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Anopheles gambiae
cluster # 7382 cluster # 7382       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7382#0 length = 1164 sequences # 7  

consensusID : consensus_7382#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1164
fasta sequence
                              [AATTTATAATATCTTTCTTTATTGAACTCGCGCAATTAGTATCCAGTTTCTGCTTCTGCTTTGTGTGTGAGTTTGTGTGTAGTGTTATATCTCACTTGCTTGATGTACTCTGCTG-CCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCCTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCG-TTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACCGGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGACAAGGGGG-TGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTACGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTGAATAACAGTGAAAGAAT-GGTAACAGTGTTAGCTTA-GATACGCCCGCCCGTCGGTGGGGTTTAGACATCCTTCTCGGCCGAATGTGCGCCACGCGCATTATGCTCTGCTGCAGAAAAGAGGGAACAATATGTTCTTGCTACTTTCACTACTCATGCAAT]

[+] EMBL CNS08PP0             [AATTTATAATATCTTTCTTTATTGAACTCGCGCAATTAGTATCCAGTTTCTGCTTCTGCTTTGTGTGTGAGTTTGTGTGTAGTGTTATATCTCACTTGCTTGATGTACTCTGCTG CCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCCTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTTTTTTGCATAAACAGAAACCGAA GTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCG TTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTTTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACCGGTAATACTGTTCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTTCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTTAC                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CNS08CLD             [                   TATTGAACTCGCGCAATTAGTATCCAGTTTCTGCTTCTGCTTTGTGTTTTAGTATTTTTATAGTGTTATATCTCACTTGCTTGATGTACTCTGCTG CCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTTGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTTTTGTAATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTTTTTTTTGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BM631033             [                                                                                               TTCCTTGATGTACTCTGCTGCCCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTC  TTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATG TTTTTCCTTTTTCTTCACGTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTATGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCGTTTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CNS08POZ             [                                                                                                                      gtaAACGCTGGCCAGGCTG TCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCCTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTATGTTTTCATGTTTCTGCTCG TTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACCGGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGACAAGGGGG TGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTACGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTGAATAACAGTGAAAGAAT GGTAACAaaa                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BX617239             [                                                                                                                                                   CCTTCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGA   GTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCTTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTGTCATGTTTCTGTTCG   TGTTTTGTTTCTTCATATTCGCTTGTAGTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BX615490             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTGTCATGTTTCTGTTCG   TGTTTTGTTTCTTCATATTCGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCTATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACAAGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGACAAGGGGG TGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTATGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTGAATAACAGTGAAAGAATGGGTAACAGTGTTAGCTTA GATACGCCCGCCCGTCGGTGGGGTTT                                                                                                 ]
[-] EMBL BX623484             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTATGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCGTTTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACAAGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACGTTTAGCGACCGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGATAGGGGGGTTGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTACGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTATAGAACAGTGAAAGAATGGGTAACAGTGTTAGCTTAGGATAC CCCGCCCGTCGGTGGGGTTTAGACATCCTTCTCGGCCGAATGTGCGCCACGCGCATTATGCTCTGCTGCAGAAAAGAGGGAACAATATGTTCTTGCTACTTTCACTACTCATGCAAT]


>consensus_7382#0 AATTTATAATATCTTTCTTTATTGAACTCGCGCAATTAGTATCCAGTTTCTGCTTCTGCT TTGTGTGTGAGTTTGTGTGTAGTGTTATATCTCACTTGCTTGATGTACTCTGCTGCCTGT AACGCTGGCCAGGCTGCTCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGAT ATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGT AACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTG TTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTG TTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTG CTTATATGTTTTTTCCTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTT CCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGT TATGTTTTGTGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCGTTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTG TAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAAT GGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCT AGCTTTGGCTATGTACACCGGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGAT TTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACTT TTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCC CACTAGTGGCAAACAGTGACAAGGGGGTGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTC GAACTACGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTGAATAACAGTGAAAG AATGGTAACAGTGTTAGCTTAGATACGCCCGCCCGTCGGTGGGGTTTAGACATCCTTCTC GGCCGAATGTGCGCCACGCGCATTATGCTCTGCTGCAGAAAAGAGGGAACAATATGTTCT TGCTACTTTCACTACTCATGCAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)