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Anopheles gambiae
cluster # 7177 cluster # 7177       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7177#0 length = 1312 sequences # 6  

consensusID : consensus_7177#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1312
fasta sequence
                              [TCAATGCCCACCGTTTGAAGCATCTTTTTCTGCTTGGCTTGAGTTTCTTCCTGTTGCTGCTCTGCCGCTGCCAGCTCTTCCTTGAAGTCTTCCAGTATGCGATTGATGCTTTCCATTGCATCATCATCGCCCCGCTTCTCCGACACTTCGTTGGTTGTTTCGGCGTTATTTTCATCCTCACGGAACGAATCAAGCAGCGCTTTATTCTTGGCATCCACCTTGGCCACCAGCTTTTTTCCTCCCACCTCTAAGTCGTGTACCAAGCGCACGGCACGTAACCCCCCGGCAGGATCATATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAGTTTACCACTGTGCCGCAAGCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGTACGTAACCCCAGCCCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTTCTTATTTTGCTCTTCAAATTCCACAAATGATGCTAACTTTTACAGTTCACTTACAGTGAATCCCAAATTGGGAGGACTGGGACGACCTTCATTGCACGAGTCTAGCTAAACGCGAGCCGGTTTTAGCAGGAATTGAAGAATTATTTCTTTAAGATTTGCTGGCCCGTGCGTGCAAAAAAAGCGG]

[+] EMBL CNS08I7G             [TCAATGCCCACCGTTTGAAGCATCTTTTTCTGCTTGGCTTGAGTTTCTTCCTGTTGCTGCTCTGCCGCTGCCAGCTCTTCCTTGAAGTCTTCCAGTATGCGATTGATGCTTTCCATTGCATCATCATCGCCCCGCTTCTCCGACACTTCGTTGGTTGTTTCGGCGTTATTTTCATCCTCACGGAACGAATCAAGCAGCGCTTTATTCTTGGCATCCACCTTGGCCACCAGCTTTTTTCCTCCCACCTCTAAGTCGTGTACCAAGCGCACGGCACGTAACCCCCCGGCAGGATCATATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAATTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CNS08ECO             [                          TTTCTGCTTGGCTTGAGTTTCTTCCTGTTGCTGCTCTGCCGCTGCCAGCTCTTCCTTGAAGTCTTCCAGTATGCGATTGATGCTTTCCATTGCATCATCATCGCCCCGCTTCTCCGACACTTCGTTGGTTGTTTCGGCGTTATTTTCATCCTCACGGAACGAATCAAGCAGCGCTTTATTCTTGGCATCCACCTTGGCCACCAGCTTTTTTCCTCCCACCTCTAAGTCGTGTACCAAGCGCACGGCACGTGAACCCCCGGCAGGATCATATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAGTTTACCACTGTGCCGCAAGCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGATCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCCGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CNS08ECN             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAGTTTACCACTGT CCGCAAGCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCCGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGTACGTAACCCCAGCCCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTT                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CNS08I7F             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGTTTTTTGATGATACAGTTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGTACGTAACCCCAG CCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTT                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL BM580160             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCGATGTACGGTATCCCAGGGGAAACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGAAGTTGTTCAGCTAGTATCCTAAGTGAAAACACGACTGTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTCACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BM575271             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTTTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGACTCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGCACGTAACCCCAGCCCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTTCTTATTTTGCTCTTCAAATTCCACAAATGATGCTAACTTTTACAGTTCACTTACAGTGAATCCCAAATTGGGAGGACTGGGACGACCTTCATTGCACGAGTCTAGCTAAACGCGAGCCGGTTTTAGCAGGAATTGAAGAATTATTTCTTTAAGATTTGCTGGCCCGTGCGTGCAAAAAAAGCGG]


>consensus_7177#0 TCAATGCCCACCGTTTGAAGCATCTTTTTCTGCTTGGCTTGAGTTTCTTCCTGTTGCTGC TCTGCCGCTGCCAGCTCTTCCTTGAAGTCTTCCAGTATGCGATTGATGCTTTCCATTGCA TCATCATCGCCCCGCTTCTCCGACACTTCGTTGGTTGTTTCGGCGTTATTTTCATCCTCA CGGAACGAATCAAGCAGCGCTTTATTCTTGGCATCCACCTTGGCCACCAGCTTTTTTCCT CCCACCTCTAAGTCGTGTACCAAGCGCACGGCACGTAACCCCCCGGCAGGATCATATTCG CAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAGTTTACCACTGTGCCGCAAGCGGCTAGTATT TGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATC GGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGA GACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTC ATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCTATGTACGGTATCCCAGGGGAC ACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCC GTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTG AAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAA AGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTT AGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGAT ACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAG TTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTT GCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGTACGTAACCCCAGCCCTG CGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTTCTTATTTTGCTC TTCAAATTCCACAAATGATGCTAACTTTTACAGTTCACTTACAGTGAATCCCAAATTGGG AGGACTGGGACGACCTTCATTGCACGAGTCTAGCTAAACGCGAGCCGGTTTTAGCAGGAA TTGAAGAATTATTTCTTTAAGATTTGCTGGCCCGTGCGTGCAAAAAAAGCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)