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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7814#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1943 fasta sequence
[CGAGCAGATCGCGCNGAGGTTACGATAATAGCGGTTGAGTCGGAACTAGTATCCCCGCGAACGGTCATGCAGTGAACATGCAATAAAGCGATACAAGAAAGGCAAGCTGATTGGCATGTAAAGGGCATACACACGCACTATTAAATGTACAAAAAATCTAATCCAAGCTAAGTAGTATCATCGATCATTGGCAAGCGACTTACGAGGTTGTTCCGTAA--AGA-TAAATG-CAGAAACTTGAGGAAA-AAGTAACAAAA-TTTTAA-CATTTACAGAACAAGCAAAAATCAAGAAACCCGAGAATTCTAGAGTGGAACGAACTAGCACCACTCGCGACGCTTGAACTAAACTTACTATGTAAATATAGTTCACAAT-GGCATTCGATTCCACTTGAAGATGTTCGTACAAATTACACATAGTAAGT-AGCT-AGTTTCTGTTTAATCCCA-GTCAACGCGCATGATAACACGGGCAGTCCAGAAGCGTACGAGAAGCAGTAGTTACTTACT-GCTGCTCCTTGTACTTTCAAACAATGTCCATTAAAACGTGATCCGTCGTCAGCAAGCGAAACTATGGAGCAACTTTGAATGATAAATGGTTGATAATGGTGTGTTTCATTTAAGGTGATTAATAATTTATTGAAAGCTTTACTCTTGCTCTTCTTTTAATTTGTCGCACTAGTGCAATTTATGAACAAGATAATTGAAACGTTAACGTTCGTGTACTACAGCATGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACCGCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGTTTATAATTGTTAACAGAAATGTGCATTGCCATTATTAGTAACAGCTCGTAACAGCTAATGTTGCGTCCTAGCACGGCAGATGTTTAAAAATATCTCAACCTTATGAATGTCGAAAATCAGTACAGAGAAGGAAAAACAAAAAGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAAACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTAGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCCACTGCAATTCTATGATTCACTAGCCATACAATTGATATCTTCACTCAATACTTCACTTTTGGTTATTTGTTTTTTTTTTTGCACTAAACTGCTCACCTAATTCAGTGGTGCAGATGTGTGTGTGTGTGGTACATGTACAAACGTAACAGCACACAACAACAGCGTCCATCGACAATTTGCAACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACAAACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGATTTATTATACAACAAAGTAGATGCGTAATGGTGTTTCCCTCCTAGTAGTTAGAGTACGTACGAGATTTTGCAATTTACAAATACTACAAAAATCTTCCAAATGAAGAAAAAATATTTTTTTCTGCCACTATACCTATTAATAAATAAGATACAATAAAAAAATCTTCCCAACAAACGAAGTTAGTGGTAGGGTGGTATGCTAGACAGAGAAATACCGCGCTTCTATCCCGTGCGCTAATAACTACGTTTGAGGGTAAGCGCAAAACACAACAAAGCGTGTTTTGCACTATCCAAACTGTGCTATTTGGCCGTTTGTTCTTCGTTGTTTTGTTTAAAGTTTTAAGTACCAGTAGAACTATCAACAATTGTGTACAGCGAAATATATGGAGATACAGGAATTCCGACTTATGTCCAAAAGTAGAGTGGATGTTAGGTTTTACGAATAAATTAA]
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[+] EMBL BX616213 [ GTTCGTGTACTACAGCGTGAGCACGTATTGTACTTTAGCGTTTGCTTTTACGATATTTTTATTTGTCTGCTACCGCTTAGGGGAGTGTGTGCTCACATGCTCTGCAATAGTTTATGTCGGTTTATAATTGTTAACAGAAATGTGCATTGCCATTATTAGTAACAGCTCGTAACAGCTAATGTTGCGTCCTAGCACGGCAGATGTTTAAAAATATCTCAACCTTATGAATGTCGAAAATCAGTACAGAGAAGGAAAAACAAAAAGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAAACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTGGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCCACTGCAATTCTATGATTCACTAGCCATACAATTGATATCTT ]
[+] EMBL BX611382 [ AGCACGGCAGATGTTTAAAAATATCTCAACCTTATGAATGTCGAAAATCAGTACAGAGAAGGAAAAACAAAAAGCTTAAATGATTGGCATAACGATAGTATGCTTTGTGATAAAATGGAAACAAACAGTTGAAACAAGTTTGTAGAGTAGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTGGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCCACTGCAATTCTATGATTCACTAGCCATACAATTGATATCTTCACTCAATACTTCACTTTTGGTTATTTGTTTTTTTTTTTGCACTAAACTGCTCACCTAATTCAGTGGTGCAGATGTGTGTGTGTGTGGTACATGTACAAACGTAACAGCACACAACAACAGCGTCCATCGACAATTTGCAACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACAAACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGAT ]
[+] EMBL BM588125 [ ccgGTAGTTTACTCCAAACAAGAACTTTCTTCAGCATTTGTTCCATTAATCCTCTCCTAATCAATCTTCCTAGCATTGCATTTTGTTGCAATCAATTGTTATCAGCAAAAGCACTGTCTTAGCGCATACTCAACTTGGTTTGCAAGGCTCCTCATAGAGATGTCAGCAGAGTTTGCACGACATCAACTGCAATTTTATGATTCACTGGCCATACAATTGATATCTTCACTCAATACTTCACTTTTGGTTATTTG GCTTTTTTGCACTAAACTGCTCACCTAATTCAGTGGTACAG GTGTGTGTGTGTGGTACATGTACAAACGTAACAGCACACAACAACAGCGTCCATCGACAATTTGCAACATTCGTGTGCAGATTACTCTTTGCTGCACAAACCACAATTCTGTGTACAGCAGAACAATGTTCAGAGGTTCAGATGAAAAGATTTATTATACAACAAAGTAGATGCGTAATGGTGTTTCCCTCCTAGTAGTTAGAGTACGTACGAGATTTTGCAATTTACAAATACTACAAAAATCTTCCAAATGAAGAAAAAATATTTTTTTCTGCCACTATACCTATTAATAAATAAGATACAATAAAAAAATCTTCCCAACAAACGAAGTTAGTGGTAGGGTGGTATGCT ]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||