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Anopheles gambiae
cluster # 8036 cluster # 8036       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8036#0 length = 1323 sequences # 9  

consensusID : consensus_8036#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1323
fasta sequence
                              [CCGCGGACGC-TG-GG-TGACATCCACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG-AAAACAAAAG-ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC-GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATTGTTCAGTACGCCTAGTCTGTGCAATGTCATAGTAGGCCAGTTAGCATTCTGCGTCTTTCCGACTCGGTTATTCCATTTGTGATGTATATAACGTTTCCACTCTCATAACGATTAACGCCAAAGTACCCTTATGAAGCACTGCATCCAATAAAAAAACCAG]

[+] EMBL BM639234             [CCGCGGACGCGTG GGTTGACATCCACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGCCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AL934783             [      tCGC CGAGG TTA ATCCA CATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CNS08JVF             [                 TGACATCCACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAGCATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTCGGGTGTAAGCTGTTATAAAGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CNS09P0F             [                         ACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTTTTTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGC AACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX628942             [                                                        TAGTAAAGTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGGCAAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX623197             [                                                                                GCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGG AAAACAAAAG ATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGTACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACGTCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTTAGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CNS08JVG             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGGTACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGTGGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACACGGAAACGCCCCATGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCAGTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGCAATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCTTTTTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATTGTTCAGTACGCCTAGTCTGTGCAATGTCATAGTAGGCCAGTTAGCATTCTGCGTCTTTCCGACTCGGTTATTCCATTTGTGATGTATATAACGTTTCCACTCTCATAACGATTAACGCCAAAGTACCCTTATGAAGCACTGCATCCAATAAAAAAACCAG]
[+] EMBL BX627244             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCAATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCAATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCCTTATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATT                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CNS09P0G             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAAATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAAATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTTTCTGCTTTTGAAGATAGCATCATTACGTC GGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAAACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTATAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTGTTATCGGTAAAGATAAGTTGATTGTTCAGTACGCCTAGTCTGTGAAATGTCATAGTAGGCCAGTTAGCATTCTGCGTCTTTCCCACTCGGTTATTCCATTTGTGATGTATATAACGTTTCCACTCTCATAACGATTAA                                             ]


>consensus_8036#0 CCGCGGACGCTGGGTGACATCCACCATCCACCATCCACAGTTGTTCTATGATTTAGTAAA GTGTACTGCCAGTGTCCGCATCATTGCAGCGTTTAGGTAGCAATACACATGGAAAACAAA AGATTTTGGAATAGCCAGATTTGGACAGTGTTTACACTGTTTCTAGCCGAATTTTTCGGT ACTGCGATGTTGCTTTTTGGTGGTTGCATGGCTAGCATAGACGGCTTTGACAACGTCACG TCAAACATTAGTCGTGGAATTACCTTTGGAATGGTTGTTATGATGGCGTTTATAACATTT AGCGCCTCTTCAGGTGCAATTATTAATCCGGTTGTGTCACTAGCAGCTTACATCTTTGGT ACATTATCGTTACAGTTAACGATTTTATATATTGTGGCTCAATTCGCCGGGGCACTGTGT GGTTACGGACTATTAAGAGCAGTCACACCATGGCAATATTACCAACAAGCGCTGGAACAC GGAAACGCCCACTGCGTCACAGTCCCTCATCAAAGCCTATCTTCTGGAATGGCCCTTGCA GTGGAGATATTACTAACAGGCATGTTAGTGTGGACGAATTGTGGCGTCTGGGACCCGCGC AATAAGAAGGACAGTGATTCAGTTCCAGTTAAATTTGCTTTTCTCATTGCGGGGCTTTCA ATTGCCGGCGGGCCTATTACCGGTGCCAGTATGAATCCCGCTCGGTCCTTGGCACCTGCA ATATGGAATCATTACTACGAGGGACTTTGGATTTATTTTGCTGGACCTACGATTGGTTCC ATATTAATGGTTACAATATATCGGTATATTTTTCTTCAAAAATGTAGTGATACTTCGGAA ATGATGTCCCCATGCAATTGCCATCATGATACGGGGAAACAAGATCCTCATTCTTCTAAA ATTGTACCATAAAGTCGATCGTTACGAATACCATGTAGCCCCTATTAAAGTGTCTGCTTT TGAAGATAGCATCATTACGTCGGTGTAAGCTGTAATAAAGGCAAACCTCTTTCAGGGTAA ACAAAAGATTAGGTAAACAAACCTAGCAGCATTCAAAACTGACACGATGTGCTATCAGTA TAGGTAAATTAAGCATCGAAAATTACCCCCGTTTGTCAGCAAATTCTTTGATTGGCCTTG TTATCGGTAAAGATAAGTTGATTGTTCAGTACGCCTAGTCTGTGCAATGTCATAGTAGGC CAGTTAGCATTCTGCGTCTTTCCGACTCGGTTATTCCATTTGTGATGTATATAACGTTTC CACTCTCATAACGATTAACGCCAAAGTACCCTTATGAAGCACTGCATCCAATAAAAAAAC CAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)