus_5631#0      TTTGTATGACATATGTTAAACACTTAACATGGATTTGCATTTAAACGAATAAAACATAAA 418
                           *         *  * *  *         *      * * *   *  **     * 

consensus_5631#1      AAACACGAAT-------ACCAAGACCTGTAACAA-AAACAATAGATCACGAAACTCGCTT 392
consensus_5631#2      GAAAA-GATT-------AATAATATGAGTGTTTT-TAAATATTAGTTA-AATATTAGGTT 378
consensus_5631#0      GCATGCGCCTGTTTGGCATTAATGGCAAAGTTTTATGAAAATAAAAGAAGGATCGAAGTA 478
                        *   *  *       *  **               *  **     *          * 

consensus_5631#1      TGCCAAAAAAAAAAAAATAACAACAAAAAAC-AAAACATCTTAACATCGTG--TGCCATT 449
consensus_5631#2      TGTAACATTTAATAAGGTGCTCC------AC-GTATCATCTTAAAAT-GTG--TG----T 424
consensus_5631#0      AATAATTTTTAATGATGTAGTAGCAAAACACTAGATGCTAGCAAATTAATGGCCGTCATC 538
                          *     **  *  *           **   *   *   **  *  **   *     

consensus_5631#1      GATTAACACAAACACTCTAAACAACAAAACAAAAAATGAATCACTAGAAAGCTTGCATAA 509
consensus_5631#2      GAAAAATATATTTGTTTTAAATCATAATTTTACAG-----TTAGTATAGAGTTTCCAACA 479
consensus_5631#0      GTACAAACAAAACATATTTAAAGAATTTTTTATGTAT-AACAAGTTTAGCTAATTTATCG 597
                      *   **   *       * **  *       *          * *  *     *  *   

consensus_5631#1      TTGACACCCGT-TTGAACGACACCTTATAAAGAACACTAAGATAAAAATGAAAATAACTT 568
consensus_5631#2      ACAATATTAGT-TTCATTACTAGTTT--------CACCAG--------TTAAAGAGATTT 522
consensus_5631#0      ATCGCAATCGTATTTATTGAGTACTATTCTATTCTATTCCTTTTCAAAATAAATTAAAAT 657
                           *   ** ** *        *          *              ***   *  *

consensus_5631#1      TA---ACTGAAATGTCCC--TCTAAAACATATGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTTATCGA 623
consensus_5631#2      TA---TTT--ATCATTCT--TACAGTACACACCCCCGTTACACTGTCGGT---TTATCGA 572
consensus_5631#0      TGGAGTTTGGATTATTTTAATACACGTTGTGTCTGTTCTCAATTGAAGATACTCTATTGA 717
                      *      *  *   *     *  *                   **    *    *** **

consensus_5631#1      TGGAACTGTCGTAGTAGT-AAACTAACTAAAAAACGCAAC-CAAATTACATGCATGGCTG 681
consensus_5631#2      TAAGGTCAAGTTAGTATTTACAATAACAACAACAAAAAACATGAATACCAAGACCTGTAA 632
consensus_5631#0      CAGGAAAACCCCACCTATTCCACCCATATACAGAACAATCTCTCTTTTGTCTAACTTTTT 777
                                  *    *   *   *     * *   * *     *              

consensus_5631#1      TCGTTTAAAATCTGTCTCGAATA 704
consensus_5631#2      CAAAAAATAATTGATCACG---- 651
consensus_5631#0      TAAAGGGTAATT----------- 789
                              ***