These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5811#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1221 fasta sequence [GTTTTTATTCAGTGTCTACGAAAATCTCATACATAACTTATCCTCCGTTTAAGCTTATCCTTTAAAGCACTGTTTAAGTATTGACTTTATCTCGCAAAGCGTTTTTACTTATTTTACTCTGTGTTGTTTTTGATAATCTATTACCAAAAACAGAAGGTTCGTACAGTGGACATACCCCGGCGTACAAGTATGCATCGCACAAAGCACGTTGTGTACACATTTTGGCAAACTAAAACAAACATACCGTGATATCGTGACGACAACAACAATACTGTCCCCTCAGCAAAGGAAGTTGAAATCACGGTTTTAAACAGATGTACCGCATGCAAAAGATAATGGGGGGAATAATGATCAGCTTATGTTGAGACGATAAAAAAGCAATAGAACAGATAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTGCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCGACATACGCGCTTAAAACAGAAATCGTGAACATGTTTTAACATAACCATACACAAAAGGTTCAACCTTCCAACGCAATACAATGCTGGATGAATGTGTCTAACGAAAATTCACTAAAATATAGATGCGGCATTATTTGTTTCTTACAGCAATGGCGCCTTCTGGCTAGTATTCTGCTGCGCTAGTTTTTTGTCATAGTGGTTTGATCACAAGCCCGAAGAAGTTTCTCTTTGAATCCTTTTGTAATCATTAAAAAAATATCGTGACATTTTCTCTTCC] [+] EMBL CNS09JWV [GTTTTTATTCAGTGTCTACGAAAATCTCATACATAACTTATCCTCCGTTTAAGCTTATCCTTTAAAGCACTGTTTAAGTATTGACTTTATCTCGCAAAGCGTTTTTACTTATTTTACTCTGTGTTGTTTTTGATAATCTATTACCAAAAACAGAAGGTTCGTACAGTGGACATACCCCGGCGTACAAGTATGCATCGCACAAAGCACGTTGTGTACACATTTTGGCAAACTAAAACAAACATACCGTGATATCGTGACGACAACAACAATACTGTCCCCTCAGCAAAGGAAGTTGAAATCACGGTTTTAAACAGATGTACCGCATGCAAAAGATAATGGGGGGAATAATGATCAGCTTATGTTGAGACGATAAAAAAGCAATAGAACAGATAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTTCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCaa ] [+] EMBL CNS09OI4 [ ttcCAGTTTCTACGAAAATCTCATACATAACTTATCCTCCGTTTAAGCTTATCCTTTAAAGCACTGTTTAAGTATTGACTTTATCTCGCAAAGCGTTTTTACTTATTTTACTCTGTGTTGTTTTTGATAATCTATTACCAAAAACAGAAGGTTCGTACAGTGGACATACCCCGGCGTACAAGTATGCATCGCACAAAGCACGTTGGGTACACATTTTGGCAAACTAAAACAAACATACCGTGATATCGTGACGACAACAACAATACTGTCCCCTCAGCAAAGGAAGTTGAAATCACGGTTTTAAACAGATGTACCGCATGCAAAAGATAATGGGGGGAATAATGATCAGCTTATGTTGAGACGATAAAAAAGCAATAGAACAGATAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTCCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCT ] [-] EMBL CNS09JWU [ TAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTGCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCGACATACGCGCTTAAAACAGAAATCGTGAACATGTTTTAACATAACCATACACAAAAGGTTCAACCTTCCAACGCAATACAATGCTGGATGAATGTGTCTAACGAAAATTCACTAAAATATAGATGCGGCATTATTTGTTTCTTACAGCAATGGCGCCTTCTGGCTAGTATTCTGCTGCGCTAGTTTTTTGTCATAGTGGTTTGATCACAAGCCCGAAGAAGTTTCTCTTTGAATCCTTTTGTAATCATTAAAAAAAT ] [-] EMBL CNS09OI3 [ CTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTGCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCGACATACGCGCTTAAAACAGAAATCGTGAACATGTTTTAACATAACCATACACAAAAGGTTCAACCTTCCAAC CAATACAATGCTGGATGAATGTGTCTAACGAAAATTCACTAAAATATAGATGCGGCATTATTTGTTTCTTACAGCAATGGCGCCTTCTGGCTAGTATTCTGCTGCGCTAGTTTTTTGTCATAGTGGTTTGATCACAAGCCCGAAGAAGTTTCT TTTGAATCCTTTTGTAATCATTAAAAAAATATCGTGACATTTTCTCTTCC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||