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Anopheles gambiae
cluster # 6156 cluster # 6156       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6156#0 length = 1020 sequences # 5  

consensusID : consensus_6156#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1020
fasta sequence
                              [TTTCGTTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA-CCCGTGCGCCTCCTCGAACC-GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC-GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGTTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTTGCGCTTCCGCTGCTGGTAGTCGGCCAGCTCGGCCGCATCGGAAATCTTTTGCTTCGGCGGCGGTGGCAGAATTTCCAGATCACGCTCCTTCGCCTCACGCAGCAGCTGTTCAGCGGTGATTTGCACCTCCGCTGGTGCTTTGTTTTTCACCTTTGCCACTTTGGGCATTTTCTGTGGTTTCTCCATGGTAGTGGATGGTTTTTGTTGAAATTTTTAACGCGATTCACCTGGTTGCGTTGCGTCGG]

[+] EMBL BX627283             [TTTCGTTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGGTCCGATGGTCGNTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTNCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL BM639628             [TTTCGTTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAACGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCCACATTCTCCAGCATTTCCTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCGTGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX627436             [     TTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTACTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGNCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCTCGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTTCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGGTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTT                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BM607368             [                                                                                                                                                  TACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGTTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTTGCGCTTCCGCTGCTGGTAGTCGGCCAGCTCGGCCGCATCGGAAATCTTTTGCTTCGG                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL BM617799             [                                                                                                                                                                                                                                                                  gttgGTACCCAGTGCGCGACCCATTGATGAACCCCGTGCGCTTCCTCGAACCGGGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCCTGGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTTAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGTTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTTGCGCTTCCGCTGCTGGTAGTCGGCCAGCTCGGCCGCATCGGAAATCTTTTGCTTCGGCGGCGGTGGCAGAATTTCCAGATCACGCTCCTTCGCCTCACGCAGCAGCTGTTCAGCGGTGATTTGCACCTCCGCTGGTGCTTTGTTTTTCACCTTTGCCACTTTGGGCATTTTCTGTGGTTTCTCCATGGTAGTGGATGGTTTTTGTTGAAATTTTTAACGCGATTCACCTGGTTGCGTTGCGTCGG]


>consensus_6156#0 TTTCGTTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGC CCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGC GATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCT TCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGC CGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAACCCGTGCGCCT CCTCGAACCGGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCCGGATGTACCATCACGAACCGCT CGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTT GCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGG CAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCG GCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCA TCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCAC GCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACT TGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGTTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTTGCGCT TCCGCTGCTGGTAGTCGGCCAGCTCGGCCGCATCGGAAATCTTTTGCTTCGGCGGCGGTG GCAGAATTTCCAGATCACGCTCCTTCGCCTCACGCAGCAGCTGTTCAGCGGTGATTTGCA CCTCCGCTGGTGCTTTGTTTTTCACCTTTGCCACTTTGGGCATTTTCTGTGGTTTCTCCA TGGTAGTGGATGGTTTTTGTTGAAATTTTTAACGCGATTCACCTGGTTGCGTTGCGTCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)