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Anopheles gambiae
cluster # 5811 cluster # 5811       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5811#0 length = 1221 sequences # 4  

consensusID : consensus_5811#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1221
fasta sequence
                              [GTTTTTATTCAGTGTCTACGAAAATCTCATACATAACTTATCCTCCGTTTAAGCTTATCCTTTAAAGCACTGTTTAAGTATTGACTTTATCTCGCAAAGCGTTTTTACTTATTTTACTCTGTGTTGTTTTTGATAATCTATTACCAAAAACAGAAGGTTCGTACAGTGGACATACCCCGGCGTACAAGTATGCATCGCACAAAGCACGTTGTGTACACATTTTGGCAAACTAAAACAAACATACCGTGATATCGTGACGACAACAACAATACTGTCCCCTCAGCAAAGGAAGTTGAAATCACGGTTTTAAACAGATGTACCGCATGCAAAAGATAATGGGGGGAATAATGATCAGCTTATGTTGAGACGATAAAAAAGCAATAGAACAGATAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTGCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCGACATACGCGCTTAAAACAGAAATCGTGAACATGTTTTAACATAACCATACACAAAAGGTTCAACCTTCCAACGCAATACAATGCTGGATGAATGTGTCTAACGAAAATTCACTAAAATATAGATGCGGCATTATTTGTTTCTTACAGCAATGGCGCCTTCTGGCTAGTATTCTGCTGCGCTAGTTTTTTGTCATAGTGGTTTGATCACAAGCCCGAAGAAGTTTCTCTTTGAATCCTTTTGTAATCATTAAAAAAATATCGTGACATTTTCTCTTCC]

[+] EMBL CNS09JWV             [GTTTTTATTCAGTGTCTACGAAAATCTCATACATAACTTATCCTCCGTTTAAGCTTATCCTTTAAAGCACTGTTTAAGTATTGACTTTATCTCGCAAAGCGTTTTTACTTATTTTACTCTGTGTTGTTTTTGATAATCTATTACCAAAAACAGAAGGTTCGTACAGTGGACATACCCCGGCGTACAAGTATGCATCGCACAAAGCACGTTGTGTACACATTTTGGCAAACTAAAACAAACATACCGTGATATCGTGACGACAACAACAATACTGTCCCCTCAGCAAAGGAAGTTGAAATCACGGTTTTAAACAGATGTACCGCATGCAAAAGATAATGGGGGGAATAATGATCAGCTTATGTTGAGACGATAAAAAAGCAATAGAACAGATAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTTCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCaa                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CNS09OI4             [      ttcCAGTTTCTACGAAAATCTCATACATAACTTATCCTCCGTTTAAGCTTATCCTTTAAAGCACTGTTTAAGTATTGACTTTATCTCGCAAAGCGTTTTTACTTATTTTACTCTGTGTTGTTTTTGATAATCTATTACCAAAAACAGAAGGTTCGTACAGTGGACATACCCCGGCGTACAAGTATGCATCGCACAAAGCACGTTGGGTACACATTTTGGCAAACTAAAACAAACATACCGTGATATCGTGACGACAACAACAATACTGTCCCCTCAGCAAAGGAAGTTGAAATCACGGTTTTAAACAGATGTACCGCATGCAAAAGATAATGGGGGGAATAATGATCAGCTTATGTTGAGACGATAAAAAAGCAATAGAACAGATAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTCCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CNS09JWU             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTATTAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAGGGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTGCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCGACATACGCGCTTAAAACAGAAATCGTGAACATGTTTTAACATAACCATACACAAAAGGTTCAACCTTCCAACGCAATACAATGCTGGATGAATGTGTCTAACGAAAATTCACTAAAATATAGATGCGGCATTATTTGTTTCTTACAGCAATGGCGCCTTCTGGCTAGTATTCTGCTGCGCTAGTTTTTTGTCATAGTGGTTTGATCACAAGCCCGAAGAAGTTTCTCTTTGAATCCTTTTGTAATCATTAAAAAAAT                    ]
[-] EMBL CNS09OI3             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTCTTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAATAATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTGCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACACTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAAAGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTACATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAAACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGTAAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCGACATACGCGCTTAAAACAGAAATCGTGAACATGTTTTAACATAACCATACACAAAAGGTTCAACCTTCCAAC CAATACAATGCTGGATGAATGTGTCTAACGAAAATTCACTAAAATATAGATGCGGCATTATTTGTTTCTTACAGCAATGGCGCCTTCTGGCTAGTATTCTGCTGCGCTAGTTTTTTGTCATAGTGGTTTGATCACAAGCCCGAAGAAGTTTCT TTTGAATCCTTTTGTAATCATTAAAAAAATATCGTGACATTTTCTCTTCC]


>consensus_5811#0 GTTTTTATTCAGTGTCTACGAAAATCTCATACATAACTTATCCTCCGTTTAAGCTTATCC TTTAAAGCACTGTTTAAGTATTGACTTTATCTCGCAAAGCGTTTTTACTTATTTTACTCT GTGTTGTTTTTGATAATCTATTACCAAAAACAGAAGGTTCGTACAGTGGACATACCCCGG CGTACAAGTATGCATCGCACAAAGCACGTTGTGTACACATTTTGGCAAACTAAAACAAAC ATACCGTGATATCGTGACGACAACAACAATACTGTCCCCTCAGCAAAGGAAGTTGAAATC ACGGTTTTAAACAGATGTACCGCATGCAAAAGATAATGGGGGGAATAATGATCAGCTTAT GTTGAGACGATAAAAAAGCAATAGAACAGATAGTCGATTTCGTCTCAGGATTTTCGTTAT TAAATAACTTCAAGCATTTGCTTCTGAAGCTTAAGGCCCTATCATTCGATCGATCCAGAG GGCTCATGTGTTTCATGCAACTGTACACACGTGCTTTGCTCTCTGTGTGTGTGTGTTTTC TTTTCATTTCGGAAATATGCCATATTTGCGGGTTGTTTTCTGGTTACGCTTTTGTTTAAT AATACTAGCATTACTTGGCGTCCTTTCCAGTGCTGTCTAGCCCGCTGTTTTTACCGGACA CTTCCATCTAATTCTAGATTCGCATGAACACGACCCTCTCTTGATCTCTTAAAAATCTAA AGCAAATGCCTACATACTATCAAAGATACTGGTGGTGCTGGTTGTTCTGCCTGTTTTGTA CATTCGCATACAAAGTAATCGGGGGATTATGTTAACAACAAAACTTACTTTAATTTGCAA ACTTATTGTTGACTATTAGACTATAAGCTGTTATGAATGACATGCTGTCAAAATAGTGGT AAAAGCTAGATAGTTTGACGGAAAGTATCGGAAAATATACATCGACATACGCGCTTAAAA CAGAAATCGTGAACATGTTTTAACATAACCATACACAAAAGGTTCAACCTTCCAACGCAA TACAATGCTGGATGAATGTGTCTAACGAAAATTCACTAAAATATAGATGCGGCATTATTT GTTTCTTACAGCAATGGCGCCTTCTGGCTAGTATTCTGCTGCGCTAGTTTTTTGTCATAG TGGTTTGATCACAAGCCCGAAGAAGTTTCTCTTTGAATCCTTTTGTAATCATTAAAAAAA TATCGTGACATTTTCTCTTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)