These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8464#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 535 fasta sequence [CCGTAATTTTTGAAAGAAGTATACTTTATTTAATTATTTTATATTTTTAATAATTATTAAAATAGTTTATATATTTTTATTAAAATAATTTTATTTTTTATTAAATTTTAAATTTAATTTATAATTATTTAATGTTAATAAGATTATTTTATTCTAGTTAAATAT-TTTATTAT-TATTT-TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGT-TAAATTGTTTATAATTATTTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATTATTAAAATGTA-GATTAATTTAAGCTATAAAAATTTTATAATAAACTAGGATTAGATACCCTATTATTAAAATTAAATATATAAGAATACTTAAGTAGTATTAG] [+] EMBL BM592294 [CCGTAATTTTTGAAAGAAGTATACTTTATTTAATTATTTTATATTTTTAATAATTATTAAAATAGTTTATATATTTTTATTAAAATAATTTTATTTTTTATTAAATTTTAAATTTAATTTATAATTATTTAATGTTAATAAGATTATTTTATTCTAGTTAAATAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGTCTAAATTGTTTATAATTATTTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATTATTAAAATGGA GATTAATTTAAGCTATAAAAATTTTATAATAAACTAGGATTAGATACCCTATTATTAAAATTAAATATATA ] [+] EMBL BM579511 [ TTATTTAATGTTAATAAGATTATTTTATTCTAGTCAAATAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAACCTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATACCAATTTTTAGTATTAGT TAAATTGTTTATAATTATTTAATTCATACATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATCATTAAAATGTA GATTAATTTAA ] [+] EMBL BM596991 [ ccgGTTAAATAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGT TAAATTGTTTATAATTATTTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATTATTAAAATGTA GATTAATTTAAGCTATAAAAATTTTATAATAAA ] [+] EMBL BM639028 [ ccgGTTAAATAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTAT ] [+] EMBL BM630587 [ ccgTAAATAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGT TAAATTGTTTATAATTATTTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATTATTAAAATGTA GATTAATTTAAGCTATAAAAATTTTATAATAAACTAGGAT ] [+] EMBL BM624396 [ ccgTAAATAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGT TAAATTGTTTATAATTATTTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATTATTAAAATGTA GATTAATTTAAGCTATAAAAATTTTATAATAAACTAGGATTAGATACCCTATTATTAAAATTAAATATATAAGAATACTTAAGTAGTATTAG] [+] EMBL BM592286 [ ccgAAGTATATTTATTATGTATTTGTATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGC CAAATTGTTTATAATTATTTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATTATTAAAATGTACCATTAATTTAAGCTATAAAAATTTTATAATAAACTAGGATTAGATACCCTATTATTAAAATTAAATATATAAGAATACTTAAG ] [+] EMBL BM583410 [ ccgAAATAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGTAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGT TAAATTGTTTATAATTATTTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAAATTTATTTATTATTAAAATGTA GATTAATTTAAGCTATAAAAATTTTATAATAAACTAGGATTAGATACCCTATTATTAAAATTAAATATATAAGAATACTTAAGT ] [+] EMBL BM618370 [ ccgAT TTTATTAT TATTT TATTTTACATGTAAATTTTTGTGTGAATTTTTATTAATTTTAAAAATTAATAATTTTTAATTTATTCGCAGGAATTAATATTAATTATAAAAGAAATTTTGAATTAGTAATAATATATAGTATTGGTAAAATTTGTGCCAGCTACTGCGGTTATACAAATGATGCAAATAAAAATTTTTAGTATTAGT TAAATTGTTTATAATTAT ] [+] EMBL BM623440 [ TTAGTATTAGT TAAATTGTTAATAATTATGTAATTTATATATAAATTTATTAGGTGAAATTTTTAGAGTTATTTATTATTAAAATGAA GATTAATTTGAGCTATAAAAATTTTATAATAAACTAGGATTAGATACCCGATTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||