Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 8429 cluster # 8429       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8429#0 length = 1244 sequences # 10  

consensusID : consensus_8429#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1244
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTA-TTTCCTGGAAAATGCCGGATGCAGCAATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA-TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT-GGAC-GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA-TGCCGCTCGCGCTGGCC-TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG-GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC---------CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG-A-CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC-CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTTTCGCCTTTGTAGATTTCGTACCGCAGCTTCCGGTTGCGTTCCATTTCCGG]

[+] EMBL CNS08Q30             [TTTTTTTTTTTTTTTATTTTCCTGGAAAATGCCGGATGCAGCAATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAATTTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTTGGGACGGGACCGGTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS08KT3             [ TTTTTTTTTTTTTTA TTTGCTGGAAAATGCCGGATGCAGCAATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCGCGTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTTTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGAAAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCACCA A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACAACGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTTCTCGAGGCGCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CNS08KET             [                               CCGGATGCAGC ATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTTTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGGGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCA CGAA CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CNS08YVW             [                                        gcgccTTTGGCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGAATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCA CG ACCAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CNS08ELJ             [                                                           TTTTATTAACATTTATCTCGACGTTGTGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAAAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAACTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCA CGAA CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CNS08YVV             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCCATTGTCG TCGCGCTGGCCTTTTTCCAG TGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGATCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTT                                                  ]
[-] EMBL CNS08KES             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGCC TTTTTCCGGTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGGGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGAACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTT                                                  ]
[-] EMBL CNS08KT2             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCGCTGTAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGAACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTCTCTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTT                                                  ]
[-] EMBL BX627876             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGTCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCGACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGTACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGCCTGCTTGCGCTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTCTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCAC                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BM591583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC         CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTTTCGCCTTTGTAGATTTCGTACCGCAGCTTCCGGTTGCGTTCCATTTCCGG]


>consensus_8429#0 TTTTTTTTTTTTTTTATTTCCTGGAAAATGCCGGATGCAGCAATTTTCCCATCTTCTTTT TTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAATTACTAGCG ATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGC GACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTTGGACGGACCGGTG GAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTT TGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCATGCCGCTCGCGCTGGCCTTTTCCAGCTGGCGCTGT TCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCG CGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCGG TGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCC ATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTG TAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATT TCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGCCTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGC TGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCGACAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCC AGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACA TCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTG TCCTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGC AGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCC TTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCG TACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGA TCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTTTCGCCT TTGTAGATTTCGTACCGCAGCTTCCGGTTGCGTTCCATTTCCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)