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Anopheles gambiae
cluster # 7696 cluster # 7696       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7696#0 length = 1062 sequences # 8  

consensusID : consensus_7696#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1062
fasta sequence
                              [AGCAAATTATCGATTTTTTTCTGTGAACTTTTAGACGACCTTTCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT-GGCAATGTTAAA-GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT-CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT-CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTTGTATATTGACAAAAGGCAAACGATGTAATGAATCACAATTGATTTGCGCCATTTTC]

[+] EMBL CNS09IYJ             [AGCAAATTATCGATTTTTTTCTGTGAACTTTTAGACGACCTTTCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCTGGGCAATGTTAAAGGGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGCTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACC                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS09G5C             [                   TCTGTGAA TTTTAGACGA CTTTCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTC GCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCTGTAGT CCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CNS09D2D             [                                          TCTTAAACTGCCATCTTCATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGTCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTT                                                                         ]
[-] EMBL CNS09D2C             [                                                                                                  AAAATCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTG TCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTTGTATATTGACAAAAGGCAAACGATGTAATGAATCA                     ]
[-] EMBL CNS09IYI             [                                                                                                      TCGTCATAGGTAAAATCGTCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCTATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGCTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGT CTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTT                                                        ]
[-] EMBL BX628661             [                                                                                                                                                                                                               TTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGGATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAGCT GGCAATGTTAAA GGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACACGACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATGTTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTAGGGATTGTTCTTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGGCATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACTGGGCCCAAATCCCCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCAT CCCAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAA                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL BX605422             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATGATGATTCGACGTTCGTAGGGATTGTTCTTTATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTATTCGTCGTGGCATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CNS09G5B             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCATCCCCAAATGCGTAATCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAAAGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATCCCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTGCGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGTTCCTCTTCATTGCCATTGTCCTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACCGGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTTGTATATTGACAAAAGGCAAACGATGTAATGAATCACAATTGATTTGCGCCATTTTC]


>consensus_7696#0 AGCAAATTATCGATTTTTTTCTGTGAACTTTTAGACGACCTTTCTTAAACTGCCATCTTC ATTTTTATCGCAGACTGGGGGCTGTAATTCATGATTTCAAAATCGTCATAGGTAAAATCG TCAATAGATTCTACCTTTCGTTTAAAAACGAGTGTTGGGAATTTTGTGGGCGTCCTTTCT ATTTGCTCACGCAAGCCATCGACGTGATTCAAATAAATGTGAGTGTCGCCGGTGGTATGG ATAAACTCTCCTGCCTTTAGTCCGGTGACATGCGCGATCATGTGGGTCAGCAAGGAGTAG CTGGCAATGTTAAAGGGCACGCCCAGACCTACGTCGGCCGAACGTTGATACATCTGACAC GACAGCTCTCCATCACTAACGAAAAACTGTGCCAAGCAGTGGCATGGCGGTAGTGCCATG TTAGGAATATCAGAAGGATTCCAAGCGCACATGATGATTCGACGATCGTATGGATTGTTC TTAATTTTGTCGATCACTTCAGCCAGCTGATCTATTCCCTGACCTGTGTAATCGTCGTGG CATGTTTTGTAGGTGGCACCAAAGTGGCGCCACTGAAACCCATATACCGGGCCCAAATCC CCTTCCTCACGATCGGTGAAGCCGCACGAATCCAGATACTCTCGAGTGCTGTTACCATCC CAAATGCGTACTCCCTTTGCTTGCAAATCCTTGACATTCGTCGAGCCCTTGATAAACCAA AGTAGTTCTTCGGCCACTCCTCTAAAGAATACCTTTTTTGTTGTTAACAACGGTATGATC CCGTCGCGTAGACTAAATCGCATCTGGGCTCCAAATATCGACAAGGTACCAACACCCGTG CGGTCGAGGCGTTTGCTGCCTTTATTGATAATGTCACGAATTAACTGCAAATATGCTTGT TCCTCTTCATTGCCATTGTCTTTATTGACGACATTTCCGTTTTCGCCTTCCATTATTACC GGGAAAAACACTGGAATTTAATTATATTTGCGCTGTATCTGGTTTTGTATATTGACAAAA GGCAAACGATGTAATGAATCACAATTGATTTGCGCCATTTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)