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Anopheles gambiae
cluster # 7966 cluster # 7966       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7966#0 length = 976 sequences # 8  

consensusID : consensus_7966#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 976
fasta sequence
                              [ATGCTGCCTTTGTNTTTGGTANTTTTTGTTTTTAAATCACAGAAATTTTATTTCCAATTCAATCGTCACACTTCAATTAAATTCATACGTCAGGGTTTTATACAGTTCATGTCAAGCGCGTAACACTTGCGCGTTACTTGTGCCGTGGGTGTTGCTTGCAAACAGCCCTAGCCGGTGGTGGTGG---TGGTGGTTTGGTTGTGTTGCGTTTGCGCCAGCGGGAATACCTGCGTCACCTTGCCGATGCCTTTGCTAGTGCCCTCGCGCAACAGTATCCGCATGCCCGGCCGCACGTACTCCGGATGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCGGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCGATGTGTACGGTAGTTTGAAATCCTTTAAAGATGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAGAAGCACCCGCAGGCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATTACCATGCCGCTGCGCAGCACGGGCATCGGCTCGATCGCGTTGAACGACAGCGAA-GCGCTCTGACCCGCCCGCACCACCCGGCAAGGCGCCTTGTTCCGGTGGATCGTCTGCACGGTGACGGAAAA-GAACGAGCCGTCCTGCAGCGGGCCCACCTTCACCT-GGCTGTTCTCGGTGAGGACGCCCTTGCAGAGCAGCCCGCCGGCGACCGTGCCCACCTCGGCCACTCGGAAGATTTCATCGATTTGAAACTCGATCGGCTGCTGCTCGAGCCGCTCCTTCTCCGCGTTACTGATGCCCGGCGACAGCACGTACAGGTACTGGATGAGCAGGTCCAGCCCGGCGCCTGTCACGTTCGACACGCAGAAGATCGGCACGATCTGCTCTACGCTCTGGTGCGCGTTCGCGTTCAGCACGTCGTCCTGGTTGCTGATTAAGTACGGTACCTTCCGGT]

[+] EMBL BX466727             [ATGCTGCCTTTGTNTTTGGTANTTTTTGTTTTTAAATCACAGAAATTTTATTTCCAATTCAATCGTCACACTTCAATTAAATTCATACGTCAGGGTTTTATACAGTTCATGTCAAGCGCGTAACACTTGCGCGTTACTTGTGCCGTGGGTGTTGCTTGCAAACAGCCCTAGCCGGTGGTGGTGG   TGGTGGTTTGGTTGTGTTGCGTTTGCGCCAGCGGGAATACCTGCGTCACCTTGCCGATGCCTTTGCTAGTGCCCTCGCGCAACAGTATCCGCATGCCCGGCCGCACGTACTCCGGATGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCGGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCGATGTGTACGGTAGTTTGAAATCCTTTAAAGATGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAGAAGCACCCGCAGGCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATTACCATGCCGCTGCGCAGCACGGGCATCGGCTCGATCGCGTTGAACGACAGCGAA GCGCTCTGACCCG CCGGACCACCCGGCAAGGCGCCTTGTTCCGGTGGATCGTCTGCACGGTGACGGAAAAGGAACGAGCCGTCCTGCAGCGGGCCCACTTNCACCTGGGCTGTTCTCGGTGAGGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BX613493             [                                           AATTTTATTTCCAATTCAATCGTCACACTTCAATTAAATTCATACGTCAGGGTTTTATACAGTTCATGTCAAGCGCGTAACACTTGCGCGTTACTTGTGCCGCGGGCGTTGCTTGCAAACAGCCCTAGCCGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGTGGTTGTGTTGCGTTTGCGCCAGCGGGAATACCTGCGTCACCTTGCCGATGCCTTTGCTGGTGCCCTCGCGCAGCAGTATCCGCATGCCCGGCCGCACGTACTCCGGATGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCGGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCGATGTGTACGGTAGTCTGAAATCCTTTAAAGATGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAGAAGCACCCGCAGGCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATGACCATGCCGCTGCGCAGCACGGGCATCGGCTCGACCGCGTTGAACGATAGCGAA GCGCTCTGACCCGCCCGCACCACCCGGCAAGGCGCCTTGTTCCGGTGGATCGTCTGCACGGTGACGGAAAA GAACGAGCCGTCCTGCAGCGGGCCCACCTTCACCT GGCTGTTCTCGGTGAGGACGCCCTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CNS08D4X             [                                                                                            GGGTTTTATACAGTTCATGTCAAGCGCGTAACACTTGCGCGTTACTTGTGCCGTGGGTGTTGCTTGCAAACAGCCCTAGCCGGTGGTGGTGG   TGGTGGTTTGGTTGTGTTGCGTTTGCGCCAGCGGGAATACCTGCGTCACCTTGCCGATGCCTTTGCTAGTGCCCTCGCGCAACAGTATCCGCATGCCCGGCCGCACGTACTCCGGATGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCTGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCGATGTGTACGGTAGTTTGAAATCCTTTAAAGATGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAGAAGCACCCGCA GCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATTACCATGCCGCTGCGCA CACGGGCATCGGCTCGATCGCGTTGAACGACAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CNS08OFW             [                                                                                                      CAGTTCATGTCAAGCGCGTAACACTTGCGCGTTACTTGTGCCGTGGGTGTTGCTTGCAAACAGCCCTAGCCGGTGGTGGTGG   TGGTGGTTTGGTTGTGTTGCGTTTGCGCCA CGGGAATACCTGCGTCACCTTGCCGATGCCTTTGCTAGTGCCCTCGCGCAACAGTATCCGCATGCCCGGCCGCACGTACTCCGGATGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCGGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCGATGTGTACGGTAGTTTGAAATCTTTTAAAGATGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAGAAGCACCCGCA GCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATTACCATGCCGCTGCGCA CACGGGCATCGGCTCGATCGCGTTGAACGACAGCGAACGCGTTCTGACCCGCCCGCACCACCCGGCAAGGCGCCTTGTTCCGGTGGATCGTCTGCACGGTGACGGAAAA GAACGAGCCGTCCTGCAGCGGGCCCACCTTCACCT GGCTGTTCTCGGTGAGGACGCCCTTTCAGAGCAGCCCGCCGGCGACCGT                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BX614197             [                                                                                                                                                                                                     GTTGTGTTGCGTTTGCGCCAGCGGGAATACTTGCGTCACCTTGCCGATGCCTTTGCTGGTGCCCTCGCGCAGCAGTATCCGCATGCCCGGCCGCACGTACTCCGGATGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCGGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGA GGCCGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX611725             [                                                                                                                                                                                                              ccTTTGCGCCAGCGGGAATACCTGCGTCACCTTGCCGATGCCTTTGCTGGTGCCCTCGCGCAGCAGTATCCGCATGCCCGGGCGCACGTACTCCGGATGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCGGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL BX611726             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCGGTGTCGCCGGCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCGATGTGTACGGTAGTCTGAAATCCTTTAAAGATGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAGAAGCACCCGCAGGCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATGACCATGCCGCTGCGCAGCACGGGCATCGGCTCGACCGCGTTGAACGATAGCGAA GCGCTCTGACCCGCCCGCACCACCCGGCAAGGCGCCTTGTTCCGGTGGATCGTCTGCACGGTGACGGAAAA GAACGAGCCGTCCTGCAGCGGGCCCACCTTCACCT GGCTGTTCTCGGTGAGGACGCCCTTGCAGAGCAGCCCGCCGGCGACCGTGCCCACCTCGGCCACTCGGAAGATTTCATCGATTTGAAACTCGATCGGCT                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BX611461             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAGAAGCACCCGCAGGCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATGACCATGCCGCTGCGCAGCACGGGCATCGGCTCGACCGCGTTGAACGATAGCGAA GCGCTCTGACCCGCCCGCACCACCCGGCAAGGCGCCTTGTTCCGGTGGATCGTCTGCACGGTGACGGAAAA GAACGAGCCGTCCTGCAGCGGGCCCACCTTCACCT GGCTGTTCTCGGTGAGGACGCCCTTGCAGAGCAGCCCGCCGGCGACCGTGCCCACCTCGGCCACTCGGAAGATTTCATCGATTTGAAACTCGATCGGCTGCTGCTCGAGCCGCTCCTTCTCCGCGTTACTGATGCCCGGCGACAGCACGTACAGGTACTGGATGAGCAGGTCCAGCCCGGCGCCTGTCACGTTCGACACGCAGAAGATCGGCACGATCTGCTCTACGCTCTGGTGCGCGTTCGCGTTCAGCACGTCGTCCTGGTTGCTGATTAAGTACGGTACCTTCCGGT]


>consensus_7966#0 ATGCTGCCTTTGTNTTTGGTANTTTTTGTTTTTAAATCACAGAAATTTTATTTCCAATTC AATCGTCACACTTCAATTAAATTCATACGTCAGGGTTTTATACAGTTCATGTCAAGCGCG TAACACTTGCGCGTTACTTGTGCCGTGGGTGTTGCTTGCAAACAGCCCTAGCCGGTGGTG GTGGTGGTGGTTTGGTTGTGTTGCGTTTGCGCCAGCGGGAATACCTGCGTCACCTTGCCG ATGCCTTTGCTAGTGCCCTCGCGCAACAGTATCCGCATGCCCGGCCGCACGTACTCCGGA TGCCGCACGAACCGGAACAGCACCGAGGCGGACTGATTTGTACCGATGCCGGTGTCGCCG GCCCCCATGATGCCCTCGATGATGGCCGTCTGCCGGATGCTACCGATGTGTACGGTAGTT TGAAATCCTTTAAAGATGCGCGTCGCATGGAACAGTACGGACACTTGTGCCTGAAAGAAG AAGCACCCGCAGGCTACCTCATCGCTTTCGTAGTCCGGCAGTATTACCATGCCGCTGCGC AGCACGGGCATCGGCTCGATCGCGTTGAACGACAGCGAAGCGCTCTGACCCGCCCGCACC ACCCGGCAAGGCGCCTTGTTCCGGTGGATCGTCTGCACGGTGACGGAAAAGAACGAGCCG TCCTGCAGCGGGCCCACCTTCACCTGGCTGTTCTCGGTGAGGACGCCCTTGCAGAGCAGC CCGCCGGCGACCGTGCCCACCTCGGCCACTCGGAAGATTTCATCGATTTGAAACTCGATC GGCTGCTGCTCGAGCCGCTCCTTCTCCGCGTTACTGATGCCCGGCGACAGCACGTACAGG TACTGGATGAGCAGGTCCAGCCCGGCGCCTGTCACGTTCGACACGCAGAAGATCGGCACG ATCTGCTCTACGCTCTGGTGCGCGTTCGCGTTCAGCACGTCGTCCTGGTTGCTGATTAAG TACGGTACCTTCCGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)