cluster # 6452

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Anopheles gambiae
cluster # 6452 cluster # 6452 Sequences # 5 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6452#0 length = 954 sequences # 1

consensus_6452#1 length = 717 sequences # 4

consensusID : consensus_6452#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 954
fasta sequence

                              [TTACTTCCTTCTCCTTTTAAGGGAAAATAGAACATTTTCCAGTTCCTGTCCTGTTCAAAGCTTACACGCCGGTGTGCTTCTTCACCCAATCCCGGAAGGCGGTAACGCGTGCGAACGCAGCCGGATGGCCCTTGTCGCAGCCCTGCGCATGGCCGAAGCTCACCACACCGACCAGCGTCTTATCCTCCGCTAGCACCAGCGGACCACCGGAATCCCCATTGCAGGGCGAGCGCACTCCTCCCCAACCGCGCACAGCGTGCTCTTGCGCACCAGCAGCGGGCTGAACGTTTTCTGGCATTGCTTGTTCGGGATCACCTTGAGCGTGGCGTACTGCAGCTCCTGCGCTACCTGGCCCCCGTTCACCATCAAGCCCCAGCCGCTGACGACGACCTCCCGGCCGGCAAAGTCCTCATCACCCGTCGGCAGCCGGACGGGCTGGACGCGCTCGCTGAACTCCACCTTGCTGGGCAGCTTCACCAGCGCGACATCGTTAGCCACGAACAGTGGGTTGTACTTTTCGTGCTTGAAGAACTCGGTCGACTCCAGCACCAGCCGGCCGTCGTTCGTGTTGTCGCTGAAATCGACCGCCCCGAGGTGCACCTCGATCGACTTCGCCAGCATCACGCAGTGGCCCGCCGTCAGGACCCACTCCTCGTTCAGCAGCGAGCCACCGCACAGCGCCTGCTGGCCGTTGCCCACGTGCAGCGTGAGCCGAACTTGGTACGGAAACTGGCCCAGCTTAGCCGTTTCGCCGTTCACCACCCGCATACCGCCGTGGGGGGCGGCCTGGGCGACCGAAGCCACCAACGCGAGCAGAGCAAGGGCGCAAGTTGCCGGTTGCATTTTGTGCACTTCAAAACACTCTTTAACACACTGCTTGGGGGGATCCTCTGCGATGGAGGACGGACGAACGAACTGTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCTTTTTTTTTCTTTTT]

[+] EMBL CNS09JQ1             [TTACTTCCTTCTCCTTTTAAGGGAAAATAGAACATTTTCCAGTTCCTGTCCTGTTCAAAGCTTACACGCCGGTGTGCTTCTTCACCCAATCCCGGAAGGCGGTAACGCGTGCGAACGCAGCCGGATGGCCCTTGTCGCAGCCCTGCGCATGGCCGAAGCTCACCACACCGACCAGCGTCTTATCCTCCGCTAGCACCAGCGGACCACCGGAATCCCCATTGCAGGGCGAGCGCACTCCTCCCCAACCGCGCACAGCGTGCTCTTGCGCACCAGCAGCGGGCTGAACGTTTTCTGGCATTGCTTGTTCGGGATCACCTTGAGCGTGGCGTACTGCAGCTCCTGCGCTACCTGGCCCCCGTTCACCATCAAGCCCCAGCCGCTGACGACGACCTCCCGGCCGGCAAAGTCCTCATCACCCGTCGGCAGCCGGACGGGCTGGACGCGCTCGCTGAACTCCACCTTGCTGGGCAGCTTCACCAGCGCGACATCGTTAGCCACGAACAGTGGGTTGTACTTTTCGTGCTTGAAGAACTCGGTCGACTCCAGCACCAGCCGGCCGTCGTTCGTGTTGTCGCTGAAATCGACCGCCCCGAGGTGCACCTCGATCGACTTCGCCAGCATCACGCAGTGGCCCGCCGTCAGGACCCACTCCTCGTTCAGCAGCGAGCCACCGCACAGCGCCTGCTGGCCGTTGCCCACGTGCAGCGTGAGCCGAACTTGGTACGGAAACTGGCCCAGCTTAGCCGTTTCGCCGTTCACCACCCGCATACCGCCGTGGGGGGCGGCCTGGGCGACCGAAGCCACCAACGCGAGCAGAGCAAGGGCGCAAGTTGCCGGTTGCATTTTGTGCACTTCAAAACACTCTTTAACACACTGCTTGGGGGGATCCTCTGCGATGGAGGACGGACGAACGAACTGTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCTTTTTTTTTCTTTTT]




>consensus_6452#0
TTACTTCCTTCTCCTTTTAAGGGAAAATAGAACATTTTCCAGTTCCTGTCCTGTTCAAAG
CTTACACGCCGGTGTGCTTCTTCACCCAATCCCGGAAGGCGGTAACGCGTGCGAACGCAG
CCGGATGGCCCTTGTCGCAGCCCTGCGCATGGCCGAAGCTCACCACACCGACCAGCGTCT
TATCCTCCGCTAGCACCAGCGGACCACCGGAATCCCCATTGCAGGGCGAGCGCACTCCTC
CCCAACCGCGCACAGCGTGCTCTTGCGCACCAGCAGCGGGCTGAACGTTTTCTGGCATTG
CTTGTTCGGGATCACCTTGAGCGTGGCGTACTGCAGCTCCTGCGCTACCTGGCCCCCGTT
CACCATCAAGCCCCAGCCGCTGACGACGACCTCCCGGCCGGCAAAGTCCTCATCACCCGT
CGGCAGCCGGACGGGCTGGACGCGCTCGCTGAACTCCACCTTGCTGGGCAGCTTCACCAG
CGCGACATCGTTAGCCACGAACAGTGGGTTGTACTTTTCGTGCTTGAAGAACTCGGTCGA
CTCCAGCACCAGCCGGCCGTCGTTCGTGTTGTCGCTGAAATCGACCGCCCCGAGGTGCAC
CTCGATCGACTTCGCCAGCATCACGCAGTGGCCCGCCGTCAGGACCCACTCCTCGTTCAG
CAGCGAGCCACCGCACAGCGCCTGCTGGCCGTTGCCCACGTGCAGCGTGAGCCGAACTTG
GTACGGAAACTGGCCCAGCTTAGCCGTTTCGCCGTTCACCACCCGCATACCGCCGTGGGG
GGCGGCCTGGGCGACCGAAGCCACCAACGCGAGCAGAGCAAGGGCGCAAGTTGCCGGTTG
CATTTTGTGCACTTCAAAACACTCTTTAACACACTGCTTGGGGGGATCCTCTGCGATGGA
GGACGGACGAACGAACTGTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCTTTTTTTTTCTTTTT

consensusID : consensus_6452#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 717
fasta sequence

                              [ATTCATACCAGCCTTCAATTAAAAGACTATTGATTATGCTACCTTCGCACGGTCAAAATACCGCGGCCCCTTTAAAACTCAGTGGGCAGGCTAGACTTTTAAATAAAATACAAAAAGGACATGTTTTTGTTAAACAGGTGAATATATTTAATTTGCCGAATTCTTCATTAAAACCTATCAAATTAATTACTTTATATAAATTTATATACTAATTTTATCATAATTACTAAATTTTTATTATTAAAATTTAAATTTTAATAAATAATTTAATTTAAATTAAATAATTTTTTAT-AAAAAATAAATTATAACAAATTTATTAATAATAGCTATTTTTAAGCTTATATTTATTTAAAAATTATAAAAAATATAAAATTTTATTTTAAAGCTCATCCCTTAAAATATTACTTTATTTAATTATTAAATTAAAAAATTAACTTAATAAAATAAATAAGCTAAATTAAATTCATTTCTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAAATTAAATTCATTTCTTAAAAAACTAGATATATTTTAAAACGATTAACATTTCATTTCTAATTACATATTTAAAATAGTTATTCCACAATAACTTTTATATATAATTAAATCTTTAAAATTCGAGAAAAATTATTATAATAATTTATTATTTAATAAACCCTGATACACACCCACGCGTCCGCGG]

[-] EMBL BM596328             [ATTCATACCAGCCTTCAATTAAAAGACTATTGATTATGCTACCTTCGCACGGTCAAAATACCGCGGCCCCTTTAAAACTCAGTGGGCAGGCTAGACTTTTAAATAAAATACAAAAAGGACATGTTTTTGTTAAACAGGTGAATATATTTAATTTGCCGAATTCTTCATTAAAACCTATCAAATTAATTACTTTATATAAATTTATATACTAATTTTATCATAATTACTAAATTTTTATTATTAAAATTTAAATTTTAATAAATAATTTAATTTAAATTAAATAATTTTTTATAAAAAAATAAATTATAACAAATTTATTAATAATAGCTATTTTTAAGCTTATATTTATTTAAAAATTATAAAAAATATAAAATTTTATTTTAAAGCTCATCCCTTAAAATATTACTTTATTTAATTATTAAATTAAAAAATTAACTTAATAAAATAAATAAGCTAAATTAAATTCATTTCTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAAATTAAATTCATTTCTTAAAAAACTAGATATATTTTAAAACGATTAACATTTCATTTCTAATTACATATTTAAAATAGTTATTCCACAATAACTTTTATATATAATTAAATCTTTAAAATTCGAGAAAAATTATTATAATAATTTATTATTTAATAAACCCTGATACACACCCACGCGTCCGCGG]
[-] EMBL BM643497             [                                                                                                                                                                              CTATCAAATTAATTACTTTATATAAATTTATATACTAATTTTATCATAATTACTAAATTTTTATTATTAAAATTTAAATTTTAATAAATAATTTAATTTAAATTAAATAATTTTTTAT AAAAAATAAATTATAACAAATTTATTAATAATAGCTATTTTTAAGCTTATATTTATTTAAAAATTATAAAAAATATAAAATTTTATTTTAAAGCTCATCCCTTAAAATATTACTTTATTTAATTATTAAATTAAAAAATTAACTTAATAAAATAAATAAGCTAAATTAAATTCATTTCTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAAATTAAATTCATTTCTTAAAAAACTAGATATATTTTAAAACGATTAACATTTCATTTCTAATTACATATTTAAAATAGTTATTCCACAATAACTTTTATATATAATTAAATCTTTAAAATTCGAGAAAAATTATTATAATAATTTcgg                                     ]
[-] EMBL BM615937             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAATTTTTTAT AAAAAATAAATTATAGCAAATTTATTAATAATAGCTATTTTTAAGCTTATATTTATTTAAAAATTATAAAAAATATAGAATTTTATTTTAAAGCTCATCCCTTAAAATATTACTTTATTTAATTATTAAATTAAAAAATTAACTTAATAAAATAAATAAGCTAAATTAAATTCATTTCTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTT                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BM644721             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccgGCTTATTTATTTTATTAAGTTAAATTAAATTCATTTCTTAAAAAACTAGATATATTTTAAAACGATTAACATTTCATTTCTAATTACA                                                                                                                       ]




>consensus_6452#1
ATTCATACCAGCCTTCAATTAAAAGACTATTGATTATGCTACCTTCGCACGGTCAAAATA
CCGCGGCCCCTTTAAAACTCAGTGGGCAGGCTAGACTTTTAAATAAAATACAAAAAGGAC
ATGTTTTTGTTAAACAGGTGAATATATTTAATTTGCCGAATTCTTCATTAAAACCTATCA
AATTAATTACTTTATATAAATTTATATACTAATTTTATCATAATTACTAAATTTTTATTA
TTAAAATTTAAATTTTAATAAATAATTTAATTTAAATTAAATAATTTTTTATAAAAAATA
AATTATAACAAATTTATTAATAATAGCTATTTTTAAGCTTATATTTATTTAAAAATTATA
AAAAATATAAAATTTTATTTTAAAGCTCATCCCTTAAAATATTACTTTATTTAATTATTA
AATTAAAAAATTAACTTAATAAAATAAATAAGCTAAATTAAATTCATTTCTTAAAATATA
TCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAAATTAAAT
TCATTTCTTAAAAAACTAGATATATTTTAAAACGATTAACATTTCATTTCTAATTACATA
TTTAAAATAGTTATTCCACAATAACTTTTATATATAATTAAATCTTTAAAATTCGAGAAA
AATTATTATAATAATTTATTATTTAATAAACCCTGATACACACCCACGCGTCCGCGG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6452#0      TTACTTCCTTCTCCTTTTAAGGGAAAATAGAACATTTTCCAGTTCCTGTCCTGTTCAAAG 60
consensus_6452#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6452#0      CTTACACGCCGGTGTGCTTCTTCACCCAATCCCGGAAGGCGGTAACGCGTGCGAACGCAG 120
consensus_6452#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6452#0      CCGGATGGCCCTTGTCGCAGCCCTGCGCATGGCCGAAGCTCACCACACCGACCAGCGTCT 180
consensus_6452#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6452#0      TATCCTCCGCTAGCACCAGCGGACCACCGGAATCCCCATTGCAGGGCGAGCGCACTCCTC 240
consensus_6452#1      --------ATTCATACCAGCCTTCAATTAAAAG----ACTATTGATTATGCTACCTTCGC 48
                                *   ******   * *    **     * *   *     **   ** * *

consensus_6452#0      CCCAACCGCGCACAGCGTGCTCTTGCGCACCAGCAGCGGGCTGAACGTTTTCTGGCATTG 300
consensus_6452#1      ACGGTCAAAATACCGCGGCCCCTTTAAAACT--CAGTGGGCAGGCTAGACTTTTAAATAA 106
                       *   *     ** ***  * ***    **   *** **** *       * *   **  

consensus_6452#0      CTTGTTCGGGATCACCTTGAGCGTGGCGTACTGCAGCTCCTGCGCTACCTGGCCCCCGTT 360
consensus_6452#1      AATA--CAAAAAGGACATGTTTTTGTTAAACAGGTGAATATATTTAATTTG--CCGAATT 162
                        *   *   *    * **    **    ** *  *    *     *  **  **   **

consensus_6452#0      CACCATCAAGCCCCAGCCGCTGACGACGACCTCCCGGCCGGCAAAGTCCTCATCACCCGT 420
consensus_6452#1      CTTCATTAAAACCTATCAAATTA--ATTACTTTATATAAATTTATATACTAATTTTATCA 220
                      *  *** **  ** * *   * *  *  ** *           *  * ** **       

consensus_6452#0      CGGCAGCCGGACGGGCTGGACGCGCTCGCTGAACTCCA--CCTTGCTGGGCAGCTTCACC 478
consensus_6452#1      TAATTACTAAAT--------TTTTATTATTAAAATTTAAATTTTAATAAATAATTTAATT 272
                            *   *              *   * ** *  *    **  *    *  ** *  

consensus_6452#0      AGCGCGACATCGTTAGCCACGAACAGTGGGTTGTACTTTTCGTGCTTGAAGAACTCGGTC 538
consensus_6452#1      TAAATTAAATAATTTTTTATAAAAAATAAATTATAACAAATTTATT---AATAATAGCTA 329
                            * **  **    *  ** * *   ** **       *  *   *  * * * * 

consensus_6452#0      GACTCCAGCAC-CAGCCGGCCGTCGTTCGTGTTGTCGCTGAAATCGACCGCCCCGAGGTG 597
consensus_6452#1      TTTTTAAGCTTATATTTATTTAAAAATTATAAAAAATATAAAATT--TTATTTTAAAGCT 387
                         *  ***    *            *  *        * ****           * *  

consensus_6452#0      CACCTCGATCGACTTCGCCAGCATCACGCAGTGGCCCGCCGTCAGGACCCACTCCTCGTT 657
consensus_6452#1      CATCCCTTAAAATATTACT----TTATTTAATTATTAAATTAAAAAATTAACTTAATAAA 443
                      ** * *     *  *  *     * *   * *           *  *   ***       

consensus_6452#0      CAGCAGCGAGCCACCGCACAGCGCCTGCTGGCCGTTGCCCACGTGCAGCGTGAGCCGAAC 717
consensus_6452#1      -ATAAATAAGCTAAATTAAATTCATTTCTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAAT 502
                       *  *   *** *    * *     * **     *    *  **       **   *** 

consensus_6452#0      TTGGTACGGAA-ACTGGCCCAGCTTAGCCGTTTCGCCGTTCACCACCCGCATACCGCCGT 776
consensus_6452#1      TTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAAATTAA-ATTCATTTCTTAAAAAACTAGAT 561
                      **  *   *   * *        * **     *     ****   *    * * *    *

consensus_6452#0      GGGGGGCGGCCTGGGCGACCGAAGCCACCAACGCGAGCAGAGCAAGGGCGCAAGTTGCCG 836
consensus_6452#1      ATATTTTAAAACGATTAAC--ATTTCATTTCTAATTACATATTTAAAATAGTTATTCCAC 619
                                  *    **  *   **          ** *   *         ** *  

consensus_6452#0      GTTGCATTTTGTGCACTTCAAAACACTCTTTAACACACTGCTTGGGGGGATCCTCTGCGA 896
consensus_6452#1      AATAACTTTTATATATAATTAAA---TCTTTAAAAT-----TCGAGAAAAATTATTATAA 671
                        *   **** *  *     ***   ******* *      * * *   *     *   *

consensus_6452#0      TGGAGGACGGACGAACGAACTGTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCTTTTTTTTTCTTTTT 954
consensus_6452#1      TAATTTATTATTTAATAAACCCTGATACACACCCACGCGTCCGCGG------------ 717
                      *     *      **  ***  *     *  ** **   **