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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5963#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1663 fasta sequence
[AATACATTATTCCAGGAGCCGCGCAAATGCGACGCAGCTGTGCTTTAGAGAAGAGATTCGCGTTTGTCTGGTGTTTTGTTTTTAATTTGTCTGTTTTTTGTTTTAACCATTAAGCCCAAAGTAATTTTTTGTTTCGTTCTATCGCAGCATACAATGCTTATCAATGAATAATTGAATTTAAAAAAAATATATGGAGATAAGCCACATTTATAGGTTAACAGACACACACACCCGTACAGCTGCAGTGGCTGCAGTGAACAGGAAAAGATATACCAAAATTCAACATGTTATCCAAGATAATTCAGAGCAGCGTACACTAAAGCGAAGGTTAAATTGCAACAACAAAAAACACTTACATGCGTCCCTTAACTCACACACAAACACAGATGTATTAAGCCAGCAAGAGGAAGGATGTTTTAGTGCCCTTTCATCACATGAAAACGTAATGACAATGTGTGTTTTATTACTAATTAAGTTAAAACCCCTTTCACCCAATCGAACGGGGGCTCTTCACGAATCGCTAATCAGAATCAGAAGATACACTGAATAATCACGTCTGGCCAAAACACCCCCCAGCAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAGCTAGGTCTTTTTACACACTGTCGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC-ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC-CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC-CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTCGCATCCTACGACAAACTGTTTAAAATTCGCGTCCCACGCCCAAGAAGGACTGAGGAAGGCTAGGATAGTATCCCCTCTTTTTTGCGTTGTAGTTTCATTGCCGTTACTCTATGCCTTTCGATATAAACACACAAAAACTATTAAGGAGAAAAAGCAAAACATCGAAACGTAACTTCACTCTGTGGGAACTGGGAACGTGGGGAGGGATTGACGCGTGATTGGGAATGAGCGGAGGAAATATTTATTGTATTGAACCTAGAATCTGTTCTTTCTTGTATACCCATTAAAACTGATATTGAAAAC]
[+] EMBL CNS09F24 [AATACATTATTCCAGGAGCCGCGCAAATGCGACGCAGCTGTGCTTTAGAGAAGAGATTCGCGTTTGTCTGGTGTTTTGTTTTTAATTTGTCTGTTTTTTGTTTTAACCATTAAGCCCAAAGTAATTTTTTGTTTCGTTCTATCGCAGCATACAATGCTTATCAATGAATAATTGAATTTAAAAAAAATATATGGAGATAAGCCACATTTATAGGTTAACAGACACACACACCCGTACAGCTGCAGTGGCTGCAGTGAACAGGAAAAGATATACCAAAATTCAACATGTTATCCAAGATAATTCAGAGCAGCGTACACTAAAGCGAAGGTTAAATTGCAACAACAAAAAACACTTACATGCGTCCCTTAACTCACACACAAACACAGATGTATTAAGCCAGCAAGAGGAAGGATGTTTTAGTGCCCTTTCATCACATGAAAACGTAATGACAATGTGTGTTTTATTACTAATTAAGTTAAAACCCCTTTCACCCAATCGAACGGGGGCTCTTCACGAATCGCTAATCAGAATCAGAAGATACACTGAATAATCACGTCTGGCCAAAACACCCCCCAGCAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAGCTAGGTCTTTTTACACACTGTCGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGC TTCAATCTGTAACGTTGATTGGTTTA ]
[+] EMBL BX628153 [ CCCAGCAACAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAACTAGGCCTTTTTACACACTGTTGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTG ]
[+] EMBL BX615037 [ TATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGCAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATTATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTC ]
[+] EMBL BX616704 [ ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAG TTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTATACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACG ]
[-] EMBL CNS09F25 [ AGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTAACACATTTGGTTATAG TTTTTTGTTTGTTTGTGCAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGCACCTCTCAGAGCTTAGACACGACACTGACCAAGACTTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGAAAAGACACAGCTTGGTTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTCGCATCCTACGACAAACTGTTTAAAATTCGCGTCCCACGCCCAAGAAGGACTGAGGAAGGCTAGGATAGTATCCCCTCTTTTTTGCGTTGTAGTTTCATTGCCGTTACTCTATGCCTTTCGATATAAACACACAAAAACTATTAAGGAGAAAAAGCAAAACATCGAAACGTAACTTCACTCTGTGGGAACTGGGAACGTGGGGAGGGATTGACGCGTGATTGGGAATGAGCGGAGGAAATATTTATTGTATTGAACCTAGAATCTGTTCTTTCTTGTATACCCATTAAAACTGATATTGAAAAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||