cluster # 7477

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 7477 cluster # 7477 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7477#0 length = 1254 sequences # 7
consensusID : consensus_7477#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1254
fasta sequence
                              [AGAATTCCGCNNCGANGAAGCATCGATCGAATAAAGATACGTTTTGATTTGGGAATGAGAATACGTGTAGGGAAAAGTATGCTTGTTTAAAGATCAATTCCTCCATTTGTTACAGTACAATTCAGTACACAAGTGTTGTTATGCATGAAGATTGATAGAATGTTGCTGTATGTGGTGTAGTTGAATCACTCGAGTTTGCCATAGAAATAGAATGCGAATGAAATGTTATGAGATTATNTAGACAAGGTTAGGTTTGCTAGAAGCAGAT-GCTTCTCGTTTGTGGTGCTGTTACCTTAACGTTTT-CCTTTAAATTGCGCATTTCGTTCAAATGCATCTGTGTATTGA-TAGATACATCACCACCACCATC-ACCT-GTTGAACCTATTGTTGAGAATGTGGGTTTGAGTTTTCCT-GCAATGCGTCTACAGGTTTGTTGTACAGCCTACGATTATGAGCGCTCTCTTACTAGCATGTCTTACTAGCAGAAAGGTAGACAAATCATATGTTTAGT-----CGAAGGACTTTTTCGAGACATAGCATAAGTTTTATGAG-TTAGTTAGCAAACTTATTGA-TACAATCATTACATACACGTTCGGTTGGCATGGA-AACATCACTAATGACCATGCAGTAGCCCCACTATA-CGCTCTTCATGGTTTATGTTGCCAG-TTGGATAGAATTGCTCATAACAATTATATATGTATACATGTACATTATGCCCAAGTTCTTCGTTTTGATAGGATTTTTTTAAAAATAATACCCACATCAGTTAGGGGCGTTTGGCCGCAAAAATTATTGTTTAATTCTGTAAGAATAATCACCGGTAAAAAGTATGTAATCAACGCGTACCGTTGCTCAATAGTACAGAACTACAACAGAAAGTATGATGTTTAGTTTACAGAAATTCTTTGCCTAGTTTTTCTTTTTCCATTACATACACACATAAGGTTTATCTTATGCGCTGGTTAGAAAAAAAATCGCGTTCTAAAATCATGTATTACTACTACTTTGCGCTTGGCACAAGAAACGCATTACGCATTGCCTGTTGCTGATGGGAAACTTGATTCCTCGTTGATGCCAATATTTTACTTTACTGTTGTAT-GGATCGTAAGTTCGTATACACGTATACGTGATATATATATTTGTCGGGTTAGAGTATTATTTGTACAGATACACAATTGTATGTTATGTTTAGCGATCCTATTTTAAGTTTACAACCTCAAAGTCATTAGTTATGATAAAATGAAAATGTTTAAACCATCC]

[+] EMBL BX466233             [AGAATTCCGCNNCGANGAAGCATCGATCGAATAAAGATACGTTTTGATTTGGGAATGAGAATACGTGTAGGGAAAAGTATGCTTGTTTAAAGATCAATTCCTCCATTTGTTACAGTACAATTCAGTACACAAGTGTTGTTATGCATGAAGATTGATAGAATGTTGCTGTATGTGGTGTAGTTGAATCACTCGAGTTTGCCATAGAAATAGAATGCGAATGAAATGTTATGAGATTATNTAGACAAGGTTAGGTTTGCTAGAAGCAGATAGCTTCTCGTTTGTGGTGCTGTTACCTTAACGTTTTGCCTTTAAATTGCGCATTTCGTTCAAATGCATCTGTGTATTGACTAGATACATCACCACCACCATCGACCT GTTGAACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX605330             [                                                                                GCTTGTTTAAAGATCAATTCCTCCATTTGTTACAGTACAATTCAGTACACAAGTGTTGTTATGCATGAAGATTGATAGAATGTTGCTGTATGTGGTGTAGTTGAATCACTCGAGTTTGCCATAGAAATAGAATGCGAATGAAATGTTATGAGATTATTTAGACAAGGTTAGGTTTGCTAGAAGCAGAT GCTTCTCGTTTGTGGTGCTGTTACCTTAACGTTTT CCTTTAAATTGCGCATTTCGTTCAAATGCATCTGTGTGTTGA TAGATACATCACCACCACCATC ACCT GTTGAACCTATTGTTGAGAATGTGGGTTTGAGTTTTCCT GCAATGCGTCTACAGGTTTGTTGTACAGCCTACGATTATGAGCGCTCTCTTACTAGCATGTCTTACTAACAAAAAGGTAGACAAATCATATGTTTAGTATCTGCGAAGGACTTTTTCGAGACATAGCATAAGTTTTATGAG TTAGTTAGCAAACTTATTGA TACAATCATTACATACACGTTCGGTTGGCATGGA AACATCACTAATGACCATGCAGTAGCCCCACTATA CGCTC TCATGGTTTATGTTGCCAG TTGGATAGAATTGCTCATAACAATTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AL930833             [                                                                                                                                                                                                                                                       cgAGG TTG TAGAAGCAGAT GCTTCTCGCTTGTGGTGCTGTTA CTT ACGTTTT CCTTTAAATTGCGCATTTCGTTCAAATGCATCTGTGTATTGA TAGATACATCACCACCACCATC ACCTGGTTGAACCTATTGTTGAGAATGTGGGTTTGAGTTTTCCTGGCAATGCGTCTACAGGTTTGTTGTACAGCCTACGATTATGAGCGCTCTCTTACTAGCATGTCTTACTAGCAGAAAGGTAGACAAATCATATTTTTAGT     CGAAGGACTTTTTCGAGACATAGCATAAGTTTCATGAGCTTAGTTAGCAAACTTATTGAGTACAATCATTACATACACGTTCGGTTGGCATGGACAACATCACTAATGACCATGCAGTAGCCCCACTATACCGCTCTTCATGGTTTATGTTGCCAGCTTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX618289             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGTGCTGTTACCTTAACGTTTT CCTTTAAATTGCGCATTTCGTTCAAATGCATCTGTGTATTGA TAGATACATCACCACCACCATC ACCT GTTGAACCTATTGTTGTGAATGTGGGTTTGAGTTTTCCT GCAATGCGTCTACAGGTTTGTTGTACAGCCTACGATTATGAGCGCTCTCTTACTAGCATGTCTTACTAGCAGAAAGGTAGACAAATCATATGTTTAGT     CGAAGGACTTTTTCGAGACATAGCATAAGTTTTATGAG TTAGTTAGCAAACTTATTGA TACAATCATTACATACACGTTCGGTTGGCATGGA AACATCACTAATGACCATGCAGTAGCCCCACTATA CGCTCTTCATGGTTTATGTTGCCAG TTGGATAGAATTGCTCATAACAATTACATATGTATACATGTACATTATGCCCAAGTTCTTCGTTTTGATAGGATTTTTTTAAAAATAATACCCACATCAGTTAGGGGCGTTTGGCCGCAAAAATTATTGTTTAATTCTGTAAGAATAATCACCGGTAAAAAGTATGTAATCAACGCGTACCGTTGCTCAATAGTACAGAACTACAACAAAAAGTATGATGTTTAGTTTACAGAAATTCTTTGCCTAGTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BX611030             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTTTATGAG TTAGTTAGCAAACTTATTGA TACAATCATTACATACACGTTCGGTTGGCATGGA AACATCACTAATGACCATGCAGTAGCCCCACTATA CGCTCTTCATGGTTTATGTTGCCAG TTGGATAGAATTGCTCATAACAATTATATATGTATACATGTACATTATGCCCAAGTTCTTCGTTTTGATAGGATTTTTTTAAAAATAATACCCACATCAGTTAGGGGCGTTTGGCCGCAAACATTATTGTTTAATTCTGTAAGAATAATCACCGGTAAAAAGTATGTAATCAACGCGTACCGTTGCTCAATAGTACAGAACTACAACAGAAAGTATGATGTTTAGTTTACAGAAATTCTTTGCCTAGTTTTTCTTTTTCCATTACATACACACATAAGGTTTATCTTATGCGCTGGTTAGAAAAAAAATCGCGTTCTAAAATCATGTATTACTACTACTTTGCGCTTGGCACAAGAAACGCATTACGCATTGCCTGTTGCTGATGGGAAACTTGATTCCTCGTTGATGCCAATATTTTACTTTACTGTTGTAT GGATCGTAAGTTCGTATACACGTATACGTGATATATATATTTGTCGGGTTAGAGTATTATTTGTACAGA                                                                                            ]
[+] EMBL BM580982             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccgAGCAAACTTATTGA TACAATCATTACATACACGTTCGGTTGGCATGGA AACATCACTAATGACCATGCAGTAGCCCCACTATA CGCTCTTCATGGTTTATGTTGCCAG TTGGATAGAATTGCTCATAACAATTATATATGTATACATGTACATTATGCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BM611213             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccgATGTAATCAACGCGTACCGTTGCTCAATAGTACAGAACTACAACAGAAAGTATGATGTTTAGTTTACAGAAATTCTTTGCCTAGTTTTTCTTTTTCCATTACATACACACATAAGGTTTATCTTATGCGCTGGTTAG AAAAAAATCGAGTTCTAAAATCATGTATTACTACTACTTTGCGCTTGGCACAAGAAACGCATTACGCATTGCCTGTTGCTGATGGGAAACTTGATTCCTCGTTGATGCCAATATTTTACTTTACTGTTGTATGGGATTGGAAGTTCGTATATACGTATACGTGATATATATATTTGTCGGGTTAGAGTATTATTTGTACAGATACACAATTGTATGTTATGTTTAGCGATCCTATTTTAAGTTTACAACCTCAAAGTCATTAGTTATGATAAAATGAAAATGTTTAAACCATCC]




>consensus_7477#0
AGAATTCCGCNNCGANGAAGCATCGATCGAATAAAGATACGTTTTGATTTGGGAATGAGA
ATACGTGTAGGGAAAAGTATGCTTGTTTAAAGATCAATTCCTCCATTTGTTACAGTACAA
TTCAGTACACAAGTGTTGTTATGCATGAAGATTGATAGAATGTTGCTGTATGTGGTGTAG
TTGAATCACTCGAGTTTGCCATAGAAATAGAATGCGAATGAAATGTTATGAGATTATNTA
GACAAGGTTAGGTTTGCTAGAAGCAGATGCTTCTCGTTTGTGGTGCTGTTACCTTAACGT
TTTCCTTTAAATTGCGCATTTCGTTCAAATGCATCTGTGTATTGATAGATACATCACCAC
CACCATCACCTGTTGAACCTATTGTTGAGAATGTGGGTTTGAGTTTTCCTGCAATGCGTC
TACAGGTTTGTTGTACAGCCTACGATTATGAGCGCTCTCTTACTAGCATGTCTTACTAGC
AGAAAGGTAGACAAATCATATGTTTAGTCGAAGGACTTTTTCGAGACATAGCATAAGTTT
TATGAGTTAGTTAGCAAACTTATTGATACAATCATTACATACACGTTCGGTTGGCATGGA
AACATCACTAATGACCATGCAGTAGCCCCACTATACGCTCTTCATGGTTTATGTTGCCAG
TTGGATAGAATTGCTCATAACAATTATATATGTATACATGTACATTATGCCCAAGTTCTT
CGTTTTGATAGGATTTTTTTAAAAATAATACCCACATCAGTTAGGGGCGTTTGGCCGCAA
AAATTATTGTTTAATTCTGTAAGAATAATCACCGGTAAAAAGTATGTAATCAACGCGTAC
CGTTGCTCAATAGTACAGAACTACAACAGAAAGTATGATGTTTAGTTTACAGAAATTCTT
TGCCTAGTTTTTCTTTTTCCATTACATACACACATAAGGTTTATCTTATGCGCTGGTTAG
AAAAAAAATCGCGTTCTAAAATCATGTATTACTACTACTTTGCGCTTGGCACAAGAAACG
CATTACGCATTGCCTGTTGCTGATGGGAAACTTGATTCCTCGTTGATGCCAATATTTTAC
TTTACTGTTGTATGGATCGTAAGTTCGTATACACGTATACGTGATATATATATTTGTCGG
GTTAGAGTATTATTTGTACAGATACACAATTGTATGTTATGTTTAGCGATCCTATTTTAA
GTTTACAACCTCAAAGTCATTAGTTATGATAAAATGAAAATGTTTAAACCATCC
clustalw multiple alignements is not computed in this case