cluster # 8212

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Anopheles gambiae
cluster # 8212 cluster # 8212 Sequences # 9 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8212#0 length = 935 sequences # 7

consensus_8212#1 length = 851 sequences # 1
consensus_8212#2 length = 701 sequences # 1

consensusID : consensus_8212#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 935
fasta sequence

                              [CGCCAGCTCGGGCACATGTGGCC----TTTTTTTTTTTTGTATTGATACGATTATTCTGTTATATTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCGTTGTTAACTATGTGCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGTTGTTGTTCAGCAGCTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAATGCTGTGTTTATGATCAAAGTGACTATATTTTTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCCGCCCCG]

[-] EMBL CNS09N8T             [CGCCAGCTCGGGCACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTGATACGATTATTCTGTTATATTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCGTTGTTAACTATGTGCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGTTGTTGCTCAGCAGCTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATA                                                                               ]
[-] EMBL CNS09JNR             [  CCAGCCCGAGCACATGTGGCC    TTTTTTTTTTTTGTATTGATACGATTATTCTGTTATATTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCGTTGTTAACTATGTGCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGTTGTTGTTCAGCAGCTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAATGCT TGTTTAT                                                            ]
[+] EMBL AGA283687            [                               TTTTTTTTGGATTGATACGATTATTCTGTTATATTTCGAGAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCGTTGTTAACTATGTGCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGTTGTTGTTCAACAACTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CNS09MAD             [                                                                   CGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCGTTGTTAACTATGTGCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGTTGTTGTTCAGCAGCTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTGTGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAATGCTGTGTTTATGATCAAAGTGACTATATTTTTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCCGCCCCG]
[-] EMBL BM582865             [                                                                                                                                                    CCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGTTGTTGTTCAGCAGCTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCcgg                                                                                                                ]
[-] EMBL BM582932             [                                                                                                                                                                                                                    AATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGTTGTTGTTCAGCAGCTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAATGCTGcgg                                                                ]
[-] EMBL AGA284976            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGT                                                                                                                       ]




>consensus_8212#0
CGCCAGCTCGGGCACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTGTATTGATACGATTATTCTGTTATA
TTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCG
TTGTTAACTATGTGCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAAC
TTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGAC
ATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTCTGAACGCTATACCATTGT
TGTTGTTCAGCAGCTGCCTGTTCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGT
AACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTA
GCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAAC
CCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGA
TTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGA
ATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTG
TTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCA
TCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTAT
TAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTC
AGACACCATCCAAATATCAACAATGCTGTGTTTATGATCAAAGTGACTATATTTTTCCAG
TAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCCGCCCCG

consensusID : consensus_8212#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 851
fasta sequence

                              [ATTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCGTTGTTAACTATGTTCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTGGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTTTGAACGCTATACCATTGTTGTTGCTCAGCAGCTGCCTGTCCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTGGAGTTCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCCCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAATGCTGTTTTTATCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCAGC]

[+] EMBL CNS09N8U             [ATTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCGTTGTTAACTATGTTCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAACTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTGGTCTTCGTCTTGAGACATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTTTGAACGCTATACCATTGTTGTTGCTCAGCAGCTGCCTGTCCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTGGAGTTCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCCCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAATGCTGTTTTTATCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATTCCGCAGC]




>consensus_8212#1
ATTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCC
GTTGTTAACTATGTTCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAA
CTTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTGGTCTTCGTCTTGAGA
CATTTGTTTTTGAAAAAGTTCGGCATTCTGTAGTGTAGCAGTTTGAACGCTATACCATTG
TTGTTGCTCAGCAGCTGCCTGTCCCTCACGCGCTCTAGCAAAGAGTTCTTGCTGTTGTCG
TAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCAAGGTTTTCGAGTGGAGTTCTTTGTCGCCTTCTTTT
AGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAA
CCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTTCTCTG
ATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAG
AATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCCCTTTGATTATTTT
GTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTC
ATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTA
TTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATT
CAGACACCATCCAAATATCAACAATGCTGTTTTTATCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGG
AATTCCGCAGC

consensusID : consensus_8212#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 701
fasta sequence

                              [ATGGTGTGAGAGTATGTCCATNTCCGCCGGTCGGTGCTTTCGTCTTGGAGGACAGTTTGGTTTTTGGAAAAAAGTTTCGGNCATGTTCCTGTTAGGTGTACCCAGTTTGTAACGCCTAATACCAGTTGTTGGTTTGTGTTCAGGCAGCTTGCCCTTGTTCCCTCACGCGGCTCTAGCCAAAGGAGTTTCTTGGCCCTGTTTTGTTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTGCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTGTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGATTNCCTCGGGCGAT]

[-] EMBL AL932761             [ATGGTGTGAGAGTATGTCCATNTCCGCCGGTCGGTGCTTTCGTCTTGGAGGACAGTTTGGTTTTTGGAAAAAAGTTTCGGNCATGTTCCTGTTAGGTGTACCCAGTTTGTAACGCCTAATACCAGTTGTTGGTTTGTGTTCAGGCAGCTTGCCCTTGTTCCCTCACGCGGCTCTAGCCAAAGGAGTTTCTTGGCCCTGTTTTGTTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCCAAGGTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAGCTTGCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTGTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGATTNCCTCGGGCGAT]




>consensus_8212#2
ATGGTGTGAGAGTATGTCCATNTCCGCCGGTCGGTGCTTTCGTCTTGGAGGACAGTTTGG
TTTTTGGAAAAAAGTTTCGGNCATGTTCCTGTTAGGTGTACCCAGTTTGTAACGCCTAAT
ACCAGTTGTTGGTTTGTGTTCAGGCAGCTTGCCCTTGTTCCCTCACGCGGCTCTAGCCAA
AGGAGTTTCTTGGCCCTGTTTTGTTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCCAAGGTTTT
CGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAACACAG
CTTGCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAACATGC
TCGGCATTAATTGTTTTTTTATTGTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAGCTGAT
CAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCAACTCT
TATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTTAGTTC
ATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTTCCTTT
GTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGATAATAC
GTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGATTNCCTCGGGCGAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8212#0      CGCCAGCTCGGGCACATGTGGCCTTTTTTTTTTTTGTATTGATACGATTATTCTGTTATA 60
consensus_8212#1      -----------------------------------------------------------A 1
consensus_8212#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8212#0      TTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCG 120
consensus_8212#1      TTTCGAAAATTCGGTATTTTATCTGCTTTCTTGTTTTCTTAGAAAATATTCAATGCTCCG 61
consensus_8212#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8212#0      TTGTTAACTATGTGCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAAC 180
consensus_8212#1      TTGTTAACTATGTTCACTGTTTTTCCGTTCACCAATTCTCTCTGGTCTACTCAGCGAAAC 121
consensus_8212#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8212#0      TTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTCGTCTTCGTCTTGAGAC 240
consensus_8212#1      TTTTCATGAAAGGCTAATATTTATGTTTAATATTCATCGCTGTGGTCTTCGTCTTGAGAC 181
consensus_8212#2      --ATGGTGTGAGAGTA-TGTCCATNTCCGCCGGTCGGTGCTTTCGTCTTGGAG--GACAG 55
                         *  **  **  ** * *  ** *       **   *** * ***** *    ** * 

consensus_8212#0      ATTTGTTTTTGAAAAAG---TTCGGCA----TTCTGT--AGTGTAGC-AGTCTG-AACGC 289
consensus_8212#1      ATTTGTTTTTGAAAAAG---TTCGGCA----TTCTGT--AGTGTAGC-AGTTTG-AACGC 230
consensus_8212#2      TTTGGTTTTTGGAAAAAAGTTTCGGNCATGTTCCTGTTAGGTGTACCCAGTTTGTAACGC 115
                       ** ******* ****    *****      * ****   ***** * *** ** *****

consensus_8212#0      T--ATACCA-TTGTTGTT----GTTCAG-CAGCT-GCCTGT---TCCTCACGCG-CTCTA 336
consensus_8212#1      T--ATACCA-TTGTTGTT----GCTCAG-CAGCT-GCCTGT---CCCTCACGCG-CTCTA 277
consensus_8212#2      CTAATACCAGTTGTTGGTTTGTGTTCAGGCAGCTTGCCCTTGTTCCCTCACGCGGCTCTA 175
                         ****** ****** *    * **** ***** ***  *    ********* *****

consensus_8212#0      GC--AAAGAGTT-------CTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCC-AAG 386
consensus_8212#1      GC--AAAGAGTT-------CTTGCTGTTGTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCC-AAG 327
consensus_8212#2      GCCAAAGGAGTTTCTTGGCCCTGTTTTGTTCGTAACAATTCCTCCTCGGGAATGCCCAAG 235
                      **  ** *****       * ** * *  *************************** ***

consensus_8212#0      GTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAA 446
consensus_8212#1      GTTTTCGAGTGGAGTTCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAA 387
consensus_8212#2      GTTTTCGAGTCGAGTGCTTTGTCGCCTTCTTTTAGCAGCCACCTGTTTGCAATCGTTCAA 295
                      ********** **** ********************************************

consensus_8212#0      CACAGCTT-CCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAA 505
consensus_8212#1      CACAGCTT-CCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAA 446
consensus_8212#2      CACAGCTTGCCGCTTCCTGCTTATAATCTTTGAACCCCAATCGATCGAGGGCCTCTAAAA 355
                      ******** ***************************************************

consensus_8212#0      CATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATT-TCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAG 564
consensus_8212#1      CATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATT-TCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAG 505
consensus_8212#2      CATGCTCGGCATTAATTGTTTTTTTATTGTCTCTGATTACAAACCTCATTTGCTTCCGAG 415
                      **************************** *******************************

consensus_8212#0      CTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCA 624
consensus_8212#1      CTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCA 565
consensus_8212#2      CTGATCAAATGTATGAATTCAGTGCAACAATTCAGAATCAACTCACGACTTTCATTCGCA 475
                      ************************************************************

consensus_8212#0      ACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTT 684
consensus_8212#1      ACTCTTATTGACGGTACCAGCCCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTT 625
consensus_8212#2      ACTCTTATTGACGGTACCAGCTCTTTGATTATTTTGTTGATGCTGGCTCGTGGCAACGTT 535
                      ********************* **************************************

consensus_8212#0      AGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTT 744
consensus_8212#1      AGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTT 685
consensus_8212#2      AGTTCATCGTCCTCTTGGTTCGGTGGACAAAGTTCATCATGAGGATCAGACATTTTCCTT 595
                      ************************************************************

consensus_8212#0      CCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGAT 804
consensus_8212#1      CCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGAT 745
consensus_8212#2      CCTTTGTGTTGTTAATTACTAAACAGTTATGCTTATTAGAAGAAAGGAAAACGTTAGGAT 655
                      ************************************************************

consensus_8212#0      AATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAAT 864
consensus_8212#1      AATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGAATTCAGACACCATCCAAATATCAACAAT 805
consensus_8212#2      AATACGTTAAGTTTCCATTCCTTTTCTCTTGATTNCCTCGGGCGAT-------------- 701
                      ******************************** * *      *                 

consensus_8212#0      GCTGTGTTTATGATCAAAGTGACTATATTTTTCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATT 924
consensus_8212#1      GCTGTTTTTAT---------------------CCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGAATT 844
consensus_8212#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8212#0      CCGCCGCCCCG 935
consensus_8212#1      CCGCAGC---- 851
consensus_8212#2      -----------